RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
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PTPRT-209ENST00000612229 DCAF8L2P0C7V8 631 aa11.08□□□□□ -0.64
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PTPRT-209ENST00000612229 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
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PTPRT-209ENST00000612229 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
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PTPRT-209ENST00000612229 NBR1Q14596 966 aa9.32□□□□□ -0.92
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PTPRT-209ENST00000612229 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC136Q96JN2 1154 aa9.28□□□□□ -0.92
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PTPRT-209ENST00000612229 BECN1Q14457 450 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRT-209ENST00000612229 NRDCO43847 1150 aa9.26□□□□□ -0.93
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PTPRT-209ENST00000612229 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP9.25□□□□□ -0.93
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PTPRT-209ENST00000612229 USP35Q9P2H5 1018 aa9.24□□□□□ -0.93
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PTPRT-209ENST00000612229 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
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PTPRT-209ENST00000612229 CFAP44Q96MT7 982 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-209ENST00000612229 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-209ENST00000612229 PTMAP06454 111 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
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PTPRT-209ENST00000612229 PTMSP20962 102 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-209ENST00000612229 MRS2Q9HD23 443 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-209ENST00000612229 CSRNP3Q8WYN3 585 aa9.08□□□□□ -0.96
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