RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484396.1

ACSS1-204, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACSS1, Length 4,767 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS1-204ENST00000484396 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
ACSS1-204ENST00000484396 Q5VSD8 79 aa7.49□□□□□ -1.21
ACSS1-204ENST00000484396 DMXL1Q9Y485 3027 aa7.49□□□□□ -1.21
ACSS1-204ENST00000484396 KRTAP10-1P60331 282 aa7.48□□□□□ -1.21
ACSS1-204ENST00000484396 KRTAP10-2P60368 255 aa7.48□□□□□ -1.21
ACSS1-204ENST00000484396 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.47□□□□□ -1.21
ACSS1-204ENST00000484396 FREM2Q5SZK8 3169 aa7.46□□□□□ -1.22
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ACSS1-204ENST00000484396 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa7.44□□□□□ -1.22
ACSS1-204ENST00000484396 Q6ZSA8 131 aa7.43□□□□□ -1.22
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ACSS1-204ENST00000484396 P0C880 135 aa7.32□□□□□ -1.24
ACSS1-204ENST00000484396 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.31□□□□□ -1.24
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ACSS1-204ENST00000484396 H0YAA0 97 aa7.21□□□□□ -1.26
ACSS1-204ENST00000484396 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
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ACSS1-204ENST00000484396 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.04□□□□□ -1.28
ACSS1-204ENST00000484396 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.99□□□□□ -1.29
ACSS1-204ENST00000484396 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.99□□□□□ -1.29
ACSS1-204ENST00000484396 TENM2Q9NT68 2774 aa6.99□□□□□ -1.29
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ACSS1-204ENST00000484396 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.95□□□□□ -1.3
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ACSS1-204ENST00000484396 TPRXLQ17RH7 258 aa6.93□□□□□ -1.3
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ACSS1-204ENST00000484396 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.85□□□□□ -1.31
ACSS1-204ENST00000484396 RELNP78509 3460 aa6.84□□□□□ -1.31
ACSS1-204ENST00000484396 KRTAP10-8P60410 259 aa6.81□□□□□ -1.32
ACSS1-204ENST00000484396 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.81□□□□□ -1.32
ACSS1-204ENST00000484396 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.79□□□□□ -1.32
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ACSS1-204ENST00000484396 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.73□□□□□ -1.33
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ACSS1-204ENST00000484396 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.68□□□□□ -1.34
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ACSS1-204ENST00000484396 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa6.62□□□□□ -1.35
ACSS1-204ENST00000484396 A0A1B0GVY2 172 aa6.61□□□□□ -1.35
ACSS1-204ENST00000484396 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.6□□□□□ -1.35
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ACSS1-204ENST00000484396 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
ACSS1-204ENST00000484396 ASPMQ8IZT6 3477 aa6.53□□□□□ -1.36
ACSS1-204ENST00000484396 KRTAP12-2P59991 146 aa6.5□□□□□ -1.37
ACSS1-204ENST00000484396 DMDP11532 3685 aa6.48□□□□□ -1.37
ACSS1-204ENST00000484396 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
ACSS1-204ENST00000484396 KRTAP12-1P59990 96 aa6.4□□□□□ -1.39
ACSS1-204ENST00000484396 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.39□□□□□ -1.39
ACSS1-204ENST00000484396 ZFHX4Q86UP3 3567 aa6.37□□□□□ -1.39
ACSS1-204ENST00000484396 FBN3Q75N90 2809 aa6.36□□□□□ -1.39
ACSS1-204ENST00000484396 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.34□□□□□ -1.39
ACSS1-204ENST00000484396 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.3□□□□□ -1.4
ACSS1-204ENST00000484396 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ACSS1-204ENST00000484396 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.28□□□□□ -1.4
ACSS1-204ENST00000484396 KRTAP10-10P60014 251 aa6.26□□□□□ -1.41
ACSS1-204ENST00000484396 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
ACSS1-204ENST00000484396 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.18□□□□□ -1.42
ACSS1-204ENST00000484396 COL7A1Q02388 2944 aa6.17□□□□□ -1.42
ACSS1-204ENST00000484396 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.15□□□□□ -1.42
ACSS1-204ENST00000484396 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.14□□□□□ -1.43
ACSS1-204ENST00000484396 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
ACSS1-204ENST00000484396 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.05□□□□□ -1.44
ACSS1-204ENST00000484396 MT1HL1P0DM35 61 aa6.02□□□□□ -1.45
ACSS1-204ENST00000484396 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.97□□□□□ -1.45
ACSS1-204ENST00000484396 BSNQ9UPA5 3926 aa5.95□□□□□ -1.46
ACSS1-204ENST00000484396 CUBNO60494 3623 aa5.95□□□□□ -1.46
ACSS1-204ENST00000484396 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.94□□□□□ -1.46
ACSS1-204ENST00000484396 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
ACSS1-204ENST00000484396 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
ACSS1-204ENST00000484396 DNHD1Q96M86 4753 aa5.8□□□□□ -1.48
ACSS1-204ENST00000484396 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.76□□□□□ -1.49
ACSS1-204ENST00000484396 DNAH9Q9NYC9 4486 aa5.65□□□□□ -1.5
ACSS1-204ENST00000484396 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5.65□□□□□ -1.5
ACSS1-204ENST00000484396 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
ACSS1-204ENST00000484396 AKAP9Q99996 3911 aa5.62□□□□□ -1.51
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