Protein–RNA interactions for Protein: P10961

HSF1, Heat shock factor protein, yeastyeast

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HSF1P10961 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.88■□□□□ 0.93
HSF1P10961 NSR1YGR159C 1245 nt20.64■□□□□ 0.89
HSF1P10961 NOP1YDL014W 984 nt20.27■□□□□ 0.84
HSF1P10961 YKL036CYKL036C 393 nt18.92■□□□□ 0.62
HSF1P10961 MDJ1YFL016C 1536 nt18.27■□□□□ 0.51
HSF1P10961 Q0297Q0297 156 nt17.93■□□□□ 0.46
HSF1P10961 SRX1YKL086W 384 nt17.82■□□□□ 0.44
HSF1P10961 YJL027CYJL027C 417 nt17.66■□□□□ 0.42
HSF1P10961 SCS3YGL126W 1143 nt17.37■□□□□ 0.37
HSF1P10961 YCR051WYCR051W 669 nt16.85■□□□□ 0.29
HSF1P10961 YOL085CYOL085C 342 nt16.46■□□□□ 0.23
HSF1P10961 DBP2YNL112W 1641 nt16.33■□□□□ 0.2
HSF1P10961 PKP1YIL042C 1185 nt16.18■□□□□ 0.18
HSF1P10961 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.08■□□□□ 0.16
HSF1P10961 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.08■□□□□ 0.16
HSF1P10961 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.08■□□□□ 0.16
HSF1P10961 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.08■□□□□ 0.16
HSF1P10961 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.08■□□□□ 0.16
HSF1P10961 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.08■□□□□ 0.16
HSF1P10961 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.08■□□□□ 0.16
HSF1P10961 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.08■□□□□ 0.16
HSF1P10961 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.08■□□□□ 0.16
HSF1P10961 RPP1BYDL130W 321 nt16.06■□□□□ 0.16
HSF1P10961 SCJ1YMR214W 1134 nt15.95■□□□□ 0.14
HSF1P10961 CCC1YLR220W 969 nt15.83■□□□□ 0.12
HSF1P10961 ATS1YAL020C 1002 nt15.6■□□□□ 0.09
HSF1P10961 YBR190WYBR190W 312 nt15.47■□□□□ 0.07
HSF1P10961 PET122YER153C 765 nt15.38■□□□□ 0.05
HSF1P10961 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.23■□□□□ 0.03
HSF1P10961 RVS167YDR388W 1449 nt15.09■□□□□ 0.01
HSF1P10961 SCR1SCR1 522 nt15.08■□□□□ 0
HSF1P10961 RTC3YHR087W 336 nt15.05■□□□□ -0
HSF1P10961 RRN5YLR141W 1092 nt14.93□□□□□ -0.02
HSF1P10961 SSA3YBL075C 1950 nt14.8□□□□□ -0.04
HSF1P10961 YDJ1YNL064C 1230 nt14.73□□□□□ -0.05
HSF1P10961 SHR5YOL110W 714 nt14.72□□□□□ -0.05
HSF1P10961 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.66□□□□□ -0.06
HSF1P10961 RSB1YOR049C 1065 nt14.58□□□□□ -0.08
HSF1P10961 PST2YDR032C 597 nt14.45□□□□□ -0.1
HSF1P10961 GAR1YHR089C 618 nt14.35□□□□□ -0.11
HSF1P10961 DEP1YAL013W 1218 nt14.27□□□□□ -0.13
HSF1P10961 URN1YPR152C 1398 nt14.22□□□□□ -0.13
HSF1P10961 PUT4YOR348C 1884 nt14.07□□□□□ -0.16
HSF1P10961 YKL097CYKL097C 411 nt14.03□□□□□ -0.16
HSF1P10961 OPI9YLR338W 858 nt14.02□□□□□ -0.17
HSF1P10961 YNL208WYNL208W 600 nt14.02□□□□□ -0.17
HSF1P10961 RPN10YHR200W 807 nt13.92□□□□□ -0.18
HSF1P10961 SAH1YER043C 1350 nt13.9□□□□□ -0.18
HSF1P10961 TIR1YER011W 765 nt13.88□□□□□ -0.19
HSF1P10961 ARE1YCR048W 1833 nt13.85□□□□□ -0.19
HSF1P10961 SHU1YHL006C 453 nt13.82□□□□□ -0.2
HSF1P10961 SSA1YAL005C 1929 nt13.76□□□□□ -0.21
HSF1P10961 SRB2YHR041C 633 nt13.71□□□□□ -0.21
HSF1P10961 YJR120WYJR120W 351 nt13.61□□□□□ -0.23
HSF1P10961 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.58□□□□□ -0.24
HSF1P10961 YJR018WYJR018W 363 nt13.56□□□□□ -0.24
HSF1P10961 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.55□□□□□ -0.24
HSF1P10961 POA1YBR022W 534 nt13.55□□□□□ -0.24
HSF1P10961 PUN1YLR414C 792 nt13.54□□□□□ -0.24
HSF1P10961 SPT5YML010W 3192 nt13.44□□□□□ -0.26
HSF1P10961 YOR139CYOR139C 393 nt13.42□□□□□ -0.26
HSF1P10961 PTC2YER089C 1395 nt13.4□□□□□ -0.26
HSF1P10961 BSC6YOL137W 1494 nt13.36□□□□□ -0.27
HSF1P10961 WWM1YFL010C 636 nt13.33□□□□□ -0.28
HSF1P10961 HOM6YJR139C 1080 nt13.28□□□□□ -0.28
HSF1P10961 MNP1YGL068W 585 nt13.24□□□□□ -0.29
HSF1P10961 RPP2BYDR382W 333 nt13.21□□□□□ -0.29
HSF1P10961 BUD23YCR047C 828 nt13.2□□□□□ -0.3
HSF1P10961 YGR021WYGR021W 873 nt13.19□□□□□ -0.3
HSF1P10961 NAB2YGL122C 1578 nt13.16□□□□□ -0.3
HSF1P10961 SSA4YER103W 1929 nt13.15□□□□□ -0.3
HSF1P10961 NPL3YDR432W 1245 nt13.13□□□□□ -0.31
HSF1P10961 FIS1YIL065C 468 nt13.13□□□□□ -0.31
HSF1P10961 BDH2YAL061W 1254 nt13.1□□□□□ -0.31
HSF1P10961 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.06□□□□□ -0.32
HSF1P10961 RKM5YLR137W 1104 nt13.05□□□□□ -0.32
HSF1P10961 DAL1YIR027C 1383 nt13.05□□□□□ -0.32
HSF1P10961 INM2YDR287W 879 nt13.02□□□□□ -0.33
HSF1P10961 YOL037CYOL037C 354 nt12.98□□□□□ -0.33
HSF1P10961 PHO4YFR034C 939 nt12.95□□□□□ -0.34
HSF1P10961 YBL100CYBL100C 315 nt12.95□□□□□ -0.34
HSF1P10961 LSM3YLR438C-A 270 nt12.94□□□□□ -0.34
HSF1P10961 FPR4YLR449W 1179 nt12.94□□□□□ -0.34
HSF1P10961 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.87□□□□□ -0.35
HSF1P10961 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.87□□□□□ -0.35
HSF1P10961 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.87□□□□□ -0.35
HSF1P10961 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.87□□□□□ -0.35
HSF1P10961 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.87□□□□□ -0.35
HSF1P10961 FUN26YAL022C 1554 nt12.84□□□□□ -0.35
HSF1P10961 BDF1YLR399C 2061 nt12.79□□□□□ -0.36
HSF1P10961 YLR281CYLR281C 468 nt12.75□□□□□ -0.37
HSF1P10961 TRM9YML014W 840 nt12.75□□□□□ -0.37
HSF1P10961 CCT6YDR188W 1641 nt12.72□□□□□ -0.37
HSF1P10961 YPS1YLR120C 1710 nt12.68□□□□□ -0.38
HSF1P10961 WHI5YOR083W 888 nt12.66□□□□□ -0.38
HSF1P10961 Q0182Q0182 405 nt12.65□□□□□ -0.38
HSF1P10961 YDR095CYDR095C 411 nt12.63□□□□□ -0.39
HSF1P10961 MEP2YNL142W 1500 nt12.62□□□□□ -0.39
HSF1P10961 PUS2YGL063W 1113 nt12.62□□□□□ -0.39
HSF1P10961 TAT1YBR069C 1860 nt12.57□□□□□ -0.4
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