RNA–Protein interactions for RNA: YDR057W

YOS9, Transcript of ER quality-control lectin, yeastyeast

Gene YOS9, Length 1,629 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOS9YDR057W HIF1Q12373 385 aa8.69□□□□□ -1.02
YOS9YDR057W DBP1P24784 617 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
YOS9YDR057W VPS72Q03388 795 aa8.69□□□□□ -1.02
YOS9YDR057W ASF1P32447 279 aa8.68□□□□□ -1.02
YOS9YDR057W STS1P38637 319 aa8.68□□□□□ -1.02
YOS9YDR057W GTT3P39996 337 aa8.68□□□□□ -1.02
YOS9YDR057W RPN1P38764 993 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
YOS9YDR057W WSC3Q12215 556 aa8.67□□□□□ -1.02
YOS9YDR057W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
YOS9YDR057W VNX1P42839 908 aa8.64□□□□□ -1.03
YOS9YDR057W ATG36P46983 293 aa8.63□□□□□ -1.03
YOS9YDR057W TPO2P53283 614 aa8.6□□□□□ -1.03
YOS9YDR057W SIS1P25294 352 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
YOS9YDR057W RAM2P29703 316 aa8.58□□□□□ -1.04
YOS9YDR057W RPS0AP32905 252 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
YOS9YDR057W YML020WQ03722 664 aa8.57□□□□□ -1.04
YOS9YDR057W NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
YOS9YDR057W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
YOS9YDR057W SPP1Q03012 353 aa8.56□□□□□ -1.04
YOS9YDR057W FPR3P38911 411 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
YOS9YDR057W OSW7P43611 510 aa8.54□□□□□ -1.04
YOS9YDR057W RTS3P53289 263 aa8.53□□□□□ -1.04
YOS9YDR057W BRN1P38170 754 aa8.51□□□□□ -1.05
YOS9YDR057W LAM6Q08001 693 aa8.51□□□□□ -1.05
YOS9YDR057W TIF11P38912 153 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
YOS9YDR057W ENV11P53246 860 aa8.51□□□□□ -1.05
YOS9YDR057W SET4P42948 560 aa8.5□□□□□ -1.05
YOS9YDR057W YOL036WQ08206 761 aa8.5□□□□□ -1.05
YOS9YDR057W NHA1Q99271 985 aa8.5□□□□□ -1.05
YOS9YDR057W HSP82P02829 709 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
YOS9YDR057W SSA1P10591 642 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
YOS9YDR057W SSA2P10592 639 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
YOS9YDR057W MAK11P20484 414 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
YOS9YDR057W FAR11P53917 953 aa8.48□□□□□ -1.05
YOS9YDR057W SPT2P06843 333 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
YOS9YDR057W NOP7P53261 605 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
YOS9YDR057W SAM3Q08986 587 aa8.47□□□□□ -1.05
YOS9YDR057W NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data8.46□□□□□ -1.06not detected
YOS9YDR057W PLP2Q12017 286 aa8.46□□□□□ -1.06
YOS9YDR057W MSB4Q12317 492 aa8.46□□□□□ -1.06
YOS9YDR057W ISW1P38144 1129 aa8.44□□□□□ -1.06
YOS9YDR057W ULI1P43604 169 aa8.44□□□□□ -1.06
YOS9YDR057W MPP10P47083 593 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
YOS9YDR057W SPT16P32558 1035 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
YOS9YDR057W TLG1Q03322 224 aa8.43□□□□□ -1.06
YOS9YDR057W YPR148CQ06523 435 aa8.43□□□□□ -1.06
YOS9YDR057W YTA7P40340 1379 aa8.43□□□□□ -1.06
YOS9YDR057W MIF2P35201 549 aa8.43□□□□□ -1.06
YOS9YDR057W JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data8.43□□□□□ -1.06not detected
YOS9YDR057W DOS2P54858 310 aa8.43□□□□□ -1.06
YOS9YDR057W BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
YOS9YDR057W GEF1P37020 779 aa8.41□□□□□ -1.06
YOS9YDR057W IOC2Q12072 812 aa8.4□□□□□ -1.06
YOS9YDR057W RNA1P11745 407 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
YOS9YDR057W EDS1P38073 919 aa8.4□□□□□ -1.07
YOS9YDR057W CKB1P43639 278 aa8.4□□□□□ -1.07
YOS9YDR057W LDB19Q12502 818 aa8.4□□□□□ -1.07
YOS9YDR057W COQ8P27697 501 aa8.39□□□□□ -1.07
YOS9YDR057W SSF1P38789 453 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
YOS9YDR057W YJR008WP47085 338 aa8.39□□□□□ -1.07
YOS9YDR057W KIP3P53086 805 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
YOS9YDR057W TRP5P00931 707 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
YOS9YDR057W EAP1P36041 632 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
YOS9YDR057W GYP5Q12344 894 aa8.38□□□□□ -1.07
YOS9YDR057W SPC42P36094 363 aa8.37□□□□□ -1.07
YOS9YDR057W QCR6P00127 147 aa8.36□□□□□ -1.07
YOS9YDR057W PDR1P12383 1068 aa8.36□□□□□ -1.07
YOS9YDR057W ENP1P38333 483 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
YOS9YDR057W PTC3P34221 468 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YOS9YDR057W FKH1P40466 484 aa8.34□□□□□ -1.07
YOS9YDR057W ZDS1P50111 915 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YOS9YDR057W TAF13P11747 167 aa8.33□□□□□ -1.08
YOS9YDR057W TY4A-JP47023 414 aa8.33□□□□□ -1.08
YOS9YDR057W NOP53Q12080 455 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
YOS9YDR057W DAL5P15365 543 aa8.32□□□□□ -1.08
YOS9YDR057W DCW1P36091 449 aa8.32□□□□□ -1.08
YOS9YDR057W RPT2P40327 437 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
YOS9YDR057W BRE1Q07457 700 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
YOS9YDR057W SLX8P40072 274 aa8.32□□□□□ -1.08
YOS9YDR057W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
YOS9YDR057W GRE2Q12068 342 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
YOS9YDR057W HTA1P04911 132 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
YOS9YDR057W HTA2P04912 132 aa8.29□□□□□ -1.08
YOS9YDR057W HOS4P40480 1083 aa8.29□□□□□ -1.08
YOS9YDR057W YMR196WQ04336 1088 aa8.29□□□□□ -1.08
YOS9YDR057W RAD2P07276 1031 aa8.28□□□□□ -1.08
YOS9YDR057W RTG1P32607 177 aa8.28□□□□□ -1.08
YOS9YDR057W FUN12P39730 1002 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
YOS9YDR057W ATH1P48016 1211 aa8.27□□□□□ -1.09
YOS9YDR057W SEC20P28791 383 aa8.26□□□□□ -1.09
YOS9YDR057W SPT7P35177 1332 aa8.26□□□□□ -1.09
YOS9YDR057W YNL035CP53962 389 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
YOS9YDR057W GUT1P32190 709 aa8.24□□□□□ -1.09
YOS9YDR057W PAM1P37304 830 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
YOS9YDR057W SET1P38827 1080 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
YOS9YDR057W AIM21P40563 679 aa8.24□□□□□ -1.09
YOS9YDR057W MET10P39692 1035 aa8.23□□□□□ -1.09
YOS9YDR057W YEL023CP39992 682 aa8.23□□□□□ -1.09
YOS9YDR057W MRX12P47084 519 aa8.23□□□□□ -1.09
YOS9YDR057W GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
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