RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589130.5

MAP4K1-208, Transcript of mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene MAP4K1, Length 2,654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K1-208ENST00000589130 P3H3Q8IVL6 736 aa23.93■■□□□ 1.42
MAP4K1-208ENST00000589130 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
MAP4K1-208ENST00000589130 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
MAP4K1-208ENST00000589130 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
MAP4K1-208ENST00000589130 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
MAP4K1-208ENST00000589130 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.86■■□□□ 1.41
MAP4K1-208ENST00000589130 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
MAP4K1-208ENST00000589130 TOPBP1Q92547 1522 aa23.83■■□□□ 1.41
MAP4K1-208ENST00000589130 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.83■■□□□ 1.4
MAP4K1-208ENST00000589130 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
MAP4K1-208ENST00000589130 TIAM1Q13009 1591 aa23.8■■□□□ 1.4
MAP4K1-208ENST00000589130 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.76■■□□□ 1.39
MAP4K1-208ENST00000589130 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.75■■□□□ 1.39
MAP4K1-208ENST00000589130 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.72■■□□□ 1.39
MAP4K1-208ENST00000589130 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
MAP4K1-208ENST00000589130 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.72■■□□□ 1.39
MAP4K1-208ENST00000589130 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.71■■□□□ 1.39
MAP4K1-208ENST00000589130 IFT140Q96RY7 1462 aa23.67■■□□□ 1.38
MAP4K1-208ENST00000589130 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.67■■□□□ 1.38
MAP4K1-208ENST00000589130 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
MAP4K1-208ENST00000589130 MAP3K1Q13233 1512 aa23.66■■□□□ 1.38
MAP4K1-208ENST00000589130 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
MAP4K1-208ENST00000589130 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.65■■□□□ 1.38
MAP4K1-208ENST00000589130 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.6■■□□□ 1.37
MAP4K1-208ENST00000589130 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
MAP4K1-208ENST00000589130 CUL7Q14999 1698 aa23.58■■□□□ 1.37
MAP4K1-208ENST00000589130 WDR97A6NE52 1622 aa23.58■■□□□ 1.36
MAP4K1-208ENST00000589130 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.56■■□□□ 1.36
MAP4K1-208ENST00000589130 MAPKBP1O60336 1514 aa23.55■■□□□ 1.36
MAP4K1-208ENST00000589130 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.53■■□□□ 1.36
MAP4K1-208ENST00000589130 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.52■■□□□ 1.35
MAP4K1-208ENST00000589130 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.51■■□□□ 1.35
MAP4K1-208ENST00000589130 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.51■■□□□ 1.35
MAP4K1-208ENST00000589130 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.49■■□□□ 1.35
MAP4K1-208ENST00000589130 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.49■■□□□ 1.35
MAP4K1-208ENST00000589130 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.47■■□□□ 1.35
MAP4K1-208ENST00000589130 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
MAP4K1-208ENST00000589130 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
MAP4K1-208ENST00000589130 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.44■■□□□ 1.34
MAP4K1-208ENST00000589130 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
MAP4K1-208ENST00000589130 FMN1Q68DA7 1419 aa23.41■■□□□ 1.34
MAP4K1-208ENST00000589130 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.39■■□□□ 1.33
MAP4K1-208ENST00000589130 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.37■■□□□ 1.33
MAP4K1-208ENST00000589130 SAMD9Q5K651 1589 aa23.37■■□□□ 1.33
MAP4K1-208ENST00000589130 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.36■■□□□ 1.33
MAP4K1-208ENST00000589130 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.34■■□□□ 1.33
MAP4K1-208ENST00000589130 PTPRKQ15262 1439 aa23.3■■□□□ 1.32
MAP4K1-208ENST00000589130 GRIN2BQ13224 1484 aa23.29■■□□□ 1.32
MAP4K1-208ENST00000589130 KCNH8Q96L42 1107 aa23.27■■□□□ 1.32
MAP4K1-208ENST00000589130 PBRM1Q86U86 1689 aa23.26■■□□□ 1.31
MAP4K1-208ENST00000589130 NCOA2Q15596 1464 aa23.26■■□□□ 1.31
MAP4K1-208ENST00000589130 ARID3CA6NKF2 412 aa23.26■■□□□ 1.31
MAP4K1-208ENST00000589130 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
MAP4K1-208ENST00000589130 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
MAP4K1-208ENST00000589130 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.22■■□□□ 1.31
MAP4K1-208ENST00000589130 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
MAP4K1-208ENST00000589130 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.19■■□□□ 1.3
MAP4K1-208ENST00000589130 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.19■■□□□ 1.3
MAP4K1-208ENST00000589130 CHD1O14646 1710 aa23.18■■□□□ 1.3
MAP4K1-208ENST00000589130 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
MAP4K1-208ENST00000589130 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
MAP4K1-208ENST00000589130 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.14■■□□□ 1.3
MAP4K1-208ENST00000589130 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.14■■□□□ 1.29
MAP4K1-208ENST00000589130 ADAMTS12P58397 1594 aa23.14■■□□□ 1.29
MAP4K1-208ENST00000589130 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.14■■□□□ 1.29
MAP4K1-208ENST00000589130 HFM1A2PYH4 1435 aa23.14■■□□□ 1.29
MAP4K1-208ENST00000589130 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
MAP4K1-208ENST00000589130 IQGAP2Q13576 1575 aa23.12■■□□□ 1.29
MAP4K1-208ENST00000589130 NAIPQ13075 1403 aa23.12■■□□□ 1.29
MAP4K1-208ENST00000589130 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
MAP4K1-208ENST00000589130 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.11■■□□□ 1.29
MAP4K1-208ENST00000589130 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
MAP4K1-208ENST00000589130 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.11■■□□□ 1.29
MAP4K1-208ENST00000589130 OSCARQ8IYS5 282 aa23.09■■□□□ 1.29
MAP4K1-208ENST00000589130 SYNJ2O15056 1496 aa23.08■■□□□ 1.28
MAP4K1-208ENST00000589130 UACAQ9BZF9 1416 aa23.07■■□□□ 1.28
MAP4K1-208ENST00000589130 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
MAP4K1-208ENST00000589130 ARHGEF11O15085 1522 aa23.06■■□□□ 1.28
MAP4K1-208ENST00000589130 HECW1Q76N89 1606 aa23.05■■□□□ 1.28
MAP4K1-208ENST00000589130 TONSLQ96HA7 1378 aa23.04■■□□□ 1.28
MAP4K1-208ENST00000589130 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.04■■□□□ 1.28
MAP4K1-208ENST00000589130 KDM6BO15054 1643 aa22.98■■□□□ 1.27
MAP4K1-208ENST00000589130 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.97■■□□□ 1.27
MAP4K1-208ENST00000589130 TRIM52Q96A61 297 aa22.95■■□□□ 1.27
MAP4K1-208ENST00000589130 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
MAP4K1-208ENST00000589130 DISP1Q96F81 1524 aa22.92■■□□□ 1.26
MAP4K1-208ENST00000589130 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
MAP4K1-208ENST00000589130 GRIN2AQ12879 1464 aa22.91■■□□□ 1.26
MAP4K1-208ENST00000589130 FOXD1Q16676 465 aa22.91■■□□□ 1.26
MAP4K1-208ENST00000589130 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
MAP4K1-208ENST00000589130 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.89■■□□□ 1.26
MAP4K1-208ENST00000589130 KIAA0556O60303 1618 aa22.89■■□□□ 1.26
MAP4K1-208ENST00000589130 BCANQ96GW7 911 aa22.89■■□□□ 1.25
MAP4K1-208ENST00000589130 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
MAP4K1-208ENST00000589130 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.88■■□□□ 1.25
MAP4K1-208ENST00000589130 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.87■■□□□ 1.25
MAP4K1-208ENST00000589130 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
MAP4K1-208ENST00000589130 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.86■■□□□ 1.25
MAP4K1-208ENST00000589130 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.86■■□□□ 1.25
MAP4K1-208ENST00000589130 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.86■■□□□ 1.25
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