RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeastyeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRD1YCL057W YDR090CQ03193 310 aa8.36□□□□□ -1.07
PRD1YCL057W SOL3P38858 249 aa8.36□□□□□ -1.07
PRD1YCL057W YGR273CP53329 174 aa8.36□□□□□ -1.07
PRD1YCL057W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PRD1YCL057W YOL036WQ08206 761 aa8.35□□□□□ -1.07
PRD1YCL057W VHR2P40041 505 aa8.34□□□□□ -1.07
PRD1YCL057W ABP1P15891 592 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PRD1YCL057W DIT2P21595 489 aa8.33□□□□□ -1.08
PRD1YCL057W NST1P53935 1240 aa8.33□□□□□ -1.08
PRD1YCL057W AIM7Q12156 149 aa8.3□□□□□ -1.08
PRD1YCL057W MSB4Q12317 492 aa8.3□□□□□ -1.08
PRD1YCL057W SET4P42948 560 aa8.29□□□□□ -1.08
PRD1YCL057W KEX1P09620 729 aa8.28□□□□□ -1.08
PRD1YCL057W GLC3P32775 704 aa8.28□□□□□ -1.08
PRD1YCL057W DCW1P36091 449 aa8.28□□□□□ -1.08
PRD1YCL057W KIN1P13185 1064 aa8.27□□□□□ -1.09
PRD1YCL057W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data8.26□□□□□ -1.09not detected
PRD1YCL057W DMA2P53924 522 aa8.26□□□□□ -1.09
PRD1YCL057W HTA1P04911 132 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PRD1YCL057W HTA2P04912 132 aa8.25□□□□□ -1.09
PRD1YCL057W RAD54P32863 898 aa8.23□□□□□ -1.09
PRD1YCL057W AI4P03878 556 aa8.22□□□□□ -1.09
PRD1YCL057W MPH3P0CE00 602 aa8.21□□□□□ -1.09
PRD1YCL057W KIC1P38692 1080 aa8.21□□□□□ -1.09
PRD1YCL057W WSC3Q12215 556 aa8.21□□□□□ -1.1
PRD1YCL057W ILV3P39522 585 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PRD1YCL057W EAP1P36041 632 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PRD1YCL057W YEL023CP39992 682 aa8.18□□□□□ -1.1
PRD1YCL057W VNX1P42839 908 aa8.18□□□□□ -1.1
PRD1YCL057W YBL029C-AQ3E756 94 aa8.18□□□□□ -1.1
PRD1YCL057W PSE1P32337 1089 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PRD1YCL057W ATF2P53296 535 aa8.17□□□□□ -1.1
PRD1YCL057W ORC6P38826 435 aa8.16□□□□□ -1.1
PRD1YCL057W TRP5P00931 707 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
PRD1YCL057W PTC4P38089 393 aa8.14□□□□□ -1.11
PRD1YCL057W DAN4P47179 1161 aa8.14□□□□□ -1.11
PRD1YCL057W TIF11P38912 153 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PRD1YCL057W SLI15P38283 698 aa8.11□□□□□ -1.11
PRD1YCL057W GUA1P38625 525 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
PRD1YCL057W JIP4Q03361 876 aa8.11□□□□□ -1.11
PRD1YCL057W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PRD1YCL057W ULI1P43604 169 aa8.09□□□□□ -1.11
PRD1YCL057W IOC2Q12072 812 aa8.09□□□□□ -1.11
PRD1YCL057W UBP9P39967 754 aa8.09□□□□□ -1.11
PRD1YCL057W RGR1P19263 1082 aa8.08□□□□□ -1.12
PRD1YCL057W SPP1Q03012 353 aa8.07□□□□□ -1.12
PRD1YCL057W MVP1P40959 511 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PRD1YCL057W HPC2Q01448 625 aa8.05□□□□□ -1.12
PRD1YCL057W CSC1Q06538 782 aa8.03□□□□□ -1.12
PRD1YCL057W TEA1P47988 759 aa8.03□□□□□ -1.12
PRD1YCL057W YNL035CP53962 389 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PRD1YCL057W CDC73Q06697 393 aa8.01□□□□□ -1.13
PRD1YCL057W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PRD1YCL057W CLB5P30283 435 aa8□□□□□ -1.13
PRD1YCL057W HGH1P48362 394 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PRD1YCL057W CSN12P47130 423 aa7.98□□□□□ -1.13
PRD1YCL057W TFB4Q12004 338 aa7.98□□□□□ -1.13
PRD1YCL057W RLF2Q12495 606 aa7.97□□□□□ -1.13
PRD1YCL057W SEC61P32915 480 aa7.97□□□□□ -1.13
PRD1YCL057W MID1P41821 548 aa7.97□□□□□ -1.13
PRD1YCL057W PML39Q03760 334 aa7.97□□□□□ -1.13
PRD1YCL057W LDB19Q12502 818 aa7.97□□□□□ -1.13
PRD1YCL057W SSA2P10592 639 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.13
PRD1YCL057W RTG1P32607 177 aa7.96□□□□□ -1.14
PRD1YCL057W TFB3Q03290 321 aa7.96□□□□□ -1.14
PRD1YCL057W KTR1P27810 393 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PRD1YCL057W DPL1Q05567 589 aa7.95□□□□□ -1.14
PRD1YCL057W YPR109WQ06104 294 aa7.95□□□□□ -1.14
PRD1YCL057W NIS1P53939 407 aa7.94□□□□□ -1.14
PRD1YCL057W MPC54Q08550 464 aa7.94□□□□□ -1.14
PRD1YCL057W FPK1P53739 893 aa7.91□□□□□ -1.14
PRD1YCL057W BRL1P38770 471 aa7.9□□□□□ -1.14
PRD1YCL057W HST2P53686 357 aa7.9□□□□□ -1.14
PRD1YCL057W TUM1Q08686 304 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
PRD1YCL057W SIT4P20604 311 aa7.9□□□□□ -1.15
PRD1YCL057W PEX21P50091 288 aa7.9□□□□□ -1.15
PRD1YCL057W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PRD1YCL057W TYW1Q08960 810 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PRD1YCL057W PKC1P24583 1151 aa7.88□□□□□ -1.15
PRD1YCL057W ISU2Q12056 156 aa7.88□□□□□ -1.15
PRD1YCL057W PEX29Q03370 554 aa7.88□□□□□ -1.15
PRD1YCL057W NCR1Q12200 1170 aa7.88□□□□□ -1.15
PRD1YCL057W GLN1P32288 370 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
PRD1YCL057W NMA111P53920 997 aa7.87□□□□□ -1.15
PRD1YCL057W YDL129WQ07555 291 aa7.87□□□□□ -1.15
PRD1YCL057W YRR1Q12172 810 aa7.85□□□□□ -1.15
PRD1YCL057W YMR196WQ04336 1088 aa7.85□□□□□ -1.15
PRD1YCL057W FKH1P40466 484 aa7.84□□□□□ -1.15
PRD1YCL057W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PRD1YCL057W MMP1Q12372 583 aa7.84□□□□□ -1.16
PRD1YCL057W SCJ1P25303 377 aa7.82□□□□□ -1.16
PRD1YCL057W ESS1P22696 170 aa7.8□□□□□ -1.16
PRD1YCL057W RTF1P53064 558 aa7.79□□□□□ -1.16
PRD1YCL057W ARH1P48360 493 aa7.79□□□□□ -1.16
PRD1YCL057W RAD59Q12223 238 aa7.78□□□□□ -1.16
PRD1YCL057W YJU3P28321 313 aa7.78□□□□□ -1.16
PRD1YCL057W HAP5Q02516 242 aa7.78□□□□□ -1.16
PRD1YCL057W PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
PRD1YCL057W BIM1P40013 344 aa7.77□□□□□ -1.17
PRD1YCL057W YNL115CP53925 644 aa7.77□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12 ms