RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568288.5

UBE2I-218, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 I, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2I, Length 501 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2I-218ENST00000568288 GOLGA3Q08378 1498 aa28.75■■■□□ 2.19
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UBE2I-218ENST00000568288 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
UBE2I-218ENST00000568288 IQGAP2Q13576 1575 aa28.69■■■□□ 2.18
UBE2I-218ENST00000568288 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.68■■■□□ 2.18
UBE2I-218ENST00000568288 SHROOM2Q13796 1616 aa28.65■■■□□ 2.18
UBE2I-218ENST00000568288 JPH4Q96JJ6 628 aa28.64■■■□□ 2.18
UBE2I-218ENST00000568288 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.58■■■□□ 2.17
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UBE2I-218ENST00000568288 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.56■■■□□ 2.16
UBE2I-218ENST00000568288 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
UBE2I-218ENST00000568288 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.56■■■□□ 2.16
UBE2I-218ENST00000568288 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.51■■■□□ 2.15
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UBE2I-218ENST00000568288 DISP1Q96F81 1524 aa28.43■■■□□ 2.14
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UBE2I-218ENST00000568288 SAMD9Q5K651 1589 aa28.37■■■□□ 2.13
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UBE2I-218ENST00000568288 CLIP1P30622 1438 aa28.26■■■□□ 2.11
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UBE2I-218ENST00000568288 ABCC2Q92887 1545 aa28.02■■■□□ 2.08
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UBE2I-218ENST00000568288 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.99■■■□□ 2.07
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UBE2I-218ENST00000568288 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
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UBE2I-218ENST00000568288 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.93■■■□□ 2.06
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UBE2I-218ENST00000568288 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.86■■■□□ 2.05
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UBE2I-218ENST00000568288 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
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UBE2I-218ENST00000568288 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.57■■■□□ 2
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UBE2I-218ENST00000568288 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.26■■□□□ 1.95
UBE2I-218ENST00000568288 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.26■■□□□ 1.95
UBE2I-218ENST00000568288 PREX2Q70Z35 1606 aa27.24■■□□□ 1.95
UBE2I-218ENST00000568288 PLCH2O75038 1416 aa27.23■■□□□ 1.95
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UBE2I-218ENST00000568288 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.21■■□□□ 1.95
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