RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562648.2

FBXL16-205, Transcript of F-box and leucine rich repeat protein 16, human

TSL 1 (best)

Gene FBXL16, Length 2,531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXL16-205	ENST00000562648	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	43.67	■■■■■ 4.58
FBXL16-205	ENST00000562648	TIAM1	Q13009	1591 aa		43.66	■■■■■ 4.58
FBXL16-205	ENST00000562648	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		43.66	■■■■■ 4.58
FBXL16-205	ENST00000562648	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		43.54	■■■■■ 4.56
FBXL16-205	ENST00000562648	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		43.51	■■■■■ 4.56
FBXL16-205	ENST00000562648	MAP3K1	Q13233	1512 aa		43.5	■■■■■ 4.55
FBXL16-205	ENST00000562648	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	43.49	■■■■■ 4.55
FBXL16-205	ENST00000562648	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	43.48	■■■■■ 4.55
FBXL16-205	ENST00000562648	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		43.46	■■■■■ 4.55
FBXL16-205	ENST00000562648	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	43.46	■■■■■ 4.55
FBXL16-205	ENST00000562648	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		43.44	■■■■■ 4.55
FBXL16-205	ENST00000562648	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		43.44	■■■■■ 4.55
FBXL16-205	ENST00000562648	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		43.41	■■■■■ 4.54
FBXL16-205	ENST00000562648	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		43.4	■■■■■ 4.54
FBXL16-205	ENST00000562648	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	43.31	■■■■■ 4.52
FBXL16-205	ENST00000562648	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		43.31	■■■■■ 4.52
FBXL16-205	ENST00000562648	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	43.28	■■■■■ 4.52
FBXL16-205	ENST00000562648	CUL7	Q14999	1698 aa		43.25	■■■■■ 4.51
FBXL16-205	ENST00000562648	MAPKBP1	O60336	1514 aa		43.21	■■■■■ 4.51
FBXL16-205	ENST00000562648	WDR97	A6NE52	1622 aa		43.2	■■■■■ 4.51
FBXL16-205	ENST00000562648	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		43.2	■■■■■ 4.51
FBXL16-205	ENST00000562648	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		43.19	■■■■■ 4.5
FBXL16-205	ENST00000562648	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		43.19	■■■■■ 4.5
FBXL16-205	ENST00000562648	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		43.17	■■■■■ 4.5
FBXL16-205	ENST00000562648	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		43.17	■■■■■ 4.5
FBXL16-205	ENST00000562648	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		43.15	■■■■■ 4.5
FBXL16-205	ENST00000562648	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		43.13	■■■■■ 4.49
FBXL16-205	ENST00000562648	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		43.06	■■■■■ 4.48
FBXL16-205	ENST00000562648	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		43.04	■■■■■ 4.48
FBXL16-205	ENST00000562648	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	43.02	■■■■■ 4.48
FBXL16-205	ENST00000562648	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		42.99	■■■■■ 4.47
FBXL16-205	ENST00000562648	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		42.96	■■■■■ 4.47
FBXL16-205	ENST00000562648	FMN1	Q68DA7	1419 aa		42.94	■■■■■ 4.47
FBXL16-205	ENST00000562648	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	42.86	■■■■■ 4.45
FBXL16-205	ENST00000562648	SAMD9	Q5K651	1589 aa		42.84	■■■■■ 4.45
FBXL16-205	ENST00000562648	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		42.84	■■■■■ 4.45
FBXL16-205	ENST00000562648	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		42.81	■■■■■ 4.44
FBXL16-205	ENST00000562648	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		42.81	■■■■■ 4.44
FBXL16-205	ENST00000562648	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	42.74	■■■■■ 4.43
FBXL16-205	ENST00000562648	MYT1	Q01538	1121 aa		42.7	■■■■■ 4.43
FBXL16-205	ENST00000562648	GRIN2B	Q13224	1484 aa		42.7	■■■■■ 4.43
FBXL16-205	ENST00000562648	PTPRK	Q15262	1439 aa		42.69	■■■■■ 4.42
FBXL16-205	ENST00000562648	NCOA2	Q15596	1464 aa		42.63	■■■■■ 4.41
FBXL16-205	ENST00000562648	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		42.58	■■■■■ 4.41
FBXL16-205	ENST00000562648	PBRM1	Q86U86	1689 aa		42.57	■■■■■ 4.41
FBXL16-205	ENST00000562648	KCNH8	Q96L42	1107 aa		42.55	■■■■■ 4.4
FBXL16-205	ENST00000562648	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		42.54	■■■■■ 4.4
FBXL16-205	ENST00000562648	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		42.53	■■■■■ 4.4
FBXL16-205	ENST00000562648	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	42.52	■■■■■ 4.4
FBXL16-205	ENST00000562648	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		42.51	■■■■■ 4.4
FBXL16-205	ENST00000562648	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.48	■■■■■ 4.39
FBXL16-205	ENST00000562648	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	42.47	■■■■■ 4.39
FBXL16-205	ENST00000562648	HFM1	A2PYH4	1435 aa		42.47	■■■■■ 4.39
FBXL16-205	ENST00000562648	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	42.47	■■■■■ 4.39
FBXL16-205	ENST00000562648	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	42.46	■■■■■ 4.39
FBXL16-205	ENST00000562648	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	42.45	■■■■■ 4.39
FBXL16-205	ENST00000562648	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		42.45	■■■■■ 4.39
FBXL16-205	ENST00000562648	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		42.45	■■■■■ 4.39
FBXL16-205	ENST00000562648	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		42.42	■■■■■ 4.38
FBXL16-205	ENST00000562648	ADAMTS12	P58397	1594 aa		42.41	■■■■■ 4.38
FBXL16-205	ENST00000562648	NAIP	Q13075	1403 aa		42.4	■■■■■ 4.38
FBXL16-205	ENST00000562648	ARID3C	A6NKF2	412 aa		42.4	■■■■■ 4.38
FBXL16-205	ENST00000562648	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		42.38	■■■■■ 4.38
FBXL16-205	ENST00000562648	IQGAP2	Q13576	1575 aa		42.36	■■■■■ 4.37
FBXL16-205	ENST00000562648	UACA	Q9BZF9	1416 aa		42.36	■■■■■ 4.37
FBXL16-205	ENST00000562648	ARHGEF11	O15085	1522 aa		42.32	■■■■■ 4.37
FBXL16-205	ENST00000562648	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		42.31	■■■■■ 4.36
FBXL16-205	ENST00000562648	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		42.29	■■■■■ 4.36
FBXL16-205	ENST00000562648	TONSL	Q96HA7	1378 aa		42.29	■■■■■ 4.36
FBXL16-205	ENST00000562648	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	42.27	■■■■■ 4.36
FBXL16-205	ENST00000562648	HECW1	Q76N89	1606 aa		42.26	■■■■■ 4.36
FBXL16-205	ENST00000562648	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	42.26	■■■■■ 4.35
FBXL16-205	ENST00000562648	WDR62	O43379	1518 aa		42.24	■■■■■ 4.35
FBXL16-205	ENST00000562648	IFT140	Q96RY7	1462 aa		42.23	■■■■■ 4.35
FBXL16-205	ENST00000562648	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	42.14	■■■■■ 4.34
FBXL16-205	ENST00000562648	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	42.12	■■■■■ 4.33
FBXL16-205	ENST00000562648	KDM6B	O15054	1643 aa		42.08	■■■■■ 4.33
FBXL16-205	ENST00000562648	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	42.04	■■■■■ 4.32
FBXL16-205	ENST00000562648	ERCC6	Q03468	1493 aa		42.04	■■■■■ 4.32
FBXL16-205	ENST00000562648	TRIM52	Q96A61	297 aa		42.03	■■■■■ 4.32
FBXL16-205	ENST00000562648	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	42.02	■■■■■ 4.32
FBXL16-205	ENST00000562648	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		42.01	■■■■■ 4.32
FBXL16-205	ENST00000562648	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		41.99	■■■■■ 4.31
FBXL16-205	ENST00000562648	DISP1	Q96F81	1524 aa		41.96	■■■■■ 4.31
FBXL16-205	ENST00000562648	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		41.95	■■■■■ 4.31
FBXL16-205	ENST00000562648	GRIN2A	Q12879	1464 aa		41.94	■■■■■ 4.3
FBXL16-205	ENST00000562648	MIA2	Q96PC5	1412 aa		41.93	■■■■■ 4.3
FBXL16-205	ENST00000562648	KIAA0556	O60303	1618 aa		41.92	■■■■■ 4.3
FBXL16-205	ENST00000562648	FOXD1	Q16676	465 aa		41.88	■■■■■ 4.29
FBXL16-205	ENST00000562648	ANP32C	O43423	234 aa		41.88	■■■■■ 4.29
FBXL16-205	ENST00000562648	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	41.86	■■■■■ 4.29
FBXL16-205	ENST00000562648	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	41.85	■■■■■ 4.29
FBXL16-205	ENST00000562648	AKNA	Q7Z591	1439 aa		41.85	■■■■■ 4.29
FBXL16-205	ENST00000562648	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		41.84	■■■■■ 4.29
FBXL16-205	ENST00000562648	FBLN2	P98095	1184 aa		41.8	■■■■■ 4.28
FBXL16-205	ENST00000562648	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	41.78	■■■■■ 4.28
FBXL16-205	ENST00000562648	CCER2	I3L3R5	266 aa		41.76	■■■■■ 4.28
FBXL16-205	ENST00000562648	DAPK1	P53355	1430 aa		41.76	■■■■■ 4.27
FBXL16-205	ENST00000562648	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		41.75	■■■■■ 4.27
FBXL16-205	ENST00000562648	CEP170	Q5SW79	1584 aa		41.72	■■■■■ 4.27

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