RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553719.5

PSEN1-208, Transcript of presenilin 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSEN1, Length 712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1-208ENST00000553719 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.66■■■□□ 2.34
PSEN1-208ENST00000553719 SHROOM2Q13796 1616 aa29.6■■■□□ 2.33
PSEN1-208ENST00000553719 IQGAP2Q13576 1575 aa29.59■■■□□ 2.33
PSEN1-208ENST00000553719 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.48■■■□□ 2.31
PSEN1-208ENST00000553719 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.47■■■□□ 2.31
PSEN1-208ENST00000553719 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.45■■■□□ 2.31
PSEN1-208ENST00000553719 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
PSEN1-208ENST00000553719 JPH4Q96JJ6 628 aa29.42■■■□□ 2.3
PSEN1-208ENST00000553719 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.41■■■□□ 2.3
PSEN1-208ENST00000553719 DISP1Q96F81 1524 aa29.38■■■□□ 2.29
PSEN1-208ENST00000553719 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.38■■■□□ 2.29
PSEN1-208ENST00000553719 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
PSEN1-208ENST00000553719 SAMD9Q5K651 1589 aa29.36■■■□□ 2.29
PSEN1-208ENST00000553719 ARHGEF11O15085 1522 aa29.35■■■□□ 2.29
PSEN1-208ENST00000553719 KIAA0556O60303 1618 aa29.34■■■□□ 2.29
PSEN1-208ENST00000553719 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.31■■■□□ 2.28
PSEN1-208ENST00000553719 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.3■■■□□ 2.28
PSEN1-208ENST00000553719 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.3■■■□□ 2.28
PSEN1-208ENST00000553719 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.3■■■□□ 2.28
PSEN1-208ENST00000553719 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.3■■■□□ 2.28
PSEN1-208ENST00000553719 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.26■■■□□ 2.27
PSEN1-208ENST00000553719 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.23■■■□□ 2.27
PSEN1-208ENST00000553719 CEP162Q5TB80 1403 aa29.21■■■□□ 2.27
PSEN1-208ENST00000553719 CLIP1P30622 1438 aa29.18■■■□□ 2.26
PSEN1-208ENST00000553719 ARAP1Q96P48 1450 aa29.17■■■□□ 2.26
PSEN1-208ENST00000553719 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
PSEN1-208ENST00000553719 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.11■■■□□ 2.25
PSEN1-208ENST00000553719 PTPRGP23470 1445 aa29.06■■■□□ 2.24
PSEN1-208ENST00000553719 P3H3Q8IVL6 736 aa29.05■■■□□ 2.24
PSEN1-208ENST00000553719 ABCA8O94911 1581 aa28.98■■■□□ 2.23
PSEN1-208ENST00000553719 FMN1Q68DA7 1419 aa28.95■■■□□ 2.23
PSEN1-208ENST00000553719 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.94■■■□□ 2.22
PSEN1-208ENST00000553719 UACAQ9BZF9 1416 aa28.93■■■□□ 2.22
PSEN1-208ENST00000553719 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.92■■■□□ 2.22
PSEN1-208ENST00000553719 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.92■■■□□ 2.22
PSEN1-208ENST00000553719 ABCC2Q92887 1545 aa28.92■■■□□ 2.22
PSEN1-208ENST00000553719 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.91■■■□□ 2.22
PSEN1-208ENST00000553719 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.9■■■□□ 2.22
PSEN1-208ENST00000553719 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
PSEN1-208ENST00000553719 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
PSEN1-208ENST00000553719 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.84■■■□□ 2.21
PSEN1-208ENST00000553719 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.83■■■□□ 2.21
PSEN1-208ENST00000553719 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
PSEN1-208ENST00000553719 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.8■■■□□ 2.2
PSEN1-208ENST00000553719 HECW1Q76N89 1606 aa28.8■■■□□ 2.2
PSEN1-208ENST00000553719 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.79■■■□□ 2.2
PSEN1-208ENST00000553719 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.75■■■□□ 2.19
PSEN1-208ENST00000553719 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
PSEN1-208ENST00000553719 ATP10BO94823 1461 aa28.7■■■□□ 2.18
PSEN1-208ENST00000553719 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
PSEN1-208ENST00000553719 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
PSEN1-208ENST00000553719 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.64■■■□□ 2.17
PSEN1-208ENST00000553719 MAPKBP1O60336 1514 aa28.64■■■□□ 2.17
PSEN1-208ENST00000553719 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.59■■■□□ 2.17
PSEN1-208ENST00000553719 MAP3K1Q13233 1512 aa28.55■■■□□ 2.16
PSEN1-208ENST00000553719 ARID3CA6NKF2 412 aa28.55■■■□□ 2.16
PSEN1-208ENST00000553719 TIAM1Q13009 1591 aa28.54■■■□□ 2.16
PSEN1-208ENST00000553719 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.53■■■□□ 2.16
PSEN1-208ENST00000553719 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
PSEN1-208ENST00000553719 ASXL2Q76L83 1435 aa28.52■■■□□ 2.16
PSEN1-208ENST00000553719 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.5■■■□□ 2.15
PSEN1-208ENST00000553719 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.5■■■□□ 2.15
PSEN1-208ENST00000553719 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
PSEN1-208ENST00000553719 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
PSEN1-208ENST00000553719 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
PSEN1-208ENST00000553719 DIP2BQ9P265 1576 aa28.41■■■□□ 2.14
PSEN1-208ENST00000553719 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.4■■■□□ 2.14
PSEN1-208ENST00000553719 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.39■■■□□ 2.14
PSEN1-208ENST00000553719 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.39■■■□□ 2.13
PSEN1-208ENST00000553719 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
PSEN1-208ENST00000553719 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.37■■■□□ 2.13
PSEN1-208ENST00000553719 GLI2P10070 1586 aa28.36■■■□□ 2.13
PSEN1-208ENST00000553719 KIF14Q15058 1648 aa28.35■■■□□ 2.13
PSEN1-208ENST00000553719 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.34■■■□□ 2.13
PSEN1-208ENST00000553719 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
PSEN1-208ENST00000553719 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.31■■■□□ 2.12
PSEN1-208ENST00000553719 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.31■■■□□ 2.12
PSEN1-208ENST00000553719 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.29■■■□□ 2.12
PSEN1-208ENST00000553719 APLP2Q06481 763 aa28.29■■■□□ 2.12
PSEN1-208ENST00000553719 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.28■■■□□ 2.12
PSEN1-208ENST00000553719 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.25■■■□□ 2.11
PSEN1-208ENST00000553719 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
PSEN1-208ENST00000553719 KCNH8Q96L42 1107 aa28.23■■■□□ 2.11
PSEN1-208ENST00000553719 NCOA2Q15596 1464 aa28.21■■■□□ 2.11
PSEN1-208ENST00000553719 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.19■■■□□ 2.1
PSEN1-208ENST00000553719 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
PSEN1-208ENST00000553719 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.14■■■□□ 2.1
PSEN1-208ENST00000553719 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.14■■■□□ 2.1
PSEN1-208ENST00000553719 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.13■■■□□ 2.09
PSEN1-208ENST00000553719 PREX2Q70Z35 1606 aa28.13■■■□□ 2.09
PSEN1-208ENST00000553719 CD109Q6YHK3 1445 aa28.12■■■□□ 2.09
PSEN1-208ENST00000553719 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
PSEN1-208ENST00000553719 PLCH2O75038 1416 aa28.09■■■□□ 2.09
PSEN1-208ENST00000553719 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.09■■■□□ 2.09
PSEN1-208ENST00000553719 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.07■■■□□ 2.08
PSEN1-208ENST00000553719 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.07■■■□□ 2.08
PSEN1-208ENST00000553719 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
PSEN1-208ENST00000553719 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.05■■■□□ 2.08
PSEN1-208ENST00000553719 TSPOAP1O95153 1857 aa28.04■■■□□ 2.08
PSEN1-208ENST00000553719 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 425.3 ms