RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567620.1

CHTF18-217, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-217ENST00000567620 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
CHTF18-217ENST00000567620 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.26■■□□□ 1.63
CHTF18-217ENST00000567620 SHROOM2Q13796 1616 aa25.25■■□□□ 1.63
CHTF18-217ENST00000567620 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.23■■□□□ 1.63
CHTF18-217ENST00000567620 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.15■■□□□ 1.62
CHTF18-217ENST00000567620 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CHTF18-217ENST00000567620 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.61
CHTF18-217ENST00000567620 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.04■■□□□ 1.6
CHTF18-217ENST00000567620 IQGAP2Q13576 1575 aa25.02■■□□□ 1.6
CHTF18-217ENST00000567620 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.02■■□□□ 1.6
CHTF18-217ENST00000567620 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CHTF18-217ENST00000567620 PTPRGP23470 1445 aa25■■□□□ 1.59
CHTF18-217ENST00000567620 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.95■■□□□ 1.59
CHTF18-217ENST00000567620 PRXQ9BXM0 1461 aa24.94■■□□□ 1.58
CHTF18-217ENST00000567620 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.93■■□□□ 1.58
CHTF18-217ENST00000567620 EEA1Q15075 1411 aa24.88■■□□□ 1.57
CHTF18-217ENST00000567620 DISP1Q96F81 1524 aa24.86■■□□□ 1.57
CHTF18-217ENST00000567620 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.86■■□□□ 1.57
CHTF18-217ENST00000567620 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.84■■□□□ 1.57
CHTF18-217ENST00000567620 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.82■■□□□ 1.56
CHTF18-217ENST00000567620 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.81■■□□□ 1.56
CHTF18-217ENST00000567620 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
CHTF18-217ENST00000567620 GOLGA3Q08378 1498 aa24.78■■□□□ 1.56
CHTF18-217ENST00000567620 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.78■■□□□ 1.56
CHTF18-217ENST00000567620 UACAQ9BZF9 1416 aa24.78■■□□□ 1.56
CHTF18-217ENST00000567620 P3H3Q8IVL6 736 aa24.77■■□□□ 1.56
CHTF18-217ENST00000567620 KIAA0556O60303 1618 aa24.76■■□□□ 1.55
CHTF18-217ENST00000567620 MAPKBP1O60336 1514 aa24.71■■□□□ 1.55
CHTF18-217ENST00000567620 ABCC2Q92887 1545 aa24.71■■□□□ 1.55
CHTF18-217ENST00000567620 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.7■■□□□ 1.54
CHTF18-217ENST00000567620 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.69■■□□□ 1.54
CHTF18-217ENST00000567620 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CHTF18-217ENST00000567620 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.63■■□□□ 1.53
CHTF18-217ENST00000567620 ASXL2Q76L83 1435 aa24.63■■□□□ 1.53
CHTF18-217ENST00000567620 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.63■■□□□ 1.53
CHTF18-217ENST00000567620 ARID3CA6NKF2 412 aa24.59■■□□□ 1.53
CHTF18-217ENST00000567620 DIP2BQ9P265 1576 aa24.59■■□□□ 1.53
CHTF18-217ENST00000567620 KIF21BO75037 1637 aa24.57■■□□□ 1.52
CHTF18-217ENST00000567620 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.57■■□□□ 1.52
CHTF18-217ENST00000567620 KCNH8Q96L42 1107 aa24.52■■□□□ 1.52
CHTF18-217ENST00000567620 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CHTF18-217ENST00000567620 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
CHTF18-217ENST00000567620 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
CHTF18-217ENST00000567620 ABCA8O94911 1581 aa24.5■■□□□ 1.51
CHTF18-217ENST00000567620 TSPOAP1O95153 1857 aa24.48■■□□□ 1.51
CHTF18-217ENST00000567620 SAMD9Q5K651 1589 aa24.47■■□□□ 1.51
CHTF18-217ENST00000567620 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.46■■□□□ 1.51
CHTF18-217ENST00000567620 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CHTF18-217ENST00000567620 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.43■■□□□ 1.5
CHTF18-217ENST00000567620 GLI2P10070 1586 aa24.41■■□□□ 1.5
CHTF18-217ENST00000567620 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
CHTF18-217ENST00000567620 ATP10BO94823 1461 aa24.38■■□□□ 1.49
CHTF18-217ENST00000567620 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.37■■□□□ 1.49
CHTF18-217ENST00000567620 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.35■■□□□ 1.49
CHTF18-217ENST00000567620 KDM6BO15054 1643 aa24.33■■□□□ 1.49
CHTF18-217ENST00000567620 CD109Q6YHK3 1445 aa24.3■■□□□ 1.48
CHTF18-217ENST00000567620 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CHTF18-217ENST00000567620 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.29■■□□□ 1.48
CHTF18-217ENST00000567620 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.29■■□□□ 1.48
CHTF18-217ENST00000567620 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.28■■□□□ 1.48
CHTF18-217ENST00000567620 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
CHTF18-217ENST00000567620 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.25■■□□□ 1.47
CHTF18-217ENST00000567620 FMN1Q68DA7 1419 aa24.23■■□□□ 1.47
CHTF18-217ENST00000567620 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
CHTF18-217ENST00000567620 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.18■■□□□ 1.46
CHTF18-217ENST00000567620 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.17■■□□□ 1.46
CHTF18-217ENST00000567620 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
CHTF18-217ENST00000567620 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CHTF18-217ENST00000567620 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
CHTF18-217ENST00000567620 CLIP1P30622 1438 aa24.1■■□□□ 1.45
CHTF18-217ENST00000567620 HECW1Q76N89 1606 aa24.08■■□□□ 1.45
CHTF18-217ENST00000567620 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.08■■□□□ 1.45
CHTF18-217ENST00000567620 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.03■■□□□ 1.44
CHTF18-217ENST00000567620 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.01■■□□□ 1.43
CHTF18-217ENST00000567620 RAPGEF3O95398 923 aa23.99■■□□□ 1.43
CHTF18-217ENST00000567620 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.99■■□□□ 1.43
CHTF18-217ENST00000567620 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.97■■□□□ 1.436e-8■■■□□ 19.1
CHTF18-217ENST00000567620 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.97■■□□□ 1.43
CHTF18-217ENST00000567620 NEO1Q92859 1461 aa23.97■■□□□ 1.43
CHTF18-217ENST00000567620 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.96■■□□□ 1.43
CHTF18-217ENST00000567620 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
CHTF18-217ENST00000567620 FANCAO15360 1455 aa23.93■■□□□ 1.42
CHTF18-217ENST00000567620 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
CHTF18-217ENST00000567620 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.91■■□□□ 1.42
CHTF18-217ENST00000567620 CEP162Q5TB80 1403 aa23.91■■□□□ 1.42
CHTF18-217ENST00000567620 AKNAQ7Z591 1439 aa23.91■■□□□ 1.42
CHTF18-217ENST00000567620 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.91■■□□□ 1.42
CHTF18-217ENST00000567620 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.9■■□□□ 1.42
CHTF18-217ENST00000567620 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.89■■□□□ 1.42
CHTF18-217ENST00000567620 PLCH2O75038 1416 aa23.88■■□□□ 1.41
CHTF18-217ENST00000567620 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
CHTF18-217ENST00000567620 KIF14Q15058 1648 aa23.85■■□□□ 1.41
CHTF18-217ENST00000567620 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.85■■□□□ 1.41
CHTF18-217ENST00000567620 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.83■■□□□ 1.41
CHTF18-217ENST00000567620 ADGRL1O94910 1474 aa23.83■■□□□ 1.41
CHTF18-217ENST00000567620 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
CHTF18-217ENST00000567620 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.8■■□□□ 1.4
CHTF18-217ENST00000567620 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.79■■□□□ 1.4
CHTF18-217ENST00000567620 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.78■■□□□ 1.4
CHTF18-217ENST00000567620 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.77■■□□□ 1.4
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