RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574278.5

STRA6-218, Transcript of stimulated by retinoic acid 6, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene STRA6, Length 2,455 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6-218ENST00000574278 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
STRA6-218ENST00000574278 TIAM1Q13009 1591 aa22.72■■□□□ 1.23
STRA6-218ENST00000574278 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.72■■□□□ 1.23
STRA6-218ENST00000574278 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.69■■□□□ 1.22
STRA6-218ENST00000574278 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.68■■□□□ 1.22
STRA6-218ENST00000574278 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.67■■□□□ 1.22
STRA6-218ENST00000574278 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.66■■□□□ 1.22
STRA6-218ENST00000574278 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.65■■□□□ 1.22
STRA6-218ENST00000574278 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.65■■□□□ 1.22
STRA6-218ENST00000574278 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
STRA6-218ENST00000574278 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
STRA6-218ENST00000574278 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
STRA6-218ENST00000574278 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.6■■□□□ 1.21
STRA6-218ENST00000574278 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.6■■□□□ 1.21
STRA6-218ENST00000574278 MAP3K1Q13233 1512 aa22.59■■□□□ 1.21
STRA6-218ENST00000574278 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
STRA6-218ENST00000574278 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.53■■□□□ 1.2
STRA6-218ENST00000574278 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.52■■□□□ 1.2
STRA6-218ENST00000574278 CUL7Q14999 1698 aa22.52■■□□□ 1.2
STRA6-218ENST00000574278 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.49■■□□□ 1.19
STRA6-218ENST00000574278 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.47■■□□□ 1.19
STRA6-218ENST00000574278 WDR97A6NE52 1622 aa22.47■■□□□ 1.19
STRA6-218ENST00000574278 MAPKBP1O60336 1514 aa22.47■■□□□ 1.19
STRA6-218ENST00000574278 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.46■■□□□ 1.19
STRA6-218ENST00000574278 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.46■■□□□ 1.19
STRA6-218ENST00000574278 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.45■■□□□ 1.18
STRA6-218ENST00000574278 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.44■■□□□ 1.18
STRA6-218ENST00000574278 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.43■■□□□ 1.18
STRA6-218ENST00000574278 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.42■■□□□ 1.18
STRA6-218ENST00000574278 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.41■■□□□ 1.18
STRA6-218ENST00000574278 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.41■■□□□ 1.18
STRA6-218ENST00000574278 FMN1Q68DA7 1419 aa22.37■■□□□ 1.17
STRA6-218ENST00000574278 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.17
STRA6-218ENST00000574278 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.37■■□□□ 1.17
STRA6-218ENST00000574278 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.34■■□□□ 1.17
STRA6-218ENST00000574278 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.3■■□□□ 1.16
STRA6-218ENST00000574278 SAMD9Q5K651 1589 aa22.29■■□□□ 1.16
STRA6-218ENST00000574278 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.29■■□□□ 1.16
STRA6-218ENST00000574278 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
STRA6-218ENST00000574278 PTPRKQ15262 1439 aa22.24■■□□□ 1.15
STRA6-218ENST00000574278 GRIN2BQ13224 1484 aa22.23■■□□□ 1.15
STRA6-218ENST00000574278 ARID3CA6NKF2 412 aa22.21■■□□□ 1.15
STRA6-218ENST00000574278 NCOA2Q15596 1464 aa22.21■■□□□ 1.15
STRA6-218ENST00000574278 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
STRA6-218ENST00000574278 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
STRA6-218ENST00000574278 PBRM1Q86U86 1689 aa22.16■■□□□ 1.14
STRA6-218ENST00000574278 KCNH8Q96L42 1107 aa22.16■■□□□ 1.14
STRA6-218ENST00000574278 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.15■■□□□ 1.14
STRA6-218ENST00000574278 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.15■■□□□ 1.14
STRA6-218ENST00000574278 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.14■■□□□ 1.14
STRA6-218ENST00000574278 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
STRA6-218ENST00000574278 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
STRA6-218ENST00000574278 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.11■■□□□ 1.13
STRA6-218ENST00000574278 HFM1A2PYH4 1435 aa22.1■■□□□ 1.13
STRA6-218ENST00000574278 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.1■■□□□ 1.13
STRA6-218ENST00000574278 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.09■■□□□ 1.13
STRA6-218ENST00000574278 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
STRA6-218ENST00000574278 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
STRA6-218ENST00000574278 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
STRA6-218ENST00000574278 IQGAP2Q13576 1575 aa22.09■■□□□ 1.13
STRA6-218ENST00000574278 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.09■■□□□ 1.13
STRA6-218ENST00000574278 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.08■■□□□ 1.13
STRA6-218ENST00000574278 ADAMTS12P58397 1594 aa22.08■■□□□ 1.12
STRA6-218ENST00000574278 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
STRA6-218ENST00000574278 NAIPQ13075 1403 aa22.07■■□□□ 1.12
STRA6-218ENST00000574278 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
STRA6-218ENST00000574278 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.06■■□□□ 1.12
STRA6-218ENST00000574278 UACAQ9BZF9 1416 aa22.04■■□□□ 1.12
STRA6-218ENST00000574278 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.03■■□□□ 1.12
STRA6-218ENST00000574278 TONSLQ96HA7 1378 aa22.03■■□□□ 1.12
STRA6-218ENST00000574278 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
STRA6-218ENST00000574278 HECW1Q76N89 1606 aa22.01■■□□□ 1.11
STRA6-218ENST00000574278 ARHGEF11O15085 1522 aa22■■□□□ 1.11
STRA6-218ENST00000574278 BCL11AQ9H165 835 aa21.98■■□□□ 1.11
STRA6-218ENST00000574278 WDR62O43379 1518 aa21.95■■□□□ 1.1
STRA6-218ENST00000574278 TRIM52Q96A61 297 aa21.95■■□□□ 1.1
STRA6-218ENST00000574278 IFT140Q96RY7 1462 aa21.93■■□□□ 1.1
STRA6-218ENST00000574278 KDM6BO15054 1643 aa21.92■■□□□ 1.1
STRA6-218ENST00000574278 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
STRA6-218ENST00000574278 DISP1Q96F81 1524 aa21.88■■□□□ 1.09
STRA6-218ENST00000574278 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
STRA6-218ENST00000574278 FOXD1Q16676 465 aa21.87■■□□□ 1.09
STRA6-218ENST00000574278 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
STRA6-218ENST00000574278 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
STRA6-218ENST00000574278 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.85■■□□□ 1.09
STRA6-218ENST00000574278 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
STRA6-218ENST00000574278 FBLN2P98095 1184 aa21.85■■□□□ 1.09
STRA6-218ENST00000574278 KIAA0556O60303 1618 aa21.85■■□□□ 1.09
STRA6-218ENST00000574278 GRIN2AQ12879 1464 aa21.83■■□□□ 1.09
STRA6-218ENST00000574278 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.83■■□□□ 1.08
STRA6-218ENST00000574278 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.83■■□□□ 1.08
STRA6-218ENST00000574278 MIA2Q96PC5 1412 aa21.82■■□□□ 1.08
STRA6-218ENST00000574278 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
STRA6-218ENST00000574278 ERCC6Q03468 1493 aa21.82■■□□□ 1.08
STRA6-218ENST00000574278 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.8■■□□□ 1.08
STRA6-218ENST00000574278 ANP32CO43423 234 aa21.79■■□□□ 1.08
STRA6-218ENST00000574278 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
STRA6-218ENST00000574278 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.77■■□□□ 1.08
STRA6-218ENST00000574278 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.76■■□□□ 1.07
STRA6-218ENST00000574278 DAPK1P53355 1430 aa21.75■■□□□ 1.07
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