RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562648.2

FBXL16-205, Transcript of F-box and leucine rich repeat protein 16, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FBXL16, Length 2,531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL16-205ENST00000562648 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.98■■■■■ 7.51
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FBXL16-205ENST00000562648 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.11■■■■■ 5.61
FBXL16-205ENST00000562648 SCRIBQ14160 1630 aa49.52■■■■■ 5.52
FBXL16-205ENST00000562648 ABCC9O60706 1549 aa49.49■■■■■ 5.51
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FBXL16-205ENST00000562648 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.55■■■■■ 5.36
FBXL16-205ENST00000562648 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.47■■■■■ 5.35
FBXL16-205ENST00000562648 HRCP23327 699 aa48.4■■■■■ 5.34
FBXL16-205ENST00000562648 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.26■■■■■ 5.32
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FBXL16-205ENST00000562648 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.35■■■■■ 5.01
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FBXL16-205ENST00000562648 CSRNP3Q8WYN3 585 aa46.08■■■■■ 4.97
FBXL16-205ENST00000562648 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.04■■■■■ 4.96
FBXL16-205ENST00000562648 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP46.01■■■■■ 4.96
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FBXL16-205ENST00000562648 EEA1Q15075 1411 aa45.95■■■■■ 4.95
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FBXL16-205ENST00000562648 CUX1P39880 1505 aa44.91■■■■■ 4.78
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FBXL16-205ENST00000562648 ARAP1Q96P48 1450 aa44.57■■■■■ 4.73
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FBXL16-205ENST00000562648 NESP48681 1621 aa44■■■■■ 4.63
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FBXL16-205ENST00000562648 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.8■■■■■ 4.6
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FBXL16-205ENST00000562648 CCNB3Q8WWL7 1395 aa43.79■■■■■ 4.6
FBXL16-205ENST00000562648 MIER1Q8N108 512 aa43.77■■■■■ 4.6
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FBXL16-205ENST00000562648 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.7■■■■■ 4.59
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FBXL16-205ENST00000562648 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP43.68■■■■■ 4.58
FBXL16-205ENST00000562648 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa43.68■■■■■ 4.58
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