RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592385.5

HDAC5-211, Transcript of histone deacetylase 5, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC5, Length 2,601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5-211ENST00000592385 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.51■■□□□ 1.19
HDAC5-211ENST00000592385 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.51■■□□□ 1.19
HDAC5-211ENST00000592385 NESP48681 1621 aa22.5■■□□□ 1.19
HDAC5-211ENST00000592385 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.49■■□□□ 1.19
HDAC5-211ENST00000592385 WDR97A6NE52 1622 aa22.46■■□□□ 1.19
HDAC5-211ENST00000592385 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
HDAC5-211ENST00000592385 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.46■■□□□ 1.19
HDAC5-211ENST00000592385 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.181e-6■■■■□ 22.8
HDAC5-211ENST00000592385 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.42■■□□□ 1.18
HDAC5-211ENST00000592385 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
HDAC5-211ENST00000592385 MIER1Q8N108 512 aa22.38■■□□□ 1.17
HDAC5-211ENST00000592385 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.37■■□□□ 1.17
HDAC5-211ENST00000592385 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.37■■□□□ 1.17
HDAC5-211ENST00000592385 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.36■■□□□ 1.17
HDAC5-211ENST00000592385 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.36■■□□□ 1.17
HDAC5-211ENST00000592385 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.35■■□□□ 1.17
HDAC5-211ENST00000592385 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
HDAC5-211ENST00000592385 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.33■■□□□ 1.17
HDAC5-211ENST00000592385 ITGAEP38570 1179 aa22.32■■□□□ 1.16
HDAC5-211ENST00000592385 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.32■■□□□ 1.16
HDAC5-211ENST00000592385 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.32■■□□□ 1.16
HDAC5-211ENST00000592385 P3H3Q8IVL6 736 aa22.31■■□□□ 1.16
HDAC5-211ENST00000592385 FMN1Q68DA7 1419 aa22.31■■□□□ 1.16
HDAC5-211ENST00000592385 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
HDAC5-211ENST00000592385 MAPKBP1O60336 1514 aa22.29■■□□□ 1.16
HDAC5-211ENST00000592385 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.27■■□□□ 1.16
HDAC5-211ENST00000592385 SAMD9Q5K651 1589 aa22.27■■□□□ 1.16
HDAC5-211ENST00000592385 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.24■■□□□ 1.15
HDAC5-211ENST00000592385 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.22■■□□□ 1.15
HDAC5-211ENST00000592385 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HDAC5-211ENST00000592385 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HDAC5-211ENST00000592385 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HDAC5-211ENST00000592385 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
HDAC5-211ENST00000592385 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
HDAC5-211ENST00000592385 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
HDAC5-211ENST00000592385 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.14■■□□□ 1.13
HDAC5-211ENST00000592385 GRIN2BQ13224 1484 aa22.13■■□□□ 1.13
HDAC5-211ENST00000592385 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.13■■□□□ 1.13
HDAC5-211ENST00000592385 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC5-211ENST00000592385 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC5-211ENST00000592385 PBRM1Q86U86 1689 aa22.08■■□□□ 1.13
HDAC5-211ENST00000592385 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC5-211ENST00000592385 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.06■■□□□ 1.12
HDAC5-211ENST00000592385 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
HDAC5-211ENST00000592385 NCOA2Q15596 1464 aa22.03■■□□□ 1.12
HDAC5-211ENST00000592385 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.02■■□□□ 1.12
HDAC5-211ENST00000592385 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.01■■□□□ 1.11
HDAC5-211ENST00000592385 HFM1A2PYH4 1435 aa22■■□□□ 1.11
HDAC5-211ENST00000592385 ADAMTS12P58397 1594 aa22■■□□□ 1.11
HDAC5-211ENST00000592385 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.99■■□□□ 1.11
HDAC5-211ENST00000592385 ARHGEF11O15085 1522 aa21.99■■□□□ 1.11
HDAC5-211ENST00000592385 IQGAP2Q13576 1575 aa21.98■■□□□ 1.11
HDAC5-211ENST00000592385 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.98■■□□□ 1.11
HDAC5-211ENST00000592385 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.97■■□□□ 1.11
HDAC5-211ENST00000592385 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.97■■□□□ 1.11
HDAC5-211ENST00000592385 HECW1Q76N89 1606 aa21.96■■□□□ 1.11
HDAC5-211ENST00000592385 PTPRKQ15262 1439 aa21.95■■□□□ 1.1
HDAC5-211ENST00000592385 UACAQ9BZF9 1416 aa21.94■■□□□ 1.1
HDAC5-211ENST00000592385 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.91■■□□□ 1.1
HDAC5-211ENST00000592385 NAIPQ13075 1403 aa21.9■■□□□ 1.1
HDAC5-211ENST00000592385 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
HDAC5-211ENST00000592385 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
HDAC5-211ENST00000592385 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
HDAC5-211ENST00000592385 IFT140Q96RY7 1462 aa21.87■■□□□ 1.09
HDAC5-211ENST00000592385 WDR62O43379 1518 aa21.85■■□□□ 1.09
HDAC5-211ENST00000592385 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.82■■□□□ 1.08
HDAC5-211ENST00000592385 AKNAQ7Z591 1439 aa21.82■■□□□ 1.08
HDAC5-211ENST00000592385 TONSLQ96HA7 1378 aa21.81■■□□□ 1.08
HDAC5-211ENST00000592385 MIA2Q96PC5 1412 aa21.81■■□□□ 1.08
HDAC5-211ENST00000592385 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.77■■□□□ 1.08
HDAC5-211ENST00000592385 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
HDAC5-211ENST00000592385 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
HDAC5-211ENST00000592385 KIAA0556O60303 1618 aa21.75■■□□□ 1.07
HDAC5-211ENST00000592385 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
HDAC5-211ENST00000592385 DISP1Q96F81 1524 aa21.71■■□□□ 1.07
HDAC5-211ENST00000592385 GRIN2AQ12879 1464 aa21.69■■□□□ 1.06
HDAC5-211ENST00000592385 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
HDAC5-211ENST00000592385 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.69■■□□□ 1.06
HDAC5-211ENST00000592385 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.66■■□□□ 1.06
HDAC5-211ENST00000592385 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.66■■□□□ 1.06
HDAC5-211ENST00000592385 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
HDAC5-211ENST00000592385 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
HDAC5-211ENST00000592385 KCNH8Q96L42 1107 aa21.63■■□□□ 1.05
HDAC5-211ENST00000592385 KDM6BO15054 1643 aa21.63■■□□□ 1.05
HDAC5-211ENST00000592385 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.63■■□□□ 1.05
HDAC5-211ENST00000592385 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
HDAC5-211ENST00000592385 CCER2I3L3R5 266 aa21.62■■□□□ 1.05
HDAC5-211ENST00000592385 ROCK1Q13464 1354 aa21.62■■□□□ 1.05
HDAC5-211ENST00000592385 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
HDAC5-211ENST00000592385 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
HDAC5-211ENST00000592385 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
HDAC5-211ENST00000592385 DAPK1P53355 1430 aa21.59■■□□□ 1.05
HDAC5-211ENST00000592385 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
HDAC5-211ENST00000592385 ANP32CO43423 234 aa21.58■■□□□ 1.04
HDAC5-211ENST00000592385 TRIM52Q96A61 297 aa21.57■■□□□ 1.04
HDAC5-211ENST00000592385 SYNJ2O15056 1496 aa21.55■■□□□ 1.04
HDAC5-211ENST00000592385 ABCC5O15440 1437 aa21.55■■□□□ 1.04
HDAC5-211ENST00000592385 ARID3CA6NKF2 412 aa21.55■■□□□ 1.04
HDAC5-211ENST00000592385 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.55■■□□□ 1.04
HDAC5-211ENST00000592385 ERCC6Q03468 1493 aa21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 663.5 ms