RNA–Protein interactions for RNA: YMR085W

YMR085W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR085W, Length 1,299 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR085WYMR085W ATH1P48016 1211 aa8.67□□□□□ -1.02
YMR085WYMR085W SEC61P32915 480 aa8.65□□□□□ -1.02
YMR085WYMR085W JIP4Q03361 876 aa8.65□□□□□ -1.02
YMR085WYMR085W NCR1Q12200 1170 aa8.65□□□□□ -1.02
YMR085WYMR085W GUT1P32190 709 aa8.64□□□□□ -1.03
YMR085WYMR085W NOP53Q12080 455 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
YMR085WYMR085W YEL023CP39992 682 aa8.63□□□□□ -1.03
YMR085WYMR085W DAN4P47179 1161 aa8.62□□□□□ -1.03
YMR085WYMR085W PTC4P38089 393 aa8.61□□□□□ -1.03
YMR085WYMR085W BMT6Q12291 365 aa8.61□□□□□ -1.03
YMR085WYMR085W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
YMR085WYMR085W SET1P38827 1080 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
YMR085WYMR085W SOL3P38858 249 aa8.5□□□□□ -1.05
YMR085WYMR085W NST1P53935 1240 aa8.5□□□□□ -1.05
YMR085WYMR085W YDL129WQ07555 291 aa8.5□□□□□ -1.05
YMR085WYMR085W SAP30P38429 201 aa8.49□□□□□ -1.05
YMR085WYMR085W YGR273CP53329 174 aa8.46□□□□□ -1.06
YMR085WYMR085W MPH3P0CE00 602 aa8.45□□□□□ -1.06
YMR085WYMR085W PML39Q03760 334 aa8.45□□□□□ -1.06
YMR085WYMR085W AI4P03878 556 aa8.44□□□□□ -1.06
YMR085WYMR085W IFH1P39520 1085 aa8.4□□□□□ -1.06
YMR085WYMR085W ILV3P39522 585 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
YMR085WYMR085W MID1P41821 548 aa8.36□□□□□ -1.07
YMR085WYMR085W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
YMR085WYMR085W PRE3P38624 215 aa8.34□□□□□ -1.07
YMR085WYMR085W DMA1P38823 416 aa8.34□□□□□ -1.07
YMR085WYMR085W YPR148CQ06523 435 aa8.33□□□□□ -1.08
YMR085WYMR085W KEX1P09620 729 aa8.32□□□□□ -1.08
YMR085WYMR085W PEX29Q03370 554 aa8.31□□□□□ -1.08
YMR085WYMR085W VHR2P40041 505 aa8.29□□□□□ -1.08
YMR085WYMR085W ELP4Q02884 456 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
YMR085WYMR085W YDR344CQ05510 147 aa8.29□□□□□ -1.08
YMR085WYMR085W UBP14P38237 781 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
YMR085WYMR085W SLI15P38283 698 aa8.28□□□□□ -1.08
YMR085WYMR085W ARH1P48360 493 aa8.28□□□□□ -1.08
YMR085WYMR085W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
YMR085WYMR085W VPS70P47161 811 aa8.27□□□□□ -1.09
YMR085WYMR085W MPC54Q08550 464 aa8.25□□□□□ -1.09
YMR085WYMR085W RAD54P32863 898 aa8.22□□□□□ -1.09
YMR085WYMR085W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data8.22□□□□□ -1.09not detected
YMR085WYMR085W REF2P42073 533 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
YMR085WYMR085W BCK2P33306 851 aa8.21□□□□□ -1.1
YMR085WYMR085W HAP5Q02516 242 aa8.21□□□□□ -1.1
YMR085WYMR085W DPL1Q05567 589 aa8.2□□□□□ -1.1
YMR085WYMR085W NMA111P53920 997 aa8.19□□□□□ -1.1
YMR085WYMR085W SPT23P35210 1082 aa8.18□□□□□ -1.1
YMR085WYMR085W YDR090CQ03193 310 aa8.18□□□□□ -1.1
YMR085WYMR085W KIC1P38692 1080 aa8.17□□□□□ -1.1
YMR085WYMR085W BNI4P53858 892 aa8.15□□□□□ -1.1
YMR085WYMR085W CDC73Q06697 393 aa8.15□□□□□ -1.1
YMR085WYMR085W VRP1P37370 817 aa8.14□□□□□ -1.11
YMR085WYMR085W CKB1P43639 278 aa8.14□□□□□ -1.11
YMR085WYMR085W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
YMR085WYMR085W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
YMR085WYMR085W ISU2Q12056 156 aa8.12□□□□□ -1.11
YMR085WYMR085W MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
YMR085WYMR085W PTC2P39966 464 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
YMR085WYMR085W COX6P00427 148 aa8.09□□□□□ -1.11
YMR085WYMR085W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
YMR085WYMR085W PBS2P08018 668 aa8.05□□□□□ -1.12
YMR085WYMR085W XDJ1P39102 459 aa8.04□□□□□ -1.12
YMR085WYMR085W PEX21P50091 288 aa8.03□□□□□ -1.12
YMR085WYMR085W ORC6P38826 435 aa8.02□□□□□ -1.13
YMR085WYMR085W CSC1Q06538 782 aa8.01□□□□□ -1.13
YMR085WYMR085W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
YMR085WYMR085W PDR1P12383 1068 aa7.99□□□□□ -1.13
YMR085WYMR085W TFB4Q12004 338 aa7.99□□□□□ -1.13
YMR085WYMR085W RAM1P22007 431 aa7.98□□□□□ -1.13
YMR085WYMR085W YPR015CQ12531 247 aa7.97□□□□□ -1.13
YMR085WYMR085W DSF2P38213 736 aa7.96□□□□□ -1.14
YMR085WYMR085W YRR1Q12172 810 aa7.96□□□□□ -1.14
YMR085WYMR085W MAM3Q12296 706 aa7.96□□□□□ -1.14
YMR085WYMR085W SPB4P25808 606 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
YMR085WYMR085W TUM1Q08686 304 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
YMR085WYMR085W MVP1P40959 511 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
YMR085WYMR085W RGR1P19263 1082 aa7.91□□□□□ -1.14
YMR085WYMR085W GYP1Q08484 637 aa7.9□□□□□ -1.14
YMR085WYMR085W IES2P40154 320 aa7.89□□□□□ -1.15
YMR085WYMR085W PSE1P32337 1089 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
YMR085WYMR085W NUD1P32336 851 aa7.87□□□□□ -1.15
YMR085WYMR085W YPR109WQ06104 294 aa7.87□□□□□ -1.15
YMR085WYMR085W DPS1P04802 557 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
YMR085WYMR085W NPL4P33755 580 aa7.85□□□□□ -1.15
YMR085WYMR085W STR2P47164 639 aa7.85□□□□□ -1.15
YMR085WYMR085W SAS4Q04003 481 aa7.85□□□□□ -1.15
YMR085WYMR085W ISM1P48526 1002 aa7.84□□□□□ -1.15
YMR085WYMR085W BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
YMR085WYMR085W NUP42P49686 430 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
YMR085WYMR085W PRT1P06103 763 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
YMR085WYMR085W DIT2P21595 489 aa7.8□□□□□ -1.16
YMR085WYMR085W CLB5P30283 435 aa7.79□□□□□ -1.16
YMR085WYMR085W GCD11P32481 527 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
YMR085WYMR085W MRF1P30775 413 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
YMR085WYMR085W TY1A-DR4O74302 440 aa7.73□□□□□ -1.17
YMR085WYMR085W RAS1P01119 309 aa7.73□□□□□ -1.17
YMR085WYMR085W TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
YMR085WYMR085W TY1A-AP0CX57 440 aa7.73□□□□□ -1.17
YMR085WYMR085W TY1A-PR1P0CX58 440 aa7.73□□□□□ -1.17
YMR085WYMR085W TY1A-ORP0CX59 440 aa7.73□□□□□ -1.17
YMR085WYMR085W TY1A-PR2P0CX60 440 aa7.73□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.9 ms