RNA–Protein interactions for RNA: YPR094W

RDS3, Transcript of Component of the SF3b subcomplex of the U2 snRNP, yeastyeast

Gene RDS3, Length 324 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3YPR094W RAD33Q04231 177 aa0.57□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W FMP42Q04991 504 aa0.57□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W TLG2Q08144 397 aa0.57□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W GSH2Q08220 491 aa0.57□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W GET3Q12154 354 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W AAC1P04710 309 aa0.56□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W SRD1P09007 221 aa0.56□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W ILS1P09436 1072 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W HMG1P12683 1054 aa0.56□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W CNA1P23287 553 aa0.56□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W MEF1P25039 761 aa0.56□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W ERV46P39727 415 aa0.56□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W YEL025CP39991 1188 aa0.56□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W DOT6P40059 670 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W LRO1P40345 661 aa0.56□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W UBP7P40453 1071 aa0.56□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W HUL5P53119 910 aa0.56□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W YMR210WQ03649 449 aa0.56□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W ATG33Q06485 197 aa0.56□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W RRI1Q12468 440 aa0.56□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W YOR131CQ12486 218 aa0.56□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W YER175W-AQ8TGU4 54 aa0.56□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W MDM12Q92328 271 aa0.56□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W RTC1Q08281 1341 aa0.56□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W ERR1P0CX10 437 aa0.55□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W ERR2P0CX11 437 aa0.55□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W LDB16P25587 256 aa0.55□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W CPR3P25719 182 aa0.55□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W GDA1P32621 518 aa0.55□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W AVT5P38176 459 aa0.55□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W RKM3P38222 552 aa0.55□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W YHR218WP38899 603 aa0.55□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W QRI7P43122 407 aa0.55□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W YDL183CP48569 320 aa0.55□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W CRZ1P53968 678 aa0.55□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W ACS1Q01574 713 aa0.55□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W HLR1Q04429 423 aa0.55□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W GPN2Q08726 347 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W CSR2Q12734 1121 aa0.55□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W Q0010Q9ZZX9 128 aa0.55□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W YML002WP0CF17 737 aa0.54□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W GAL11P19659 1081 aa0.54□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W RRP43P25359 394 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W GSH1P32477 678 aa0.54□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W MTC7P32633 139 aa0.54□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W HES1P35843 434 aa0.54□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W SWH1P35845 1188 aa0.54□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W YKR075CP36155 307 aa0.54□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W MAL31P38156 614 aa0.54□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W PCM1P38628 557 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W BZZ1P38822 633 aa0.54□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W DSS1P39112 969 aa0.54□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W PCL6P40038 420 aa0.54□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W PRM2P40534 656 aa0.54□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W MKT1P40850 830 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W YJL107CP42947 387 aa0.54□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W TAF4P50105 388 aa0.54□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W YNL144CP53907 740 aa0.54□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W YLR281CQ05863 155 aa0.54□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W RAD34Q06665 692 aa0.54□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W YOR389WQ08912 624 aa0.54□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W APL5Q08951 932 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W LYS21Q12122 440 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W GIN4Q12263 1142 aa0.54□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W YBR298C-AQ8TGK4 73 aa0.54□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W RPS17AP02407 136 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W PCK1P10963 549 aa0.53□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W GLN4P13188 809 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W RPS17BP14127 136 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W VPS33P20795 691 aa0.53□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W PCL2P25693 308 aa0.53□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W SFP1P32432 683 aa0.53□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W CDC5P32562 705 aa0.53□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W NIC96P34077 839 aa0.53□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W KES1P35844 434 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W MNN2P38069 597 aa0.53□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W EFM2P38347 419 aa0.53□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W RAD26P40352 1085 aa0.53□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W YJL070CP40361 888 aa0.53□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W ASG1P40467 964 aa0.53□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W SPG5P42933 373 aa0.53□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W CIR1P42940 261 aa0.53□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W CUL3P53202 744 aa0.53□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W NOP15P53927 220 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W YNL058CP53947 316 aa0.53□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W YML119WQ03208 357 aa0.53□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W PPN1Q04119 674 aa0.53□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W YCG1Q06680 1035 aa0.53□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W YLR112WQ12130 139 aa0.53□□□□□ -2.32
RDS3YPR094W SWI6P09959 803 aa0.52□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W PMS1P14242 873 aa0.52□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W CBS2P14905 389 aa0.52□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W HNM1P19807 563 aa0.52□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W SFL1P20134 766 aa0.52□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W AMD2P22580 549 aa0.52□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W GSY1P23337 708 aa0.52□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W MTC6P38849 526 aa0.52□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W VPS41P38959 992 aa0.52□□□□□ -2.33
RDS3YPR094W YJL193WP39542 402 aa0.52□□□□□ -2.33
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