RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeastyeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DOA4YDR069C LEO1P38439 464 aa4.61□□□□□ -1.67
DOA4YDR069C VHR2P40041 505 aa4.6□□□□□ -1.67
DOA4YDR069C VNX1P42839 908 aa4.6□□□□□ -1.67
DOA4YDR069C SPP1Q03012 353 aa4.6□□□□□ -1.67
DOA4YDR069C KIC1P38692 1080 aa4.59□□□□□ -1.67
DOA4YDR069C ULI1P43604 169 aa4.59□□□□□ -1.67
DOA4YDR069C YGR273CP53329 174 aa4.59□□□□□ -1.67
DOA4YDR069C MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
DOA4YDR069C DSF2P38213 736 aa4.59□□□□□ -1.68
DOA4YDR069C TIF11P38912 153 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
DOA4YDR069C MAM3Q12296 706 aa4.59□□□□□ -1.68
DOA4YDR069C RPN1P38764 993 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
DOA4YDR069C TRP5P00931 707 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
DOA4YDR069C TAF7Q05021 590 aa4.57□□□□□ -1.68
DOA4YDR069C COX6P00427 148 aa4.56□□□□□ -1.68
DOA4YDR069C UBP14P38237 781 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
DOA4YDR069C RAD54P32863 898 aa4.56□□□□□ -1.68
DOA4YDR069C YEL023CP39992 682 aa4.56□□□□□ -1.68
DOA4YDR069C SOL3P38858 249 aa4.55□□□□□ -1.68
DOA4YDR069C IES2P40154 320 aa4.55□□□□□ -1.68
DOA4YDR069C YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
DOA4YDR069C URN1Q06525 465 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
DOA4YDR069C KEX1P09620 729 aa4.54□□□□□ -1.68
DOA4YDR069C PTC4P38089 393 aa4.53□□□□□ -1.68
DOA4YDR069C JIP4Q03361 876 aa4.53□□□□□ -1.68
DOA4YDR069C BUD31P25337 157 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
DOA4YDR069C NOP2P40991 618 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
DOA4YDR069C AI4P03878 556 aa4.52□□□□□ -1.69
DOA4YDR069C MPH3P0CE00 602 aa4.52□□□□□ -1.69
DOA4YDR069C YDR090CQ03193 310 aa4.52□□□□□ -1.69
DOA4YDR069C YNL035CP53962 389 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
DOA4YDR069C PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data4.51□□□□□ -1.69not detected
DOA4YDR069C DAN4P47179 1161 aa4.51□□□□□ -1.69
DOA4YDR069C YNR021WP53723 404 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
DOA4YDR069C TFG1P41895 735 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
DOA4YDR069C IOC2Q12072 812 aa4.5□□□□□ -1.69
DOA4YDR069C LDB19Q12502 818 aa4.5□□□□□ -1.69
DOA4YDR069C NST1P53935 1240 aa4.5□□□□□ -1.69
DOA4YDR069C RPP1BP10622 106 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
DOA4YDR069C DIT2P21595 489 aa4.49□□□□□ -1.69
DOA4YDR069C RTG1P32607 177 aa4.49□□□□□ -1.69
DOA4YDR069C ATF2P53296 535 aa4.49□□□□□ -1.69
DOA4YDR069C NUP42P49686 430 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
DOA4YDR069C GLC3P32775 704 aa4.48□□□□□ -1.69
DOA4YDR069C EBP2P36049 427 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
DOA4YDR069C ILV3P39522 585 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
DOA4YDR069C SEC61P32915 480 aa4.47□□□□□ -1.69
DOA4YDR069C SLI15P38283 698 aa4.46□□□□□ -1.7
DOA4YDR069C PEX29Q03370 554 aa4.46□□□□□ -1.7
DOA4YDR069C PML39Q03760 334 aa4.46□□□□□ -1.7
DOA4YDR069C NCR1Q12200 1170 aa4.46□□□□□ -1.7
DOA4YDR069C CAB3P36076 571 aa4.46□□□□□ -1.7
DOA4YDR069C KIN1P13185 1064 aa4.45□□□□□ -1.7
DOA4YDR069C PSE1P32337 1089 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
DOA4YDR069C SIS1P25294 352 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
DOA4YDR069C AIM7Q12156 149 aa4.44□□□□□ -1.7
DOA4YDR069C MID1P41821 548 aa4.43□□□□□ -1.7
DOA4YDR069C PEX21P50091 288 aa4.43□□□□□ -1.7
DOA4YDR069C CDC73Q06697 393 aa4.42□□□□□ -1.7
DOA4YDR069C YDL129WQ07555 291 aa4.42□□□□□ -1.7
DOA4YDR069C ORC6P38826 435 aa4.42□□□□□ -1.7
DOA4YDR069C CSC1Q06538 782 aa4.42□□□□□ -1.7
DOA4YDR069C SKI3P17883 1432 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
DOA4YDR069C SIS2P36024 562 aa4.41□□□□□ -1.7
DOA4YDR069C DPL1Q05567 589 aa4.41□□□□□ -1.7
DOA4YDR069C FKH1P40466 484 aa4.4□□□□□ -1.7
DOA4YDR069C TEA1P47988 759 aa4.4□□□□□ -1.7
DOA4YDR069C SAP30P38429 201 aa4.4□□□□□ -1.71
DOA4YDR069C MPC54Q08550 464 aa4.4□□□□□ -1.71
DOA4YDR069C RGR1P19263 1082 aa4.39□□□□□ -1.71
DOA4YDR069C MVP1P40959 511 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
DOA4YDR069C YJL171CP46992 396 aa4.39□□□□□ -1.71
DOA4YDR069C TFB4Q12004 338 aa4.39□□□□□ -1.71
DOA4YDR069C CLB5P30283 435 aa4.39□□□□□ -1.71
DOA4YDR069C YPR109WQ06104 294 aa4.38□□□□□ -1.71
DOA4YDR069C ISU2Q12056 156 aa4.38□□□□□ -1.71
DOA4YDR069C TUM1Q08686 304 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
DOA4YDR069C HGH1P48362 394 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
DOA4YDR069C NMA111P53920 997 aa4.37□□□□□ -1.71
DOA4YDR069C DMA2P53924 522 aa4.37□□□□□ -1.71
DOA4YDR069C AIR2Q12476 344 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
DOA4YDR069C ELP4Q02884 456 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
DOA4YDR069C YRR1Q12172 810 aa4.36□□□□□ -1.71
DOA4YDR069C YMR196WQ04336 1088 aa4.36□□□□□ -1.71
DOA4YDR069C GAP1P19145 602 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
DOA4YDR069C BMT6Q12291 365 aa4.35□□□□□ -1.71
DOA4YDR069C CSN12P47130 423 aa4.34□□□□□ -1.71
DOA4YDR069C GUA1P38625 525 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.72
DOA4YDR069C HAP5Q02516 242 aa4.34□□□□□ -1.72
DOA4YDR069C ARH1P48360 493 aa4.33□□□□□ -1.72
DOA4YDR069C SSA2P10592 639 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
DOA4YDR069C NPL4P33755 580 aa4.32□□□□□ -1.72
DOA4YDR069C SPA2P23201 1466 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
DOA4YDR069C NIS1P53939 407 aa4.31□□□□□ -1.72
DOA4YDR069C GLN1P32288 370 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
DOA4YDR069C BRL1P38770 471 aa4.3□□□□□ -1.72
DOA4YDR069C FPK1P53739 893 aa4.3□□□□□ -1.72
DOA4YDR069C SPT23P35210 1082 aa4.3□□□□□ -1.72
DOA4YDR069C TYW1Q08960 810 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
DOA4YDR069C NUD1P32336 851 aa4.29□□□□□ -1.72
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