RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557413.5

RPS6KL1-216, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RPS6KL1, Length 2,425 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-216ENST00000557413 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.66■■■□□ 2.34
RPS6KL1-216ENST00000557413 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.64■■■□□ 2.34
RPS6KL1-216ENST00000557413 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.62■■■□□ 2.33
RPS6KL1-216ENST00000557413 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.61■■■□□ 2.33
RPS6KL1-216ENST00000557413 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
RPS6KL1-216ENST00000557413 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
RPS6KL1-216ENST00000557413 KCNH8Q96L42 1107 aa29.56■■■□□ 2.32
RPS6KL1-216ENST00000557413 WDR97A6NE52 1622 aa29.56■■■□□ 2.32
RPS6KL1-216ENST00000557413 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.52■■■□□ 2.32
RPS6KL1-216ENST00000557413 P3H3Q8IVL6 736 aa29.5■■■□□ 2.31
RPS6KL1-216ENST00000557413 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
RPS6KL1-216ENST00000557413 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
RPS6KL1-216ENST00000557413 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.44■■■□□ 2.3
RPS6KL1-216ENST00000557413 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.42■■■□□ 2.3
RPS6KL1-216ENST00000557413 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.42■■■□□ 2.3
RPS6KL1-216ENST00000557413 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.38■■■□□ 2.29
RPS6KL1-216ENST00000557413 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.37■■■□□ 2.29
RPS6KL1-216ENST00000557413 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa29.36■■■□□ 2.29
RPS6KL1-216ENST00000557413 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.36■■■□□ 2.29
RPS6KL1-216ENST00000557413 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.35■■■□□ 2.29
RPS6KL1-216ENST00000557413 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
RPS6KL1-216ENST00000557413 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.33■■■□□ 2.29
RPS6KL1-216ENST00000557413 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.32■■■□□ 2.28
RPS6KL1-216ENST00000557413 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.32■■■□□ 2.28
RPS6KL1-216ENST00000557413 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.32■■■□□ 2.28
RPS6KL1-216ENST00000557413 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.31■■■□□ 2.28
RPS6KL1-216ENST00000557413 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.28■■■□□ 2.28
RPS6KL1-216ENST00000557413 CUL7Q14999 1698 aa29.26■■■□□ 2.28
RPS6KL1-216ENST00000557413 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
RPS6KL1-216ENST00000557413 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
RPS6KL1-216ENST00000557413 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.24■■■□□ 2.27
RPS6KL1-216ENST00000557413 TOPBP1Q92547 1522 aa29.23■■■□□ 2.27
RPS6KL1-216ENST00000557413 FMN1Q68DA7 1419 aa29.22■■■□□ 2.27
RPS6KL1-216ENST00000557413 FKBP8Q14318 412 aa29.2■■■□□ 2.27
RPS6KL1-216ENST00000557413 CCER2I3L3R5 266 aa29.2■■■□□ 2.26
RPS6KL1-216ENST00000557413 BCANQ96GW7 911 aa29.2■■■□□ 2.26
RPS6KL1-216ENST00000557413 ANP32CO43423 234 aa29.19■■■□□ 2.26
RPS6KL1-216ENST00000557413 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.18■■■□□ 2.26
RPS6KL1-216ENST00000557413 TONSLQ96HA7 1378 aa29.17■■■□□ 2.26
RPS6KL1-216ENST00000557413 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.16■■■□□ 2.26
RPS6KL1-216ENST00000557413 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.14■■■□□ 2.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 HFM1A2PYH4 1435 aa29.12■■■□□ 2.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 UACAQ9BZF9 1416 aa29.12■■■□□ 2.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.1■■■□□ 2.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 PTPRKQ15262 1439 aa29.1■■■□□ 2.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 TRIM52Q96A61 297 aa29.09■■■□□ 2.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 NEFLP07196 543 aa29.07■■■□□ 2.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.06■■■□□ 2.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 NESP48681 1621 aa29.05■■■□□ 2.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 SAMD9Q5K651 1589 aa29.04■■■□□ 2.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 NCOA2Q15596 1464 aa29.02■■■□□ 2.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 NAIPQ13075 1403 aa29.01■■■□□ 2.23
RPS6KL1-216ENST00000557413 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.01■■■□□ 2.23
RPS6KL1-216ENST00000557413 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
RPS6KL1-216ENST00000557413 GRIN2BQ13224 1484 aa28.97■■■□□ 2.23
RPS6KL1-216ENST00000557413 ANP32EQ9BTT0 268 aa28.97■■■□□ 2.23
RPS6KL1-216ENST00000557413 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
RPS6KL1-216ENST00000557413 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.93■■■□□ 2.22
RPS6KL1-216ENST00000557413 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.93■■■□□ 2.22
RPS6KL1-216ENST00000557413 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
RPS6KL1-216ENST00000557413 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
RPS6KL1-216ENST00000557413 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.91■■■□□ 2.22
RPS6KL1-216ENST00000557413 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.87■■■□□ 2.21
RPS6KL1-216ENST00000557413 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.86■■■□□ 2.21
RPS6KL1-216ENST00000557413 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.84■■■□□ 2.21
RPS6KL1-216ENST00000557413 ARHGEF11O15085 1522 aa28.83■■■□□ 2.21
RPS6KL1-216ENST00000557413 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.82■■■□□ 2.2
RPS6KL1-216ENST00000557413 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.8■■■□□ 2.2
RPS6KL1-216ENST00000557413 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.79■■■□□ 2.2
RPS6KL1-216ENST00000557413 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.79■■■□□ 2.2
RPS6KL1-216ENST00000557413 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
RPS6KL1-216ENST00000557413 HECW1Q76N89 1606 aa28.77■■■□□ 2.2
RPS6KL1-216ENST00000557413 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
RPS6KL1-216ENST00000557413 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP28.75■■■□□ 2.19
RPS6KL1-216ENST00000557413 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.75■■■□□ 2.19
RPS6KL1-216ENST00000557413 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.74■■■□□ 2.19
RPS6KL1-216ENST00000557413 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.74■■■□□ 2.19
RPS6KL1-216ENST00000557413 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
RPS6KL1-216ENST00000557413 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
RPS6KL1-216ENST00000557413 AKNAQ7Z591 1439 aa28.7■■■□□ 2.18
RPS6KL1-216ENST00000557413 KDM6BO15054 1643 aa28.67■■■□□ 2.18
RPS6KL1-216ENST00000557413 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.66■■■□□ 2.18
RPS6KL1-216ENST00000557413 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.64■■■□□ 2.18
RPS6KL1-216ENST00000557413 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
RPS6KL1-216ENST00000557413 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.61■■■□□ 2.17
RPS6KL1-216ENST00000557413 MIA2Q96PC5 1412 aa28.6■■■□□ 2.17
RPS6KL1-216ENST00000557413 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.6■■■□□ 2.17
RPS6KL1-216ENST00000557413 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
RPS6KL1-216ENST00000557413 IQGAP2Q13576 1575 aa28.57■■■□□ 2.16
RPS6KL1-216ENST00000557413 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
RPS6KL1-216ENST00000557413 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.57■■■□□ 2.16
RPS6KL1-216ENST00000557413 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
RPS6KL1-216ENST00000557413 PBRM1Q86U86 1689 aa28.54■■■□□ 2.16
RPS6KL1-216ENST00000557413 FOXD1Q16676 465 aa28.52■■■□□ 2.16
RPS6KL1-216ENST00000557413 NCOA1Q15788 1441 aa28.51■■■□□ 2.15
RPS6KL1-216ENST00000557413 WDR62O43379 1518 aa28.51■■■□□ 2.15
RPS6KL1-216ENST00000557413 CCDC184Q52MB2 194 aa28.5■■■□□ 2.15
RPS6KL1-216ENST00000557413 CCDC7Q96M83 1385 aa28.49■■■□□ 2.15
RPS6KL1-216ENST00000557413 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
RPS6KL1-216ENST00000557413 ARID3CA6NKF2 412 aa28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.4 ms