RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555055.5

XRCC3-211, Transcript of X-ray repair cross complementing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene XRCC3, Length 2,584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC3-211ENST00000555055 WDR97A6NE52 1622 aa22.09■■□□□ 1.13
XRCC3-211ENST00000555055 MYT1Q01538 1121 aa22.09■■□□□ 1.13
XRCC3-211ENST00000555055 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.126e-6■■■■□ 25.1
XRCC3-211ENST00000555055 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
XRCC3-211ENST00000555055 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.05■■□□□ 1.12
XRCC3-211ENST00000555055 TIAM1Q13009 1591 aa22.04■■□□□ 1.12
XRCC3-211ENST00000555055 CUL7Q14999 1698 aa22.04■■□□□ 1.12
XRCC3-211ENST00000555055 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.03■■□□□ 1.12
XRCC3-211ENST00000555055 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
XRCC3-211ENST00000555055 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22■■□□□ 1.11
XRCC3-211ENST00000555055 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
XRCC3-211ENST00000555055 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
XRCC3-211ENST00000555055 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.98■■□□□ 1.11
XRCC3-211ENST00000555055 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.98■■□□□ 1.11
XRCC3-211ENST00000555055 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.98■■□□□ 1.11
XRCC3-211ENST00000555055 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
XRCC3-211ENST00000555055 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
XRCC3-211ENST00000555055 ARID3CA6NKF2 412 aa21.95■■□□□ 1.11
XRCC3-211ENST00000555055 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
XRCC3-211ENST00000555055 NEUROD1Q13562 356 aa21.94■■□□□ 1.1
XRCC3-211ENST00000555055 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.94■■□□□ 1.1
XRCC3-211ENST00000555055 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
XRCC3-211ENST00000555055 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.87■■□□□ 1.09
XRCC3-211ENST00000555055 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
XRCC3-211ENST00000555055 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.86■■□□□ 1.09
XRCC3-211ENST00000555055 ERCC6Q03468 1493 aa21.85■■□□□ 1.09
XRCC3-211ENST00000555055 PBRM1Q86U86 1689 aa21.85■■□□□ 1.09
XRCC3-211ENST00000555055 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.84■■□□□ 1.09
XRCC3-211ENST00000555055 MAP3K1Q13233 1512 aa21.83■■□□□ 1.09
XRCC3-211ENST00000555055 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.83■■□□□ 1.09
XRCC3-211ENST00000555055 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.82■■□□□ 1.08
XRCC3-211ENST00000555055 FMN1Q68DA7 1419 aa21.82■■□□□ 1.08
XRCC3-211ENST00000555055 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.82■■□□□ 1.08
XRCC3-211ENST00000555055 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.79■■□□□ 1.08
XRCC3-211ENST00000555055 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.78■■□□□ 1.08
XRCC3-211ENST00000555055 SAMD9Q5K651 1589 aa21.78■■□□□ 1.08
XRCC3-211ENST00000555055 FBLN2P98095 1184 aa21.78■■□□□ 1.08
XRCC3-211ENST00000555055 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.76■■□□□ 1.07
XRCC3-211ENST00000555055 GRIN2BQ13224 1484 aa21.76■■□□□ 1.07
XRCC3-211ENST00000555055 ADAMTS12P58397 1594 aa21.75■■□□□ 1.07
XRCC3-211ENST00000555055 WDR62O43379 1518 aa21.74■■□□□ 1.07
XRCC3-211ENST00000555055 IFT140Q96RY7 1462 aa21.73■■□□□ 1.07
XRCC3-211ENST00000555055 IQGAP2Q13576 1575 aa21.69■■□□□ 1.06
XRCC3-211ENST00000555055 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.68■■□□□ 1.06
XRCC3-211ENST00000555055 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
XRCC3-211ENST00000555055 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.66■■□□□ 1.06
XRCC3-211ENST00000555055 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.65■■□□□ 1.06
XRCC3-211ENST00000555055 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.65■■□□□ 1.06
XRCC3-211ENST00000555055 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
XRCC3-211ENST00000555055 NCOA2Q15596 1464 aa21.63■■□□□ 1.05
XRCC3-211ENST00000555055 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
XRCC3-211ENST00000555055 MIER1Q8N108 512 aa21.61■■□□□ 1.05
XRCC3-211ENST00000555055 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.61■■□□□ 1.05
XRCC3-211ENST00000555055 PTPRKQ15262 1439 aa21.61■■□□□ 1.05
XRCC3-211ENST00000555055 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
XRCC3-211ENST00000555055 MAPKBP1O60336 1514 aa21.61■■□□□ 1.05
XRCC3-211ENST00000555055 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.6■■□□□ 1.05
XRCC3-211ENST00000555055 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
XRCC3-211ENST00000555055 GRIN2AQ12879 1464 aa21.57■■□□□ 1.04
XRCC3-211ENST00000555055 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
XRCC3-211ENST00000555055 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.54■■□□□ 1.04
XRCC3-211ENST00000555055 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.53■■□□□ 1.04
XRCC3-211ENST00000555055 DISP1Q96F81 1524 aa21.52■■□□□ 1.04
XRCC3-211ENST00000555055 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.51■■□□□ 1.03
XRCC3-211ENST00000555055 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
XRCC3-211ENST00000555055 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.49■■□□□ 1.03
XRCC3-211ENST00000555055 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.49■■□□□ 1.03
XRCC3-211ENST00000555055 HECW1Q76N89 1606 aa21.48■■□□□ 1.03
XRCC3-211ENST00000555055 KIAA0556O60303 1618 aa21.46■■□□□ 1.03
XRCC3-211ENST00000555055 CEP170Q5SW79 1584 aa21.46■■□□□ 1.03
XRCC3-211ENST00000555055 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.46■■□□□ 1.03
XRCC3-211ENST00000555055 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
XRCC3-211ENST00000555055 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
XRCC3-211ENST00000555055 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.43■■□□□ 1.02
XRCC3-211ENST00000555055 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.023e-6■■■■□ 21.3
XRCC3-211ENST00000555055 SYNJ2O15056 1496 aa21.43■■□□□ 1.02
XRCC3-211ENST00000555055 JPH4Q96JJ6 628 aa21.42■■□□□ 1.02
XRCC3-211ENST00000555055 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.42■■□□□ 1.02
XRCC3-211ENST00000555055 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
XRCC3-211ENST00000555055 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
XRCC3-211ENST00000555055 NAIPQ13075 1403 aa21.39■■□□□ 1.01
XRCC3-211ENST00000555055 ARHGEF11O15085 1522 aa21.39■■□□□ 1.01
XRCC3-211ENST00000555055 HFM1A2PYH4 1435 aa21.37■■□□□ 1.01
XRCC3-211ENST00000555055 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
XRCC3-211ENST00000555055 TRIM52Q96A61 297 aa21.35■■□□□ 1.01
XRCC3-211ENST00000555055 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
XRCC3-211ENST00000555055 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.33■■□□□ 1
XRCC3-211ENST00000555055 FOXD1Q16676 465 aa21.32■■□□□ 1
XRCC3-211ENST00000555055 KDM6BO15054 1643 aa21.3■■□□□ 1
XRCC3-211ENST00000555055 NUP160Q12769 1436 aa21.28■■□□□ 1
XRCC3-211ENST00000555055 UACAQ9BZF9 1416 aa21.27■■□□□ 1
XRCC3-211ENST00000555055 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
XRCC3-211ENST00000555055 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
XRCC3-211ENST00000555055 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
XRCC3-211ENST00000555055 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.23■□□□□ 0.99
XRCC3-211ENST00000555055 TONSLQ96HA7 1378 aa21.23■□□□□ 0.99
XRCC3-211ENST00000555055 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
XRCC3-211ENST00000555055 MIA2Q96PC5 1412 aa21.21■□□□□ 0.99
XRCC3-211ENST00000555055 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
XRCC3-211ENST00000555055 KIF14Q15058 1648 aa21.2■□□□□ 0.99
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