RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557119.2

PITX2-209, Transcript of paired like homeodomain 2, human

TSL 2 BASIC

Gene PITX2, Length 1,889 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PITX2-209	ENST00000557119	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		33.57	■■■□□ 2.97
PITX2-209	ENST00000557119	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	33.57	■■■□□ 2.96
PITX2-209	ENST00000557119	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		33.55	■■■□□ 2.96
PITX2-209	ENST00000557119	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.5	■■■□□ 2.95
PITX2-209	ENST00000557119	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	33.48	■■■□□ 2.95
PITX2-209	ENST00000557119	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	33.47	■■■□□ 2.95
PITX2-209	ENST00000557119	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		33.47	■■■□□ 2.95
PITX2-209	ENST00000557119	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		33.46	■■■□□ 2.95
PITX2-209	ENST00000557119	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	33.44	■■■□□ 2.94
PITX2-209	ENST00000557119	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		33.43	■■■□□ 2.94
PITX2-209	ENST00000557119	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.43	■■■□□ 2.94
PITX2-209	ENST00000557119	WDR62	O43379	1518 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PITX2-209	ENST00000557119	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	33.4	■■■□□ 2.94
PITX2-209	ENST00000557119	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PITX2-209	ENST00000557119	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
PITX2-209	ENST00000557119	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		33.32	■■■□□ 2.93
PITX2-209	ENST00000557119	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PITX2-209	ENST00000557119	FMN1	Q68DA7	1419 aa		33.25	■■■□□ 2.91
PITX2-209	ENST00000557119	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
PITX2-209	ENST00000557119	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		33.23	■■■□□ 2.91
PITX2-209	ENST00000557119	SAMD9	Q5K651	1589 aa		33.22	■■■□□ 2.91
PITX2-209	ENST00000557119	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	33.2	■■■□□ 2.91
PITX2-209	ENST00000557119	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	33.19	■■■□□ 2.9
PITX2-209	ENST00000557119	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PITX2-209	ENST00000557119	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PITX2-209	ENST00000557119	P3H3	Q8IVL6	736 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PITX2-209	ENST00000557119	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PITX2-209	ENST00000557119	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PITX2-209	ENST00000557119	PBRM1	Q86U86	1689 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PITX2-209	ENST00000557119	GRIN2B	Q13224	1484 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PITX2-209	ENST00000557119	IFT140	Q96RY7	1462 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PITX2-209	ENST00000557119	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	32.97	■■■□□ 2.87
PITX2-209	ENST00000557119	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	32.95	■■■□□ 2.86
PITX2-209	ENST00000557119	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	32.93	■■■□□ 2.86
PITX2-209	ENST00000557119	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
PITX2-209	ENST00000557119	ADAMTS12	P58397	1594 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PITX2-209	ENST00000557119	MAPKBP1	O60336	1514 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PITX2-209	ENST00000557119	ITGAE	P38570	1179 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PITX2-209	ENST00000557119	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.88	■■■□□ 2.85
PITX2-209	ENST00000557119	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PITX2-209	ENST00000557119	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PITX2-209	ENST00000557119	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
PITX2-209	ENST00000557119	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PITX2-209	ENST00000557119	IQGAP2	Q13576	1575 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PITX2-209	ENST00000557119	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.82	■■■□□ 2.84
PITX2-209	ENST00000557119	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		32.82	■■■□□ 2.84
PITX2-209	ENST00000557119	NEUROD1	Q13562	356 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PITX2-209	ENST00000557119	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
PITX2-209	ENST00000557119	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
PITX2-209	ENST00000557119	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		32.76	■■■□□ 2.84
PITX2-209	ENST00000557119	ARHGEF11	O15085	1522 aa		32.76	■■■□□ 2.83
PITX2-209	ENST00000557119	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PITX2-209	ENST00000557119	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PITX2-209	ENST00000557119	MIER1	Q8N108	512 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PITX2-209	ENST00000557119	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PITX2-209	ENST00000557119	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PITX2-209	ENST00000557119	HFM1	A2PYH4	1435 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PITX2-209	ENST00000557119	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PITX2-209	ENST00000557119	MYT1	Q01538	1121 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PITX2-209	ENST00000557119	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
PITX2-209	ENST00000557119	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
PITX2-209	ENST00000557119	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PITX2-209	ENST00000557119	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PITX2-209	ENST00000557119	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PITX2-209	ENST00000557119	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PITX2-209	ENST00000557119	MIA2	Q96PC5	1412 aa		32.51	■■■□□ 2.79
PITX2-209	ENST00000557119	GRIN2A	Q12879	1464 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PITX2-209	ENST00000557119	NAIP	Q13075	1403 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PITX2-209	ENST00000557119	KIAA0556	O60303	1618 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PITX2-209	ENST00000557119	AKNA	Q7Z591	1439 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PITX2-209	ENST00000557119	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
PITX2-209	ENST00000557119	FBLN2	P98095	1184 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PITX2-209	ENST00000557119	DISP1	Q96F81	1524 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PITX2-209	ENST00000557119	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PITX2-209	ENST00000557119	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PITX2-209	ENST00000557119	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PITX2-209	ENST00000557119	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
PITX2-209	ENST00000557119	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
PITX2-209	ENST00000557119	SYNJ2	O15056	1496 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PITX2-209	ENST00000557119	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
PITX2-209	ENST00000557119	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PITX2-209	ENST00000557119	CHD1	O14646	1710 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PITX2-209	ENST00000557119	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
PITX2-209	ENST00000557119	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
PITX2-209	ENST00000557119	CEP170	Q5SW79	1584 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PITX2-209	ENST00000557119	NUP160	Q12769	1436 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PITX2-209	ENST00000557119	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
PITX2-209	ENST00000557119	ROCK1	Q13464	1354 aa		32.2	■■■□□ 2.75
PITX2-209	ENST00000557119	TONSL	Q96HA7	1378 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PITX2-209	ENST00000557119	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PITX2-209	ENST00000557119	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
PITX2-209	ENST00000557119	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PITX2-209	ENST00000557119	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
PITX2-209	ENST00000557119	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PITX2-209	ENST00000557119	DAPK1	P53355	1430 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PITX2-209	ENST00000557119	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PITX2-209	ENST00000557119	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PITX2-209	ENST00000557119	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	32.06	■■■□□ 2.72
PITX2-209	ENST00000557119	ABCC5	O15440	1437 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PITX2-209	ENST00000557119	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		32.05	■■■□□ 2.72

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