RNA–Protein interactions for RNA: YDL093W

PMT5, Transcript of Protein O-mannosyltransferase, yeast

Gene PMT5, Length 2,232 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PMT5	YDL093W	VPS9	P54787	451 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	YMR155W	Q03795	547 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	MFB1	Q04922	465 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	YLR346C	Q06139	101 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	DBF4	P32325	704 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	IMA1	P53051	589 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	ZDS2	P54786	942 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	RAD33	Q04231	177 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	TRI1	Q05024	226 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	CKA1	P15790	372 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	APN1	P22936	367 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	MTC7	P32633	139 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	YPT7	P32939	208 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	YKR075C	P36155	307 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	ALG14	P38242	237 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	PCL7	P40186	285 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	YMR210W	Q03649	449 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	YLR345W	Q06137	509 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	SWA2	Q06677	668 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	SVS1	Q12254	260 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	HSF1	P10961	833 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	BIK1	P11709	440 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	DAL80	P26343	269 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	CTF13	P35203	478 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	RTT105	P40063	208 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	LYS14	P40971	790 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	SEC5	P89102	971 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	ARP9	Q05123	467 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	ASM4	Q05166	528 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	YPR172W	Q06608	200 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	PMS1	P14242	873 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	LTP1	P40347	161 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	CIT3	P43635	486 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	YJL055W	P47044	245 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	PEF1	P53238	335 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	YCG1	Q06680	1035 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	CDA1	Q06702	301 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	AAD4	Q07747	329 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	PLP2	Q12017	286 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	CEM1	P39525	442 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	FMP10	P40098	244 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	YJL068C	P40363	299 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	POL31	P46957	487 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	SHE10	P53075	577 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	PCD1	Q12524	340 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	PET123	P17558	318 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	MNE1	P24720	663 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	ROX1	P25042	368 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	MDL1	P33310	695 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.16	□□□□□ -1.58	not detected
PMT5	YDL093W	RSB1	Q08417	382 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	MET17	P06106	444 aa		5.15	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	RIT1	P23796	513 aa		5.15	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	CWH43	P25618	953 aa		5.15	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	TRK2	P28584	889 aa		5.15	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	SWC3	P31376	625 aa		5.15	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	NIP100	P33420	868 aa		5.15	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	PRM2	P40534	656 aa		5.15	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	BST1	P43571	1029 aa		5.15	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	EXG2	P52911	562 aa		5.15	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	YVC1	Q12324	675 aa		5.15	□□□□□ -1.58
PMT5	YDL093W	URA3	P03962	267 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PMT5	YDL093W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
PMT5	YDL093W	RIB7	P33312	244 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PMT5	YDL093W	APN2	P38207	520 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PMT5	YDL093W	YHL012W	P38709	493 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PMT5	YDL093W	CTF8	P38877	133 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PMT5	YDL093W	BUD8	P41698	603 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PMT5	YDL093W	CIR1	P42940	261 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PMT5	YDL093W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
PMT5	YDL093W	SSY5	P47002	699 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PMT5	YDL093W	PUS2	P53167	370 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PMT5	YDL093W	ACS1	Q01574	713 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PMT5	YDL093W	FDC1	Q03034	503 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PMT5	YDL093W	CIR2	Q08822	631 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PMT5	YDL093W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
PMT5	YDL093W	NFI1	Q12216	726 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PMT5	YDL093W	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PMT5	YDL093W	TY4B-J	P47024	1803 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PMT5	YDL093W	RAV1	P47104	1357 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PMT5	YDL093W	ARG1	P22768	420 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PMT5	YDL093W	SRP101	P32916	621 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PMT5	YDL093W	PPQ1	P32945	549 aa		5.14	□□□□□ -1.59

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