RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629992.2

PLCB1-218, Transcript of phospholipase C beta 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PLCB1, Length 3,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB1-218ENST00000629992 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.03■□□□□ 0.96
PLCB1-218ENST00000629992 FBLN2P98095 1184 aa21.01■□□□□ 0.95
PLCB1-218ENST00000629992 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.99■□□□□ 0.95
PLCB1-218ENST00000629992 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.98■□□□□ 0.95
PLCB1-218ENST00000629992 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
PLCB1-218ENST00000629992 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.9■□□□□ 0.94
PLCB1-218ENST00000629992 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
PLCB1-218ENST00000629992 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.9■□□□□ 0.94
PLCB1-218ENST00000629992 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
PLCB1-218ENST00000629992 KCNH8Q96L42 1107 aa20.88■□□□□ 0.93
PLCB1-218ENST00000629992 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PLCB1-218ENST00000629992 TOPBP1Q92547 1522 aa20.84■□□□□ 0.93
PLCB1-218ENST00000629992 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
PLCB1-218ENST00000629992 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.83■□□□□ 0.92
PLCB1-218ENST00000629992 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.82■□□□□ 0.92
PLCB1-218ENST00000629992 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.82■□□□□ 0.924e-8■■■■■ 31.9
PLCB1-218ENST00000629992 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.81■□□□□ 0.92
PLCB1-218ENST00000629992 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
PLCB1-218ENST00000629992 FOXD1Q16676 465 aa20.76■□□□□ 0.91
PLCB1-218ENST00000629992 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
PLCB1-218ENST00000629992 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.71■□□□□ 0.91
PLCB1-218ENST00000629992 TRIM52Q96A61 297 aa20.69■□□□□ 0.9
PLCB1-218ENST00000629992 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.67■□□□□ 0.9
PLCB1-218ENST00000629992 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
PLCB1-218ENST00000629992 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.64■□□□□ 0.9
PLCB1-218ENST00000629992 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.63■□□□□ 0.89
PLCB1-218ENST00000629992 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
PLCB1-218ENST00000629992 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PLCB1-218ENST00000629992 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.61■□□□□ 0.89
PLCB1-218ENST00000629992 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PLCB1-218ENST00000629992 SLC24A1O60721 1099 aa20.6■□□□□ 0.89
PLCB1-218ENST00000629992 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.6■□□□□ 0.89
PLCB1-218ENST00000629992 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PLCB1-218ENST00000629992 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.57■□□□□ 0.88
PLCB1-218ENST00000629992 TIAM1Q13009 1591 aa20.57■□□□□ 0.88
PLCB1-218ENST00000629992 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.55■□□□□ 0.88
PLCB1-218ENST00000629992 BCANQ96GW7 911 aa20.54■□□□□ 0.88
PLCB1-218ENST00000629992 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.52■□□□□ 0.88
PLCB1-218ENST00000629992 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
PLCB1-218ENST00000629992 PTPRKQ15262 1439 aa20.52■□□□□ 0.87
PLCB1-218ENST00000629992 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.51■□□□□ 0.87
PLCB1-218ENST00000629992 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PLCB1-218ENST00000629992 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.49■□□□□ 0.87
PLCB1-218ENST00000629992 ERCC6Q03468 1493 aa20.43■□□□□ 0.86
PLCB1-218ENST00000629992 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PLCB1-218ENST00000629992 MAPKBP1O60336 1514 aa20.41■□□□□ 0.86
PLCB1-218ENST00000629992 PRDM2Q13029 1718 aa20.41■□□□□ 0.86
PLCB1-218ENST00000629992 WDR97A6NE52 1622 aa20.39■□□□□ 0.85
PLCB1-218ENST00000629992 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.39■□□□□ 0.85
PLCB1-218ENST00000629992 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.39■□□□□ 0.85
PLCB1-218ENST00000629992 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.38■□□□□ 0.85
PLCB1-218ENST00000629992 FMN1Q68DA7 1419 aa20.36■□□□□ 0.85
PLCB1-218ENST00000629992 TONSLQ96HA7 1378 aa20.35■□□□□ 0.85
PLCB1-218ENST00000629992 NCOA2Q15596 1464 aa20.35■□□□□ 0.85
PLCB1-218ENST00000629992 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.35■□□□□ 0.85
PLCB1-218ENST00000629992 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
PLCB1-218ENST00000629992 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.3■□□□□ 0.84
PLCB1-218ENST00000629992 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.3■□□□□ 0.84
PLCB1-218ENST00000629992 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.28■□□□□ 0.84
PLCB1-218ENST00000629992 CLSPNQ9HAW4 1339 aa20.28■□□□□ 0.84
PLCB1-218ENST00000629992 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.26■□□□□ 0.83
PLCB1-218ENST00000629992 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PLCB1-218ENST00000629992 JPH4Q96JJ6 628 aa20.24■□□□□ 0.83
PLCB1-218ENST00000629992 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PLCB1-218ENST00000629992 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PLCB1-218ENST00000629992 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PLCB1-218ENST00000629992 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.22■□□□□ 0.83
PLCB1-218ENST00000629992 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PLCB1-218ENST00000629992 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.22■□□□□ 0.83
PLCB1-218ENST00000629992 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.21■□□□□ 0.83
PLCB1-218ENST00000629992 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.21■□□□□ 0.83
PLCB1-218ENST00000629992 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.21■□□□□ 0.83
PLCB1-218ENST00000629992 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.21■□□□□ 0.83
PLCB1-218ENST00000629992 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PLCB1-218ENST00000629992 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.19■□□□□ 0.82
PLCB1-218ENST00000629992 NAIPQ13075 1403 aa20.19■□□□□ 0.82
PLCB1-218ENST00000629992 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.19■□□□□ 0.82
PLCB1-218ENST00000629992 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.18■□□□□ 0.82
PLCB1-218ENST00000629992 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PLCB1-218ENST00000629992 CUL7Q14999 1698 aa20.17■□□□□ 0.82
PLCB1-218ENST00000629992 GRIN2BQ13224 1484 aa20.17■□□□□ 0.82
PLCB1-218ENST00000629992 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.826e-7■■■■□ 21.2
PLCB1-218ENST00000629992 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.823e-8■■□□□ 13.1
PLCB1-218ENST00000629992 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PLCB1-218ENST00000629992 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PLCB1-218ENST00000629992 CCDC184Q52MB2 194 aa20.15■□□□□ 0.82
PLCB1-218ENST00000629992 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
PLCB1-218ENST00000629992 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.14■□□□□ 0.81
PLCB1-218ENST00000629992 ANP32CO43423 234 aa20.13■□□□□ 0.81
PLCB1-218ENST00000629992 KDM6BO15054 1643 aa20.13■□□□□ 0.81
PLCB1-218ENST00000629992 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PLCB1-218ENST00000629992 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.12■□□□□ 0.81
PLCB1-218ENST00000629992 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PLCB1-218ENST00000629992 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.11■□□□□ 0.81
PLCB1-218ENST00000629992 FKBP8Q14318 412 aa20.11■□□□□ 0.81
PLCB1-218ENST00000629992 IQGAP2Q13576 1575 aa20.09■□□□□ 0.81
PLCB1-218ENST00000629992 RGL3Q3MIN7 710 aa20.08■□□□□ 0.81
PLCB1-218ENST00000629992 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.08■□□□□ 0.81
PLCB1-218ENST00000629992 MAP3K1Q13233 1512 aa20.08■□□□□ 0.8
PLCB1-218ENST00000629992 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms