RNA–Protein interactions for RNA: YHR016C

YSC84, Transcript of Actin-binding protein, yeast

Gene YSC84, Length 1,407 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YSC84	YHR016C	TVP15	Q03860	143 aa		12.02	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	SND1	Q04007	877 aa		12.02	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	FMP25	Q08023	583 aa		12.02	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	MDM38	Q08179	573 aa		12.02	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	YPR202W	Q08993	238 aa		12.02	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	RUP1	Q12242	671 aa		12.02	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	NKP1	Q12493	238 aa		12.02	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	YAK1	P14680	807 aa		12.01	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	AMS1	P22855	1083 aa		12.01	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	URA10	P30402	227 aa		12.01	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	CYM1	P32898	989 aa		12.01	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	RRN3	P36070	627 aa		12.01	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	CTP1	P38152	299 aa		12.01	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	LYS9	P38999	446 aa		12.01	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	STL1	P39932	569 aa		12.01	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	SKP2	P42843	763 aa		12.01	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	YJR054W	P47114	497 aa		12.01	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	YDR476C	Q03362	224 aa		12.01	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	THI21	Q08975	551 aa		12.01	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	STB3	Q12427	513 aa		12.01	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	YOR131C	Q12486	218 aa		12.01	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		12.01	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	CDC27	P38042	758 aa		12	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	YFL012W	P43580	148 aa		12	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	SAD1	P43589	448 aa		12	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	HST2	P53686	357 aa		12	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	YMR209C	Q03648	457 aa		12	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	RKM2	Q03942	479 aa		12	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	TPO1	Q07824	586 aa		12	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	KCS1	Q12494	1050 aa		12	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	MPH2	P0CD99	609 aa		11.99	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	WHI2	P12611	486 aa		11.99	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	FRE1	P32791	686 aa		11.99	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	PHO89	P38361	574 aa		11.99	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	TDA11	P38854	504 aa		11.99	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	GEM1	P39722	662 aa		11.99	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	AVT2	P39981	480 aa		11.99	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	RFX1	P48743	811 aa		11.99	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	TAF3	Q12297	353 aa		11.99	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	ERR1	P0CX10	437 aa		11.98	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	ERR2	P0CX11	437 aa		11.98	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	PAH1	P32567	862 aa		11.98	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	AFG3	P39925	761 aa		11.98	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	MAM33	P40513	266 aa		11.98	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	ERR3	P42222	437 aa		11.98	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	VTC4	P47075	721 aa		11.98	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	NMA2	P53204	395 aa		11.98	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	BCP1	Q06338	283 aa		11.98	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	CDD1	Q06549	142 aa		11.98	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		11.98	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	URA4	P20051	364 aa		11.97	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	MEF1	P25039	761 aa		11.97	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	GID7	P25569	745 aa		11.97	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	AGP2	P38090	596 aa		11.97	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	HOS4	P40480	1083 aa		11.97	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	MSC2	Q03455	724 aa		11.97	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	YML020W	Q03722	664 aa		11.97	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	YIG1	Q08956	461 aa		11.97	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	SPR1	P32603	445 aa		11.96	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	HSL7	P38274	827 aa		11.96	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	BEM4	P39011	633 aa		11.96	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	NUP84	P52891	726 aa		11.96	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	YGR016W	P53209	190 aa		11.96	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	VPS62	P53285	467 aa		11.96	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	YNL058C	P53947	316 aa		11.96	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	ATG11	Q12527	1178 aa		11.96	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	RGS2	Q99188	309 aa		11.96	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
YSC84	YHR016C	GLN3	P18494	730 aa		11.95	□□□□□ -0.5
YSC84	YHR016C	AIM18	P38884	321 aa		11.95	□□□□□ -0.5
YSC84	YHR016C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
YSC84	YHR016C	DSE1	P40077	573 aa		11.95	□□□□□ -0.5
YSC84	YHR016C	RRT5	P43607	289 aa		11.95	□□□□□ -0.5
YSC84	YHR016C	IML2	P47031	731 aa		11.95	□□□□□ -0.5
YSC84	YHR016C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
YSC84	YHR016C	SLG1	P54867	378 aa		11.95	□□□□□ -0.5
YSC84	YHR016C	TAF11	Q04226	346 aa		11.95	□□□□□ -0.5
YSC84	YHR016C	PHA2	P32452	334 aa		11.94	□□□□□ -0.5
YSC84	YHR016C	UTR2	P32623	467 aa		11.94	□□□□□ -0.5

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