RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 RABAC1Q9UI14 185 aa-1.69□□□□□ -2.68
PRPF40A-208ENST00000472760 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP-1.69□□□□□ -2.68
PRPF40A-208ENST00000472760 MYO18BQ8IUG5 2567 aa-1.69□□□□□ -2.68
PRPF40A-208ENST00000472760 K7EP34 96 aa-1.7□□□□□ -2.68
PRPF40A-208ENST00000472760 CCNB3Q8WWL7 1395 aa-1.71□□□□□ -2.68
PRPF40A-208ENST00000472760 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP-1.71□□□□□ -2.68
PRPF40A-208ENST00000472760 NCOA2Q15596 1464 aa-1.71□□□□□ -2.68
PRPF40A-208ENST00000472760 LAMA1P25391 3075 aa-1.71□□□□□ -2.68
PRPF40A-208ENST00000472760 SCN11AQ9UI33 1791 aa-1.72□□□□□ -2.68
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PRPF40A-208ENST00000472760 ZZEF1O43149 2961 aa-1.73□□□□□ -2.69
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PRPF40A-208ENST00000472760 ACYP1P07311 99 aa-1.74□□□□□ -2.69
PRPF40A-208ENST00000472760 ABCC3O15438 1527 aa-1.75□□□□□ -2.69
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PRPF40A-208ENST00000472760 DEFA5Q01523 94 aa-1.77□□□□□ -2.69
PRPF40A-208ENST00000472760 DEPDC5O75140 1603 aa-1.77□□□□□ -2.69
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PRPF40A-208ENST00000472760 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa-1.78□□□□□ -2.69
PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF831Q5JPB2 1677 aa-1.79□□□□□ -2.7
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PRPF40A-208ENST00000472760 DNAH2Q9P225 4427 aa-1.8□□□□□ -2.7
PRPF40A-208ENST00000472760 MAP3K1Q13233 1512 aa-1.81□□□□□ -2.7
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PRPF40A-208ENST00000472760 KIF14Q15058 1648 aa-1.81□□□□□ -2.7
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PRPF40A-208ENST00000472760 DIP2BQ9P265 1576 aa-1.82□□□□□ -2.7
PRPF40A-208ENST00000472760 DNAH11Q96DT5 4516 aa-1.83□□□□□ -2.7
PRPF40A-208ENST00000472760 MTORP42345 2549 aa-1.83□□□□□ -2.7
PRPF40A-208ENST00000472760 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa-1.83□□□□□ -2.7
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PRPF40A-208ENST00000472760 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa-2□□□□□ -2.73
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PRPF40A-208ENST00000472760 PKD1L2Q7Z442 2459 aa-2.02□□□□□ -2.73
PRPF40A-208ENST00000472760 FAM186AA6NE01 2351 aa-2.03□□□□□ -2.73
PRPF40A-208ENST00000472760 CEP290O15078 2479 aa-2.03□□□□□ -2.73
PRPF40A-208ENST00000472760 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP-2.03□□□□□ -2.73
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PRPF40A-208ENST00000472760 CFAP43Q8NDM7 1665 aa-2.05□□□□□ -2.74
PRPF40A-208ENST00000472760 ST20Q9HBF5 79 aa-2.05□□□□□ -2.74
PRPF40A-208ENST00000472760 ITSN1Q15811 1721 aa-2.05□□□□□ -2.74
PRPF40A-208ENST00000472760 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP-2.05□□□□□ -2.74
PRPF40A-208ENST00000472760 ADIRFQ15847 76 aa-2.06□□□□□ -2.74
PRPF40A-208ENST00000472760 DEFB121Q5J5C9 76 aa-2.06□□□□□ -2.74
PRPF40A-208ENST00000472760 RICTORQ6R327 1708 aa-2.06□□□□□ -2.74
PRPF40A-208ENST00000472760 TRIOO75962 3097 aa-2.06□□□□□ -2.74
PRPF40A-208ENST00000472760 COL12A1Q99715 3063 aa-2.09□□□□□ -2.74
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