RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540082.1

TOMM20P2-201, Transcript of TOMM20 pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene TOMM20P2, Length 421 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20P2-201ENST00000540082 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa8.64□□□□□ -1.03
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TOMM20P2-201ENST00000540082 SHROOM2Q13796 1616 aa8.57□□□□□ -1.04
TOMM20P2-201ENST00000540082 GRIN2AQ12879 1464 aa8.57□□□□□ -1.04
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TOMM20P2-201ENST00000540082 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TOMM20P2-201ENST00000540082 TEX14Q8IWB6 1497 aa8.55□□□□□ -1.04
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TOMM20P2-201ENST00000540082 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa8.41□□□□□ -1.06
TOMM20P2-201ENST00000540082 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa8.41□□□□□ -1.06
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TOMM20P2-201ENST00000540082 PTPRGP23470 1445 aa8.37□□□□□ -1.07
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TOMM20P2-201ENST00000540082 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
TOMM20P2-201ENST00000540082 YEATS2Q9ULM3 1422 aa8.35□□□□□ -1.07
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TOMM20P2-201ENST00000540082 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa8.31□□□□□ -1.08
TOMM20P2-201ENST00000540082 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TOMM20P2-201ENST00000540082 MADDQ8WXG6 1647 aa8.3□□□□□ -1.08
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TOMM20P2-201ENST00000540082 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa8.3□□□□□ -1.08
TOMM20P2-201ENST00000540082 CD109Q6YHK3 1445 aa8.29□□□□□ -1.08
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TOMM20P2-201ENST00000540082 CFAP43Q8NDM7 1665 aa8.27□□□□□ -1.09
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TOMM20P2-201ENST00000540082 KDM5BQ9UGL1 1544 aa8.24□□□□□ -1.09
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TOMM20P2-201ENST00000540082 TOM1O60784 492 aa8.19□□□□□ -1.1
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TOMM20P2-201ENST00000540082 KCNH8Q96L42 1107 aa8.18□□□□□ -1.1
TOMM20P2-201ENST00000540082 STRCQ7RTU9 1775 aa8.17□□□□□ -1.1
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TOMM20P2-201ENST00000540082 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa8.09□□□□□ -1.11
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TOMM20P2-201ENST00000540082 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
TOMM20P2-201ENST00000540082 PTPRKQ15262 1439 aa8.06□□□□□ -1.12
TOMM20P2-201ENST00000540082 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
TOMM20P2-201ENST00000540082 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
TOMM20P2-201ENST00000540082 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
TOMM20P2-201ENST00000540082 EFCAB5A4FU69 1503 aa8.05□□□□□ -1.12
TOMM20P2-201ENST00000540082 KIAA0556O60303 1618 aa8.05□□□□□ -1.12
TOMM20P2-201ENST00000540082 MAGI2Q86UL8 1455 aa8.05□□□□□ -1.12
TOMM20P2-201ENST00000540082 PKD2Q13563 968 aa8.04□□□□□ -1.12
TOMM20P2-201ENST00000540082 IQGAP2Q13576 1575 aa8.04□□□□□ -1.12
TOMM20P2-201ENST00000540082 IFFO2Q5TF58 517 aa8.03□□□□□ -1.12
TOMM20P2-201ENST00000540082 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.12
TOMM20P2-201ENST00000540082 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
TOMM20P2-201ENST00000540082 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa8.03□□□□□ -1.12
TOMM20P2-201ENST00000540082 FHOD3Q2V2M9 1422 aa8.03□□□□□ -1.12
TOMM20P2-201ENST00000540082 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa8.02□□□□□ -1.13
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