RNA–Protein interactions for RNA: YGR063C

SPT4, Transcript of Component of the universally conserved Spt4/5 complex (DSIF complex), yeast

Gene SPT4, Length 309 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPT4	YGR063C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SPT4	YGR063C	HSL1	P34244	1518 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SPT4	YGR063C	SSK2	P53599	1579 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SPT4	YGR063C	PAF1	P38351	445 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SPT4	YGR063C	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SPT4	YGR063C	HO	P09932	586 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SPT4	YGR063C	RPC31	P17890	251 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SPT4	YGR063C	ROX1	P25042	368 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SPT4	YGR063C	ENV11	P53246	860 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SPT4	YGR063C	PLP2	Q12017	286 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SPT4	YGR063C	EDE1	P34216	1381 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SPT4	YGR063C	PAN1	P32521	1480 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SPT4	YGR063C	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SPT4	YGR063C	REV3	P14284	1504 aa		4.33	□□□□□ -1.72
SPT4	YGR063C	SWR1	Q05471	1514 aa		4.33	□□□□□ -1.72
SPT4	YGR063C	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
SPT4	YGR063C	ABP1	P15891	592 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
SPT4	YGR063C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.33	□□□□□ -1.72
SPT4	YGR063C	SCC2	Q04002	1493 aa		4.32	□□□□□ -1.72
SPT4	YGR063C	DCD1	P06773	312 aa		4.32	□□□□□ -1.72
SPT4	YGR063C	SPC110	P32380	944 aa		4.32	□□□□□ -1.72
SPT4	YGR063C	DNA2	P38859	1522 aa		4.31	□□□□□ -1.72
SPT4	YGR063C	TAF2	P23255	1407 aa		4.31	□□□□□ -1.72
SPT4	YGR063C	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	4.31	□□□□□ -1.72
SPT4	YGR063C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.31	□□□□□ -1.72
SPT4	YGR063C	MHP1	P43638	1398 aa		4.3	□□□□□ -1.72
SPT4	YGR063C	OXP1	P28273	1286 aa		4.3	□□□□□ -1.72
SPT4	YGR063C	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
SPT4	YGR063C	SMC3	P47037	1230 aa		4.3	□□□□□ -1.72
SPT4	YGR063C	BPT1	P14772	1559 aa		4.3	□□□□□ -1.72
SPT4	YGR063C	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	4.29	□□□□□ -1.72
SPT4	YGR063C	HIR3	P47171	1648 aa		4.29	□□□□□ -1.72
SPT4	YGR063C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
SPT4	YGR063C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
SPT4	YGR063C	SAS10	Q12136	610 aa	Predicted RBP	4.29	□□□□□ -1.72
SPT4	YGR063C	NUP159	P40477	1460 aa		4.29	□□□□□ -1.72
SPT4	YGR063C	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	4.28	□□□□□ -1.72
SPT4	YGR063C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.28	□□□□□ -1.72
SPT4	YGR063C	RTT106	P40161	455 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SPT4	YGR063C	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SPT4	YGR063C	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SPT4	YGR063C	GCN2	P15442	1659 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SPT4	YGR063C	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SPT4	YGR063C	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SPT4	YGR063C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SPT4	YGR063C	ESP1	Q03018	1630 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SPT4	YGR063C	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SPT4	YGR063C	VPS4	P52917	437 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SPT4	YGR063C	CTR9	P89105	1077 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SPT4	YGR063C	TSC11	P40061	1430 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SPT4	YGR063C	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SPT4	YGR063C	YOR1	P53049	1477 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SPT4	YGR063C	BYE1	P36106	594 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SPT4	YGR063C	TRM3	Q07527	1436 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SPT4	YGR063C	BCH2	P36122	765 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SPT4	YGR063C	YNL011C	P53980	444 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SPT4	YGR063C	KOG1	P38873	1557 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SPT4	YGR063C	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SPT4	YGR063C	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SPT4	YGR063C	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SPT4	YGR063C	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SPT4	YGR063C	PCT1	P13259	424 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SPT4	YGR063C	MSP1	P28737	362 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SPT4	YGR063C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SPT4	YGR063C	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SPT4	YGR063C	PTP3	P40048	928 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SPT4	YGR063C	YIL055C	P40523	627 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SPT4	YGR063C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SPT4	YGR063C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	RAD26	P40352	1085 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	SCY1	P53009	804 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	SIC1	P38634	284 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	TCD1	P38756	429 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	YPP1	P46951	817 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	CDC45	Q08032	650 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	LEU3	P08638	886 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	NST1	P53935	1240 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	PSH1	Q12161	406 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	RAD9	P14737	1309 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	RKR1	Q04781	1562 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	RSM7	P47150	247 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	IOC4	Q04213	475 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	YAH1	Q12184	172 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	GDB1	Q06625	1536 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	PET111	P08468	800 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	LTV1	P34078	463 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	CIN4	P39110	191 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	TPM2	P40414	161 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	DJP1	P40564	432 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	DSN1	P40568	576 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SPT4	YGR063C	NNF2	P53253	936 aa		4.17	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.1 ms