RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598913.5

SAMD4B-208, Transcript of sterile alpha motif domain containing 4B, human

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SAMD4B, Length 2,877 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SAMD4B-208	ENST00000598913	NES	P48681	1621 aa		32.97	■■■□□ 2.87
SAMD4B-208	ENST00000598913	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		32.95	■■■□□ 2.87
SAMD4B-208	ENST00000598913	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		32.95	■■■□□ 2.86
SAMD4B-208	ENST00000598913	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SAMD4B-208	ENST00000598913	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SAMD4B-208	ENST00000598913	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SAMD4B-208	ENST00000598913	TIAM1	Q13009	1591 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SAMD4B-208	ENST00000598913	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SAMD4B-208	ENST00000598913	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
SAMD4B-208	ENST00000598913	MAPKBP1	O60336	1514 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SAMD4B-208	ENST00000598913	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SAMD4B-208	ENST00000598913	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
SAMD4B-208	ENST00000598913	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SAMD4B-208	ENST00000598913	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
SAMD4B-208	ENST00000598913	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
SAMD4B-208	ENST00000598913	PRDM2	Q13029	1718 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SAMD4B-208	ENST00000598913	WDR97	A6NE52	1622 aa		32.62	■■■□□ 2.81
SAMD4B-208	ENST00000598913	TOPBP1	Q92547	1522 aa		32.62	■■■□□ 2.81
SAMD4B-208	ENST00000598913	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
SAMD4B-208	ENST00000598913	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SAMD4B-208	ENST00000598913	BCAN	Q96GW7	911 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SAMD4B-208	ENST00000598913	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.51	■■■□□ 2.79
SAMD4B-208	ENST00000598913	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SAMD4B-208	ENST00000598913	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SAMD4B-208	ENST00000598913	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SAMD4B-208	ENST00000598913	MAP3K1	Q13233	1512 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SAMD4B-208	ENST00000598913	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SAMD4B-208	ENST00000598913	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
SAMD4B-208	ENST00000598913	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SAMD4B-208	ENST00000598913	TRIM52	Q96A61	297 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SAMD4B-208	ENST00000598913	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
SAMD4B-208	ENST00000598913	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SAMD4B-208	ENST00000598913	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SAMD4B-208	ENST00000598913	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SAMD4B-208	ENST00000598913	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SAMD4B-208	ENST00000598913	TONSL	Q96HA7	1378 aa		32.26	■■■□□ 2.75
SAMD4B-208	ENST00000598913	FOXD1	Q16676	465 aa		32.25	■■■□□ 2.75
SAMD4B-208	ENST00000598913	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SAMD4B-208	ENST00000598913	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SAMD4B-208	ENST00000598913	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SAMD4B-208	ENST00000598913	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	32.23	■■■□□ 2.75	6e-7	■■■■□ 25.9
SAMD4B-208	ENST00000598913	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.22	■■■□□ 2.75
SAMD4B-208	ENST00000598913	FKBP8	Q14318	412 aa		32.21	■■■□□ 2.75
SAMD4B-208	ENST00000598913	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SAMD4B-208	ENST00000598913	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SAMD4B-208	ENST00000598913	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		32.17	■■■□□ 2.74
SAMD4B-208	ENST00000598913	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		32.14	■■■□□ 2.74
SAMD4B-208	ENST00000598913	CUL7	Q14999	1698 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SAMD4B-208	ENST00000598913	ANP32C	O43423	234 aa		32.12	■■■□□ 2.73
SAMD4B-208	ENST00000598913	NAIP	Q13075	1403 aa		32.09	■■■□□ 2.73
SAMD4B-208	ENST00000598913	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SAMD4B-208	ENST00000598913	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SAMD4B-208	ENST00000598913	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		32.07	■■■□□ 2.72
SAMD4B-208	ENST00000598913	HFM1	A2PYH4	1435 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SAMD4B-208	ENST00000598913	GRIN2B	Q13224	1484 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SAMD4B-208	ENST00000598913	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
SAMD4B-208	ENST00000598913	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.01	■■■□□ 2.71
SAMD4B-208	ENST00000598913	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32	■■■□□ 2.71
SAMD4B-208	ENST00000598913	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		32	■■■□□ 2.71
SAMD4B-208	ENST00000598913	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		31.99	■■■□□ 2.71
SAMD4B-208	ENST00000598913	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		31.98	■■■□□ 2.71
SAMD4B-208	ENST00000598913	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
SAMD4B-208	ENST00000598913	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
SAMD4B-208	ENST00000598913	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		31.98	■■■□□ 2.71
SAMD4B-208	ENST00000598913	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	31.97	■■■□□ 2.71	4e-10	■■□□□ 12.8
SAMD4B-208	ENST00000598913	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		31.96	■■■□□ 2.71
SAMD4B-208	ENST00000598913	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	31.95	■■■□□ 2.71
SAMD4B-208	ENST00000598913	SAMD9	Q5K651	1589 aa		31.94	■■■□□ 2.7
SAMD4B-208	ENST00000598913	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
SAMD4B-208	ENST00000598913	KDM6B	O15054	1643 aa		31.9	■■■□□ 2.7
SAMD4B-208	ENST00000598913	CCDC184	Q52MB2	194 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SAMD4B-208	ENST00000598913	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SAMD4B-208	ENST00000598913	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SAMD4B-208	ENST00000598913	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SAMD4B-208	ENST00000598913	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	31.84	■■■□□ 2.69
SAMD4B-208	ENST00000598913	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
SAMD4B-208	ENST00000598913	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
SAMD4B-208	ENST00000598913	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	31.82	■■■□□ 2.68
SAMD4B-208	ENST00000598913	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SAMD4B-208	ENST00000598913	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SAMD4B-208	ENST00000598913	FBLN2	P98095	1184 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SAMD4B-208	ENST00000598913	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
SAMD4B-208	ENST00000598913	CCER2	I3L3R5	266 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SAMD4B-208	ENST00000598913	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SAMD4B-208	ENST00000598913	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
SAMD4B-208	ENST00000598913	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68
SAMD4B-208	ENST00000598913	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
SAMD4B-208	ENST00000598913	NEFL	P07196	543 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SAMD4B-208	ENST00000598913	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SAMD4B-208	ENST00000598913	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
SAMD4B-208	ENST00000598913	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SAMD4B-208	ENST00000598913	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
SAMD4B-208	ENST00000598913	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SAMD4B-208	ENST00000598913	IQGAP2	Q13576	1575 aa		31.68	■■■□□ 2.66
SAMD4B-208	ENST00000598913	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	31.67	■■■□□ 2.66
SAMD4B-208	ENST00000598913	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		31.66	■■■□□ 2.66
SAMD4B-208	ENST00000598913	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	31.66	■■■□□ 2.66
SAMD4B-208	ENST00000598913	ARHGEF11	O15085	1522 aa		31.64	■■■□□ 2.66
SAMD4B-208	ENST00000598913	PBRM1	Q86U86	1689 aa		31.6	■■■□□ 2.65
SAMD4B-208	ENST00000598913	HECW1	Q76N89	1606 aa		31.58	■■■□□ 2.65

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