RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 ACYP2P14621 99 aa5.83□□□□□ -1.48
HCG18-242ENST00000602319 DNAH17Q9UFH2 4485 aa5.83□□□□□ -1.48
HCG18-242ENST00000602319 K7EIL1 84 aa5.82□□□□□ -1.48
HCG18-242ENST00000602319 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.82□□□□□ -1.48
HCG18-242ENST00000602319 APLNQ9ULZ1 77 aa5.82□□□□□ -1.48
HCG18-242ENST00000602319 RTL8CO15255 209 aa5.82□□□□□ -1.48
HCG18-242ENST00000602319 FAM229AH3BQW9 127 aa5.81□□□□□ -1.48
HCG18-242ENST00000602319 C8orf87E5RJ46 101 aa5.81□□□□□ -1.48
HCG18-242ENST00000602319 CDK2AP2O75956 126 aa5.8□□□□□ -1.48
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa5.79□□□□□ -1.48
HCG18-242ENST00000602319 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
HCG18-242ENST00000602319 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
HCG18-242ENST00000602319 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa5.77□□□□□ -1.48
HCG18-242ENST00000602319 ATRQ13535 2644 aa5.77□□□□□ -1.49
HCG18-242ENST00000602319 BAHCC1Q9P281 2608 aa5.75□□□□□ -1.49
HCG18-242ENST00000602319 FASNP49327 2511 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
HCG18-242ENST00000602319 ZNF861PO60384 105 aa5.74□□□□□ -1.49
HCG18-242ENST00000602319 PRAC1Q96KF2 57 aa5.74□□□□□ -1.49
HCG18-242ENST00000602319 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa5.74□□□□□ -1.49
HCG18-242ENST00000602319 IGKV2-30P06310 120 aa5.74□□□□□ -1.49
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa5.74□□□□□ -1.49
HCG18-242ENST00000602319 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.74□□□□□ -1.49
HCG18-242ENST00000602319 HECTD1Q9ULT8 2610 aa5.74□□□□□ -1.49
HCG18-242ENST00000602319 MAST4O15021 2626 aa5.73□□□□□ -1.49
HCG18-242ENST00000602319 F8P00451 2351 aa5.73□□□□□ -1.49
HCG18-242ENST00000602319 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.73□□□□□ -1.49
HCG18-242ENST00000602319 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa5.73□□□□□ -1.49
HCG18-242ENST00000602319 A0A1B0GU69 56 aa5.72□□□□□ -1.49
HCG18-242ENST00000602319 DNAH6Q9C0G6 4158 aa5.72□□□□□ -1.49
HCG18-242ENST00000602319 DNAH2Q9P225 4427 aa5.71□□□□□ -1.49
HCG18-242ENST00000602319 LINC01554Q52M75 96 aa5.71□□□□□ -1.5
HCG18-242ENST00000602319 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.7□□□□□ -1.5
HCG18-242ENST00000602319 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
HCG18-242ENST00000602319 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.69□□□□□ -1.5
HCG18-242ENST00000602319 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.69□□□□□ -1.5
HCG18-242ENST00000602319 UQCR11O14957 56 aa5.68□□□□□ -1.5
HCG18-242ENST00000602319 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.66□□□□□ -1.5
HCG18-242ENST00000602319 A0A087WTM6 91 aa5.66□□□□□ -1.5
HCG18-242ENST00000602319 STARD9Q9P2P6 4700 aa5.65□□□□□ -1.51
HCG18-242ENST00000602319 DNAH11Q96DT5 4516 aa5.64□□□□□ -1.51
HCG18-242ENST00000602319 COL7A1Q02388 2944 aa5.64□□□□□ -1.51
HCG18-242ENST00000602319 IGLV7-43P04211 117 aa5.64□□□□□ -1.51
HCG18-242ENST00000602319 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.64□□□□□ -1.51
HCG18-242ENST00000602319 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.62□□□□□ -1.51
HCG18-242ENST00000602319 H3BS24 57 aa5.61□□□□□ -1.51
HCG18-242ENST00000602319 FBN3Q75N90 2809 aa5.61□□□□□ -1.51
HCG18-242ENST00000602319 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa5.6□□□□□ -1.51
HCG18-242ENST00000602319 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.6□□□□□ -1.51
HCG18-242ENST00000602319 DNAH5Q8TE73 4624 aa5.6□□□□□ -1.51
HCG18-242ENST00000602319 NUPR2A6NF83 97 aa5.59□□□□□ -1.51
HCG18-242ENST00000602319 KMT2AQ03164 3969 aa5.57□□□□□ -1.52
HCG18-242ENST00000602319 CSAG1Q6PB30 78 aa5.56□□□□□ -1.52
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.56□□□□□ -1.52
HCG18-242ENST00000602319 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa5.53□□□□□ -1.52
HCG18-242ENST00000602319 A8MUU9 505 aa5.53□□□□□ -1.52
HCG18-242ENST00000602319 LY6G6CO95867 125 aa5.51□□□□□ -1.53
HCG18-242ENST00000602319 SACSQ9NZJ4 4579 aa5.51□□□□□ -1.53
HCG18-242ENST00000602319 PKD1P98161 4303 aa5.5□□□□□ -1.53
HCG18-242ENST00000602319 STAB1Q9NY15 2570 aa5.49□□□□□ -1.53
HCG18-242ENST00000602319 H0YAA0 97 aa5.49□□□□□ -1.53
HCG18-242ENST00000602319 Q6ZSA8 131 aa5.48□□□□□ -1.53
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.47□□□□□ -1.53
HCG18-242ENST00000602319 NOTCH1P46531 2555 aa5.46□□□□□ -1.53
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.46□□□□□ -1.54
HCG18-242ENST00000602319 STAB2Q8WWQ8 2551 aa5.45□□□□□ -1.54
HCG18-242ENST00000602319 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa5.44□□□□□ -1.54
HCG18-242ENST00000602319 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.44□□□□□ -1.54
HCG18-242ENST00000602319 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.44□□□□□ -1.54
HCG18-242ENST00000602319 COL6A5A8TX70 2615 aa5.43□□□□□ -1.54
HCG18-242ENST00000602319 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.43□□□□□ -1.54
HCG18-242ENST00000602319 LCE2BO14633 110 aa5.43□□□□□ -1.54
HCG18-242ENST00000602319 FAT2Q9NYQ8 4349 aa5.42□□□□□ -1.54
HCG18-242ENST00000602319 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.41□□□□□ -1.54
HCG18-242ENST00000602319 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
HCG18-242ENST00000602319 C1orf134Q5TEV5 83 aa5.4□□□□□ -1.55
HCG18-242ENST00000602319 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.4□□□□□ -1.55
HCG18-242ENST00000602319 Q8N1X5 172 aa5.39□□□□□ -1.55
HCG18-242ENST00000602319 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.38□□□□□ -1.55
HCG18-242ENST00000602319 SPINK1P00995 79 aa5.38□□□□□ -1.55
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.38□□□□□ -1.55
HCG18-242ENST00000602319 ROMO1P60602 79 aa5.36□□□□□ -1.55
HCG18-242ENST00000602319 A0A1B0GU33 70 aa5.35□□□□□ -1.55
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP10-2P60368 255 aa5.35□□□□□ -1.55
HCG18-242ENST00000602319 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.34□□□□□ -1.55
HCG18-242ENST00000602319 LCE2CQ5TA81 110 aa5.33□□□□□ -1.56
HCG18-242ENST00000602319 TGP01266 2768 aa5.33□□□□□ -1.56
HCG18-242ENST00000602319 PKHD1P08F94 4074 aa5.32□□□□□ -1.56
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP10-1P60331 282 aa5.3□□□□□ -1.56
HCG18-242ENST00000602319 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
HCG18-242ENST00000602319 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.25□□□□□ -1.57
HCG18-242ENST00000602319 HYDINQ4G0P3 5121 aa5.24□□□□□ -1.57
HCG18-242ENST00000602319 P0C880 135 aa5.23□□□□□ -1.57
HCG18-242ENST00000602319 MGAM2Q2M2H8 2515 aa5.2□□□□□ -1.58
HCG18-242ENST00000602319 K7ERS5 55 aa5.2□□□□□ -1.58
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
HCG18-242ENST00000602319 TNXBP22105 4242 aa5.18□□□□□ -1.58
HCG18-242ENST00000602319 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
HCG18-242ENST00000602319 HSPG2P98160 4391 aa5.16□□□□□ -1.58
HCG18-242ENST00000602319 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.1 ms