RNA–Protein interactions for RNA: YOL089C

HAL9, Transcript of Putative transcription factor containing a zinc finger, yeastyeast

Gene HAL9, Length 3,093 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HAL9YOL089C YEL023CP39992 682 aa4.42□□□□□ -1.7
HAL9YOL089C GRE2Q12068 342 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
HAL9YOL089C ATH1P48016 1211 aa4.42□□□□□ -1.7
HAL9YOL089C ELP4Q02884 456 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
HAL9YOL089C PEX29Q03370 554 aa4.39□□□□□ -1.71
HAL9YOL089C PTC4P38089 393 aa4.39□□□□□ -1.71
HAL9YOL089C BCK2P33306 851 aa4.38□□□□□ -1.71
HAL9YOL089C CHL1P22516 861 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
HAL9YOL089C PML39Q03760 334 aa4.37□□□□□ -1.71
HAL9YOL089C PRE3P38624 215 aa4.35□□□□□ -1.71
HAL9YOL089C DAN4P47179 1161 aa4.34□□□□□ -1.71
HAL9YOL089C VRP1P37370 817 aa4.32□□□□□ -1.72
HAL9YOL089C PTC3P34221 468 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
HAL9YOL089C GUT1P32190 709 aa4.31□□□□□ -1.72
HAL9YOL089C MAK11P20484 414 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
HAL9YOL089C RAM2P29703 316 aa4.29□□□□□ -1.72
HAL9YOL089C MID1P41821 548 aa4.29□□□□□ -1.72
HAL9YOL089C COQ8P27697 501 aa4.29□□□□□ -1.72
HAL9YOL089C EDS1P38073 919 aa4.28□□□□□ -1.72
HAL9YOL089C YDR344CQ05510 147 aa4.25□□□□□ -1.73
HAL9YOL089C DPS1P04802 557 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
HAL9YOL089C XDJ1P39102 459 aa4.22□□□□□ -1.73
HAL9YOL089C SPT23P35210 1082 aa4.21□□□□□ -1.74
HAL9YOL089C ARH1P48360 493 aa4.2□□□□□ -1.74
HAL9YOL089C PTC2P39966 464 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
HAL9YOL089C HAP5Q02516 242 aa4.2□□□□□ -1.74
HAL9YOL089C MPH3P0CE00 602 aa4.18□□□□□ -1.74
HAL9YOL089C AI4P03878 556 aa4.17□□□□□ -1.74
HAL9YOL089C SOL3P38858 249 aa4.15□□□□□ -1.74
HAL9YOL089C YGR273CP53329 174 aa4.15□□□□□ -1.74
HAL9YOL089C MPC54Q08550 464 aa4.15□□□□□ -1.74
HAL9YOL089C NMA111P53920 997 aa4.15□□□□□ -1.75
HAL9YOL089C ILV3P39522 585 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
HAL9YOL089C BNI4P53858 892 aa4.12□□□□□ -1.75
HAL9YOL089C DPL1Q05567 589 aa4.12□□□□□ -1.75
HAL9YOL089C GYP1Q08484 637 aa4.12□□□□□ -1.75
HAL9YOL089C SLI15P38283 698 aa4.11□□□□□ -1.75
HAL9YOL089C VHR2P40041 505 aa4.1□□□□□ -1.75
HAL9YOL089C RPP1BP10622 106 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
HAL9YOL089C SET1P38827 1080 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
HAL9YOL089C KIC1P38692 1080 aa4.08□□□□□ -1.76
HAL9YOL089C NST1P53935 1240 aa4.08□□□□□ -1.76
HAL9YOL089C NOP53Q12080 455 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
HAL9YOL089C PEX21P50091 288 aa4.08□□□□□ -1.76
HAL9YOL089C CDC73Q06697 393 aa4.08□□□□□ -1.76
HAL9YOL089C KEX1P09620 729 aa4.07□□□□□ -1.76
HAL9YOL089C ISU2Q12056 156 aa4.07□□□□□ -1.76
HAL9YOL089C RAD54P32863 898 aa4.07□□□□□ -1.76
HAL9YOL089C YML082WQ04533 649 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
HAL9YOL089C IFH1P39520 1085 aa4.03□□□□□ -1.76
HAL9YOL089C RAS1P01119 309 aa4.02□□□□□ -1.77
HAL9YOL089C PDR1P12383 1068 aa4.02□□□□□ -1.77
HAL9YOL089C NPL4P33755 580 aa4□□□□□ -1.77
HAL9YOL089C YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
HAL9YOL089C YRR1Q12172 810 aa4□□□□□ -1.77
HAL9YOL089C YEL077CQ3E7X8 1277 aa4□□□□□ -1.77
HAL9YOL089C GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data3.99□□□□□ -1.77not detected
HAL9YOL089C YPR015CQ12531 247 aa3.99□□□□□ -1.77
HAL9YOL089C PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data3.98□□□□□ -1.77not detected
HAL9YOL089C UBP14P38237 781 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
HAL9YOL089C TRK1P12685 1235 aa3.97□□□□□ -1.77
HAL9YOL089C TUM1Q08686 304 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
HAL9YOL089C AMS1P22855 1083 aa3.96□□□□□ -1.77
HAL9YOL089C ERG12P07277 443 aa3.96□□□□□ -1.78
HAL9YOL089C GCD11P32481 527 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
HAL9YOL089C MRF1P30775 413 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
HAL9YOL089C SAS4Q04003 481 aa3.96□□□□□ -1.78
HAL9YOL089C VPS70P47161 811 aa3.95□□□□□ -1.78
HAL9YOL089C SRC1Q03707 834 aa3.94□□□□□ -1.78
HAL9YOL089C PRT1P06103 763 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
HAL9YOL089C REF2P42073 533 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
HAL9YOL089C SPT16P32558 1035 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
HAL9YOL089C RAM1P22007 431 aa3.91□□□□□ -1.78
HAL9YOL089C NUD1P32336 851 aa3.91□□□□□ -1.78
HAL9YOL089C GAR1P28007 205 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
HAL9YOL089C FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
HAL9YOL089C CSC1Q06538 782 aa3.9□□□□□ -1.78
HAL9YOL089C PAT1P25644 796 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
HAL9YOL089C ISM1P48526 1002 aa3.89□□□□□ -1.79
HAL9YOL089C BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
HAL9YOL089C TFB4Q12004 338 aa3.89□□□□□ -1.79
HAL9YOL089C GCR2Q01722 534 aa3.89□□□□□ -1.79
HAL9YOL089C STR2P47164 639 aa3.86□□□□□ -1.79
HAL9YOL089C RRN7P40992 514 aa3.86□□□□□ -1.79
HAL9YOL089C YDR090CQ03193 310 aa3.86□□□□□ -1.79
HAL9YOL089C YPR109WQ06104 294 aa3.86□□□□□ -1.79
HAL9YOL089C BRE2P43132 505 aa3.84□□□□□ -1.8
HAL9YOL089C SDH2P21801 266 aa3.83□□□□□ -1.8
HAL9YOL089C AIR1P40507 360 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
HAL9YOL089C CST6P40535 587 aa3.82□□□□□ -1.8
HAL9YOL089C MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
HAL9YOL089C CLA4P48562 842 aa3.81□□□□□ -1.8
HAL9YOL089C KEX2P13134 814 aa3.8□□□□□ -1.8
HAL9YOL089C MVP1P40959 511 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
HAL9YOL089C COX6P00427 148 aa3.8□□□□□ -1.8
HAL9YOL089C ORC6P38826 435 aa3.8□□□□□ -1.8
HAL9YOL089C RGA1P39083 1007 aa3.8□□□□□ -1.8
HAL9YOL089C BDP1P46678 594 aa3.78□□□□□ -1.8
HAL9YOL089C RGR1P19263 1082 aa3.77□□□□□ -1.81
HAL9YOL089C HST3P53687 447 aa3.77□□□□□ -1.81
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