RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583444.1

SLC16A3-218, Transcript of solute carrier family 16 member 3, humanhuman

Gene SLC16A3, Length 2,882 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A3-218ENST00000583444 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.15■■■□□ 2.1
SLC16A3-218ENST00000583444 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
SLC16A3-218ENST00000583444 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.03■■■□□ 2.08
SLC16A3-218ENST00000583444 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
SLC16A3-218ENST00000583444 WDR97A6NE52 1622 aa27.97■■■□□ 2.07
SLC16A3-218ENST00000583444 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.96■■■□□ 2.07
SLC16A3-218ENST00000583444 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.95■■■□□ 2.07
SLC16A3-218ENST00000583444 CUL7Q14999 1698 aa27.93■■■□□ 2.06
SLC16A3-218ENST00000583444 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.93■■■□□ 2.06
SLC16A3-218ENST00000583444 P3H3Q8IVL6 736 aa27.93■■■□□ 2.06
SLC16A3-218ENST00000583444 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.86■■■□□ 2.05
SLC16A3-218ENST00000583444 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
SLC16A3-218ENST00000583444 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
SLC16A3-218ENST00000583444 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.82■■■□□ 2.04
SLC16A3-218ENST00000583444 KCNH8Q96L42 1107 aa27.79■■■□□ 2.04
SLC16A3-218ENST00000583444 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.79■■■□□ 2.04
SLC16A3-218ENST00000583444 TIAM1Q13009 1591 aa27.78■■■□□ 2.04
SLC16A3-218ENST00000583444 MAP3K1Q13233 1512 aa27.78■■■□□ 2.04
SLC16A3-218ENST00000583444 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.78■■■□□ 2.04
SLC16A3-218ENST00000583444 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
SLC16A3-218ENST00000583444 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.76■■■□□ 2.03
SLC16A3-218ENST00000583444 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
SLC16A3-218ENST00000583444 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.74■■■□□ 2.03
SLC16A3-218ENST00000583444 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.74■■■□□ 2.03
SLC16A3-218ENST00000583444 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.73■■■□□ 2.03
SLC16A3-218ENST00000583444 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.71■■■□□ 2.03
SLC16A3-218ENST00000583444 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
SLC16A3-218ENST00000583444 MAPKBP1O60336 1514 aa27.69■■■□□ 2.02
SLC16A3-218ENST00000583444 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.67■■■□□ 2.02
SLC16A3-218ENST00000583444 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.64■■■□□ 2.02
SLC16A3-218ENST00000583444 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.01
SLC16A3-218ENST00000583444 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.63■■■□□ 2.01
SLC16A3-218ENST00000583444 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
SLC16A3-218ENST00000583444 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.6■■■□□ 2.01
SLC16A3-218ENST00000583444 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.59■■■□□ 2.01
SLC16A3-218ENST00000583444 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.58■■■□□ 2.014e-15■■■■■ 39.8
SLC16A3-218ENST00000583444 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.58■■■□□ 2.01
SLC16A3-218ENST00000583444 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
SLC16A3-218ENST00000583444 SAMD9Q5K651 1589 aa27.55■■■□□ 2
SLC16A3-218ENST00000583444 PBRM1Q86U86 1689 aa27.55■■■□□ 2
SLC16A3-218ENST00000583444 FMN1Q68DA7 1419 aa27.53■■■□□ 2
SLC16A3-218ENST00000583444 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.49■■□□□ 1.99
SLC16A3-218ENST00000583444 WDR62O43379 1518 aa27.46■■□□□ 1.99
SLC16A3-218ENST00000583444 ADAMTS12P58397 1594 aa27.44■■□□□ 1.98
SLC16A3-218ENST00000583444 GRIN2BQ13224 1484 aa27.41■■□□□ 1.98
SLC16A3-218ENST00000583444 IFT140Q96RY7 1462 aa27.41■■□□□ 1.98
SLC16A3-218ENST00000583444 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
SLC16A3-218ENST00000583444 BCANQ96GW7 911 aa27.36■■□□□ 1.97
SLC16A3-218ENST00000583444 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.36■■□□□ 1.97
SLC16A3-218ENST00000583444 IQGAP2Q13576 1575 aa27.33■■□□□ 1.97
SLC16A3-218ENST00000583444 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
SLC16A3-218ENST00000583444 ERCC6Q03468 1493 aa27.29■■□□□ 1.96
SLC16A3-218ENST00000583444 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
SLC16A3-218ENST00000583444 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.27■■□□□ 1.96
SLC16A3-218ENST00000583444 PTPRKQ15262 1439 aa27.25■■□□□ 1.95
SLC16A3-218ENST00000583444 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.24■■□□□ 1.952e-9■□□□□ 9.6
SLC16A3-218ENST00000583444 TRIM52Q96A61 297 aa27.23■■□□□ 1.95
SLC16A3-218ENST00000583444 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
SLC16A3-218ENST00000583444 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.21■■□□□ 1.95
SLC16A3-218ENST00000583444 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa27.2■■□□□ 1.94
SLC16A3-218ENST00000583444 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.18■■□□□ 1.94
SLC16A3-218ENST00000583444 FKBP8Q14318 412 aa27.17■■□□□ 1.94
SLC16A3-218ENST00000583444 NCOA2Q15596 1464 aa27.16■■□□□ 1.94
SLC16A3-218ENST00000583444 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.16■■□□□ 1.94
SLC16A3-218ENST00000583444 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.14■■□□□ 1.94
SLC16A3-218ENST00000583444 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.14■■□□□ 1.93
SLC16A3-218ENST00000583444 HECW1Q76N89 1606 aa27.13■■□□□ 1.93
SLC16A3-218ENST00000583444 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
SLC16A3-218ENST00000583444 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.13■■□□□ 1.93
SLC16A3-218ENST00000583444 GRIN2AQ12879 1464 aa27.13■■□□□ 1.93
SLC16A3-218ENST00000583444 TONSLQ96HA7 1378 aa27.12■■□□□ 1.93
SLC16A3-218ENST00000583444 ARID3CA6NKF2 412 aa27.12■■□□□ 1.93
SLC16A3-218ENST00000583444 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.11■■□□□ 1.93
SLC16A3-218ENST00000583444 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.1■■□□□ 1.93
SLC16A3-218ENST00000583444 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.08■■□□□ 1.93
SLC16A3-218ENST00000583444 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
SLC16A3-218ENST00000583444 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.07■■□□□ 1.92
SLC16A3-218ENST00000583444 ARHGEF11O15085 1522 aa27.07■■□□□ 1.92
SLC16A3-218ENST00000583444 ANP32CO43423 234 aa27.06■■□□□ 1.92
SLC16A3-218ENST00000583444 DISP1Q96F81 1524 aa27.06■■□□□ 1.92
SLC16A3-218ENST00000583444 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
SLC16A3-218ENST00000583444 KIAA0556O60303 1618 aa27.04■■□□□ 1.92
SLC16A3-218ENST00000583444 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
SLC16A3-218ENST00000583444 HFM1A2PYH4 1435 aa27.02■■□□□ 1.92
SLC16A3-218ENST00000583444 NAIPQ13075 1403 aa27.02■■□□□ 1.92
SLC16A3-218ENST00000583444 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.01■■□□□ 1.91
SLC16A3-218ENST00000583444 UACAQ9BZF9 1416 aa27■■□□□ 1.91
SLC16A3-218ENST00000583444 SYNJ2O15056 1496 aa26.99■■□□□ 1.91
SLC16A3-218ENST00000583444 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
SLC16A3-218ENST00000583444 CEP170Q5SW79 1584 aa26.96■■□□□ 1.91
SLC16A3-218ENST00000583444 FOXD1Q16676 465 aa26.93■■□□□ 1.9
SLC16A3-218ENST00000583444 CCER2I3L3R5 266 aa26.91■■□□□ 1.9
SLC16A3-218ENST00000583444 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
SLC16A3-218ENST00000583444 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
SLC16A3-218ENST00000583444 FBLN2P98095 1184 aa26.88■■□□□ 1.89
SLC16A3-218ENST00000583444 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.88■■□□□ 1.89
SLC16A3-218ENST00000583444 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.87■■□□□ 1.89
SLC16A3-218ENST00000583444 NUP160Q12769 1436 aa26.86■■□□□ 1.89
SLC16A3-218ENST00000583444 KDM6BO15054 1643 aa26.84■■□□□ 1.89
SLC16A3-218ENST00000583444 MIA2Q96PC5 1412 aa26.83■■□□□ 1.89
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