RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538716.6

TMUB2-204, Transcript of transmembrane and ubiquitin like domain containing 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene TMUB2, Length 1,953 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2-204ENST00000538716 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.42■■□□□ 1.5
TMUB2-204ENST00000538716 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.38■■□□□ 1.49
TMUB2-204ENST00000538716 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.38■■□□□ 1.49
TMUB2-204ENST00000538716 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.36■■□□□ 1.49
TMUB2-204ENST00000538716 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.36■■□□□ 1.493e-6■■■□□ 18.3
TMUB2-204ENST00000538716 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.35■■□□□ 1.49
TMUB2-204ENST00000538716 ITGAEP38570 1179 aa24.34■■□□□ 1.49
TMUB2-204ENST00000538716 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.34■■□□□ 1.49
TMUB2-204ENST00000538716 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.33■■□□□ 1.49
TMUB2-204ENST00000538716 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
TMUB2-204ENST00000538716 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.32■■□□□ 1.48
TMUB2-204ENST00000538716 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.32■■□□□ 1.48
TMUB2-204ENST00000538716 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.29■■□□□ 1.48
TMUB2-204ENST00000538716 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.29■■□□□ 1.48
TMUB2-204ENST00000538716 CUL7Q14999 1698 aa24.26■■□□□ 1.47
TMUB2-204ENST00000538716 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
TMUB2-204ENST00000538716 TOPBP1Q92547 1522 aa24.22■■□□□ 1.47
TMUB2-204ENST00000538716 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
TMUB2-204ENST00000538716 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
TMUB2-204ENST00000538716 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.19■■□□□ 1.46
TMUB2-204ENST00000538716 WDR97A6NE52 1622 aa24.18■■□□□ 1.46
TMUB2-204ENST00000538716 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.17■■□□□ 1.46
TMUB2-204ENST00000538716 FMN1Q68DA7 1419 aa24.17■■□□□ 1.46
TMUB2-204ENST00000538716 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.15■■□□□ 1.46
TMUB2-204ENST00000538716 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.12■■□□□ 1.45
TMUB2-204ENST00000538716 P3H3Q8IVL6 736 aa24.12■■□□□ 1.45
TMUB2-204ENST00000538716 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
TMUB2-204ENST00000538716 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.1■■□□□ 1.45
TMUB2-204ENST00000538716 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.1■■□□□ 1.45
TMUB2-204ENST00000538716 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
TMUB2-204ENST00000538716 SAMD9Q5K651 1589 aa24.04■■□□□ 1.44
TMUB2-204ENST00000538716 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
TMUB2-204ENST00000538716 HFM1A2PYH4 1435 aa24.03■■□□□ 1.44
TMUB2-204ENST00000538716 CCER2I3L3R5 266 aa24.02■■□□□ 1.44
TMUB2-204ENST00000538716 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
TMUB2-204ENST00000538716 UACAQ9BZF9 1416 aa24■■□□□ 1.43
TMUB2-204ENST00000538716 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24■■□□□ 1.43
TMUB2-204ENST00000538716 KCNH8Q96L42 1107 aa23.99■■□□□ 1.43
TMUB2-204ENST00000538716 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.98■■□□□ 1.43
TMUB2-204ENST00000538716 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.98■■□□□ 1.43
TMUB2-204ENST00000538716 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.97■■□□□ 1.43
TMUB2-204ENST00000538716 GRIN2BQ13224 1484 aa23.97■■□□□ 1.43
TMUB2-204ENST00000538716 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
TMUB2-204ENST00000538716 NESP48681 1621 aa23.96■■□□□ 1.43
TMUB2-204ENST00000538716 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.95■■□□□ 1.42
TMUB2-204ENST00000538716 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.94■■□□□ 1.42
TMUB2-204ENST00000538716 PTPRKQ15262 1439 aa23.93■■□□□ 1.42
TMUB2-204ENST00000538716 TONSLQ96HA7 1378 aa23.92■■□□□ 1.42
TMUB2-204ENST00000538716 NCOA2Q15596 1464 aa23.92■■□□□ 1.42
TMUB2-204ENST00000538716 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.92■■□□□ 1.42
TMUB2-204ENST00000538716 NAIPQ13075 1403 aa23.9■■□□□ 1.42
TMUB2-204ENST00000538716 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.9■■□□□ 1.42
TMUB2-204ENST00000538716 ARHGEF11O15085 1522 aa23.88■■□□□ 1.41
TMUB2-204ENST00000538716 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.88■■□□□ 1.41
TMUB2-204ENST00000538716 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
TMUB2-204ENST00000538716 ANP32CO43423 234 aa23.88■■□□□ 1.41
TMUB2-204ENST00000538716 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.88■■□□□ 1.41
TMUB2-204ENST00000538716 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.86■■□□□ 1.41
TMUB2-204ENST00000538716 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.85■■□□□ 1.41
TMUB2-204ENST00000538716 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
TMUB2-204ENST00000538716 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.4
TMUB2-204ENST00000538716 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.82■■□□□ 1.4
TMUB2-204ENST00000538716 AKNAQ7Z591 1439 aa23.81■■□□□ 1.4
TMUB2-204ENST00000538716 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.79■■□□□ 1.4
TMUB2-204ENST00000538716 FKBP8Q14318 412 aa23.74■■□□□ 1.39
TMUB2-204ENST00000538716 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.73■■□□□ 1.39
TMUB2-204ENST00000538716 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
TMUB2-204ENST00000538716 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.72■■□□□ 1.39
TMUB2-204ENST00000538716 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
TMUB2-204ENST00000538716 HECW1Q76N89 1606 aa23.72■■□□□ 1.39
TMUB2-204ENST00000538716 NEFLP07196 543 aa23.71■■□□□ 1.39
TMUB2-204ENST00000538716 MIA2Q96PC5 1412 aa23.71■■□□□ 1.39
TMUB2-204ENST00000538716 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
TMUB2-204ENST00000538716 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
TMUB2-204ENST00000538716 IQGAP2Q13576 1575 aa23.62■■□□□ 1.37
TMUB2-204ENST00000538716 TRIM52Q96A61 297 aa23.6■■□□□ 1.37
TMUB2-204ENST00000538716 BCANQ96GW7 911 aa23.58■■□□□ 1.37
TMUB2-204ENST00000538716 WDR62O43379 1518 aa23.58■■□□□ 1.37
TMUB2-204ENST00000538716 PBRM1Q86U86 1689 aa23.58■■□□□ 1.36
TMUB2-204ENST00000538716 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.58■■□□□ 1.36
TMUB2-204ENST00000538716 ADAMTS12P58397 1594 aa23.57■■□□□ 1.36
TMUB2-204ENST00000538716 ROCK1Q13464 1354 aa23.56■■□□□ 1.36
TMUB2-204ENST00000538716 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
TMUB2-204ENST00000538716 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.54■■□□□ 1.36
TMUB2-204ENST00000538716 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.54■■□□□ 1.36
TMUB2-204ENST00000538716 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
TMUB2-204ENST00000538716 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.53■■□□□ 1.36
TMUB2-204ENST00000538716 KDM6BO15054 1643 aa23.51■■□□□ 1.35
TMUB2-204ENST00000538716 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.5■■□□□ 1.35
TMUB2-204ENST00000538716 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.49■■□□□ 1.35
TMUB2-204ENST00000538716 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
TMUB2-204ENST00000538716 NCOA1Q15788 1441 aa23.46■■□□□ 1.35
TMUB2-204ENST00000538716 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.45■■□□□ 1.35
TMUB2-204ENST00000538716 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.45■■□□□ 1.35
TMUB2-204ENST00000538716 DAPK1P53355 1430 aa23.45■■□□□ 1.34
TMUB2-204ENST00000538716 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
TMUB2-204ENST00000538716 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.44■■□□□ 1.34
TMUB2-204ENST00000538716 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.43■■□□□ 1.34
TMUB2-204ENST00000538716 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TMUB2-204ENST00000538716 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
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