RNA–Protein interactions for RNA: tR(UCU)Q1

tR(UCU)Q1, Transcript of Mitochondrial arginine tRNA (tRNA-Arg), yeastyeast

Gene tR(UCU)Q1, Length 73 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YJL171CP46992 396 aa11.67□□□□□ -0.54
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 DAN4P47179 1161 aa11.65□□□□□ -0.54
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 DCW1P36091 449 aa11.64□□□□□ -0.55
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 GUT1P32190 709 aa11.63□□□□□ -0.55
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 NCR1Q12200 1170 aa11.63□□□□□ -0.55
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 PTC4P38089 393 aa11.6□□□□□ -0.55
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 ATH1P48016 1211 aa11.6□□□□□ -0.55
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 BMT6Q12291 365 aa11.6□□□□□ -0.55
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YEL023CP39992 682 aa11.59□□□□□ -0.55
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 TFG1P41895 735 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 NST1P53935 1240 aa11.52□□□□□ -0.57
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YDL129WQ07555 291 aa11.48□□□□□ -0.57
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SOL3P38858 249 aa11.45□□□□□ -0.58
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SET1P38827 1080 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 AI4P03878 556 aa11.41□□□□□ -0.58
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 MPH3P0CE00 602 aa11.39□□□□□ -0.59
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SAP30P38429 201 aa11.37□□□□□ -0.59
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YGR273CP53329 174 aa11.37□□□□□ -0.59
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 PML39Q03760 334 aa11.32□□□□□ -0.6
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 IFH1P39520 1085 aa11.31□□□□□ -0.6
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 ILV3P39522 585 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 CHL1P22516 861 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 PRE3P38624 215 aa11.27□□□□□ -0.61
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YPR148CQ06523 435 aa11.25□□□□□ -0.61
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 MID1P41821 548 aa11.19□□□□□ -0.62
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 ARH1P48360 493 aa11.19□□□□□ -0.62
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 KEX1P09620 729 aa11.16□□□□□ -0.62
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 UBP14P38237 781 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SLI15P38283 698 aa11.13□□□□□ -0.63
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YDR344CQ05510 147 aa11.13□□□□□ -0.63
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 ELP4Q02884 456 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 PEX29Q03370 554 aa11.1□□□□□ -0.63
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 MPC54Q08550 464 aa11.1□□□□□ -0.63
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 BCK2P33306 851 aa11.09□□□□□ -0.63
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 HAP5Q02516 242 aa11.06□□□□□ -0.64
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 VHR2P40041 505 aa11.05□□□□□ -0.64
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SPT23P35210 1082 aa11.04□□□□□ -0.64
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 BNI4P53858 892 aa11.03□□□□□ -0.64
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 DPL1Q05567 589 aa11.03□□□□□ -0.64
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 RAD54P32863 898 aa11.02□□□□□ -0.65
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 REF2P42073 533 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data11.01□□□□□ -0.65not detected
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YDR090CQ03193 310 aa11.01□□□□□ -0.65
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 VPS70P47161 811 aa10.98□□□□□ -0.65
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 DMA1P38823 416 aa10.97□□□□□ -0.65
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 NMA111P53920 997 aa10.97□□□□□ -0.65
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YML082WQ04533 649 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 ISU2Q12056 156 aa10.94□□□□□ -0.66
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 RPP1BP10622 106 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 VRP1P37370 817 aa10.92□□□□□ -0.66
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 XDJ1P39102 459 aa10.92□□□□□ -0.66
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 CKB1P43639 278 aa10.92□□□□□ -0.66
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 CDC73Q06697 393 aa10.92□□□□□ -0.66
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 KIC1P38692 1080 aa10.89□□□□□ -0.67
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 PTC2P39966 464 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 COX6P00427 148 aa10.87□□□□□ -0.67
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 GAP1P19145 602 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 RAM1P22007 431 aa10.81□□□□□ -0.68
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 CSC1Q06538 782 aa10.8□□□□□ -0.68
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 ORC6P38826 435 aa10.79□□□□□ -0.68
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 TFB4Q12004 338 aa10.78□□□□□ -0.68
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YPR015CQ12531 247 aa10.75□□□□□ -0.69
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 PBS2P08018 668 aa10.74□□□□□ -0.69
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 DSF2P38213 736 aa10.7□□□□□ -0.7
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 PDR1P12383 1068 aa10.69□□□□□ -0.7
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 PEX21P50091 288 aa10.69□□□□□ -0.7
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 MVP1P40959 511 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YRR1Q12172 810 aa10.64□□□□□ -0.71
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SAS4Q04003 481 aa10.62□□□□□ -0.71
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 MAM3Q12296 706 aa10.62□□□□□ -0.71
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 RGR1P19263 1082 aa10.61□□□□□ -0.71
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 PSE1P32337 1089 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 TUM1Q08686 304 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 DPS1P04802 557 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 NUD1P32336 851 aa10.56□□□□□ -0.72
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 STR2P47164 639 aa10.56□□□□□ -0.72
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 GYP1Q08484 637 aa10.55□□□□□ -0.72
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 IES2P40154 320 aa10.53□□□□□ -0.72
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YPR109WQ06104 294 aa10.53□□□□□ -0.72
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 ISM1P48526 1002 aa10.52□□□□□ -0.73
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 PRT1P06103 763 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 CLB5P30283 435 aa10.51□□□□□ -0.73
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 NUP42P49686 430 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SPB4P25808 606 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 NPL4P33755 580 aa10.47□□□□□ -0.73
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SDH2P21801 266 aa10.46□□□□□ -0.73
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 MRF1P30775 413 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 TY1A-DR4O74302 440 aa10.43□□□□□ -0.74
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 TY1A-AP0CX57 440 aa10.43□□□□□ -0.74
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 TY1A-PR1P0CX58 440 aa10.43□□□□□ -0.74
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 TY1A-ORP0CX59 440 aa10.43□□□□□ -0.74
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 TY1A-PR2P0CX60 440 aa10.43□□□□□ -0.74
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 TY1A-DR5P0CX65 440 aa10.43□□□□□ -0.74
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 TY1A-ER2P0CX66 440 aa10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 53.9 ms