RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	YFL052W	P43551	465 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	YJR039W	P47107	1121 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	NPY1	P53164	384 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	SSY1	Q03770	852 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	CSM3	Q04659	317 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	CRR1	Q05790	422 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	ADY4	Q05955	493 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	MLH2	Q07980	695 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	SIL1	Q08199	421 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	ENA1	P13587	1091 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	TFC4	P33339	1025 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	KAE1	P36132	386 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	RET2	P43621	546 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	HXT16	P47185	567 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	CBK1	P53894	756 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	ENA2	Q01896	1091 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	YKR011C	Q02209	353 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	URH1	Q04179	340 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	YPR078C	Q06813	372 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	ENA5	Q12691	1091 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	YLR464W	P0CX17	216 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.97	□□□□□ -1.45	not detected
PSH1	YOL054W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	YEL076C	P39971	216 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	SDS3	P40505	327 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	ASE1	P50275	885 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	KAP114	P53067	1004 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	YGR012W	P53206	393 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	YGR021W	P53212	290 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	TOF1	P53840	1238 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	YML119W	Q03208	357 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	YDR338C	Q05497	695 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	ECI1	Q05871	280 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	TCO89	Q08921	799 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	YPL277C	Q08989	487 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	YOR022C	Q12204	715 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	YLR122C	Q12312	125 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	SMC6	Q12749	1114 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	ATP4	P05626	244 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	ERG11	P10614	530 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	PMR1	P13586	950 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	PLC1	P32383	869 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	UBP5	P39944	805 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	ZRG8	P40021	1076 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	MRX1	P40050	688 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	PEA2	P40091	420 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	TOS3	P43637	560 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	SEC5	P89102	971 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	VPS72	Q03388	795 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	MSC2	Q03455	724 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	FUS2	Q05670	677 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	IRC3	Q06683	689 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	SDH5	Q08230	162 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	YPL216W	Q08964	1102 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	ZRT2	Q12436	422 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	KAR1	P11927	433 aa		5.95	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	RPD3	P32561	433 aa		5.95	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	XRS2	P33301	854 aa		5.95	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	SWH1	P35845	1188 aa		5.95	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	OAF3	P36023	863 aa		5.95	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	JNM1	P36224	373 aa		5.95	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	TOS1	P38288	455 aa		5.95	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	RCK2	P38623	610 aa		5.95	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	GSC2	P40989	1895 aa		5.95	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	RPC17	P47076	161 aa		5.95	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	BFA1	P47113	574 aa		5.95	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	INP52	P50942	1183 aa		5.95	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	SIZ1	Q04195	904 aa		5.95	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	SKG3	Q06315	1026 aa		5.95	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	YOR378W	Q08902	515 aa		5.95	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	PRE8	P23639	250 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	NIP100	P33420	868 aa		5.94	□□□□□ -1.46

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