RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534468.1

GMDS-AS1-214, humanhuman

TSL 3

Gene GMDS-AS1, Length 724 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-214ENST00000534468 CUX1P39880 1505 aa21.87■■□□□ 1.09
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GMDS-AS1-214ENST00000534468 PBRM1Q86U86 1689 aa21.77■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-214ENST00000534468 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.71■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.67■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.67■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-214ENST00000534468 GRIN2AQ12879 1464 aa21.66■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-214ENST00000534468 CEP170Q5SW79 1584 aa21.62■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-214ENST00000534468 NUP160Q12769 1436 aa21.62■■□□□ 1.05
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GMDS-AS1-214ENST00000534468 SHROOM2Q13796 1616 aa21.54■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-214ENST00000534468 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.54■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-214ENST00000534468 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.52■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-214ENST00000534468 JPH4Q96JJ6 628 aa21.48■■□□□ 1.03
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GMDS-AS1-214ENST00000534468 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.47■■□□□ 1.03
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GMDS-AS1-214ENST00000534468 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.42■■□□□ 1.02
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.4■■□□□ 1.02
GMDS-AS1-214ENST00000534468 TOP2BQ02880 1626 aa21.39■■□□□ 1.01
GMDS-AS1-214ENST00000534468 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.37■■□□□ 1.01
GMDS-AS1-214ENST00000534468 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.33■■□□□ 1.01
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GMDS-AS1-214ENST00000534468 MAPKBP1O60336 1514 aa21.32■■□□□ 1
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GMDS-AS1-214ENST00000534468 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.24■□□□□ 0.99
GMDS-AS1-214ENST00000534468 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.24■□□□□ 0.99
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GMDS-AS1-214ENST00000534468 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.16■□□□□ 0.98
GMDS-AS1-214ENST00000534468 PTPRGP23470 1445 aa21.1■□□□□ 0.97
GMDS-AS1-214ENST00000534468 IGF1RP08069 1367 aa21.09■□□□□ 0.97
GMDS-AS1-214ENST00000534468 KCNA4P22459 653 aa21.08■□□□□ 0.97
GMDS-AS1-214ENST00000534468 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
GMDS-AS1-214ENST00000534468 KIF27Q86VH2 1401 aa21.02■□□□□ 0.96
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ABCC2Q92887 1545 aa21.01■□□□□ 0.95
GMDS-AS1-214ENST00000534468 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.01■□□□□ 0.95
GMDS-AS1-214ENST00000534468 TNIKQ9UKE5 1360 aa21■□□□□ 0.95
GMDS-AS1-214ENST00000534468 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21■□□□□ 0.95
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ASXL2Q76L83 1435 aa21■□□□□ 0.95
GMDS-AS1-214ENST00000534468 CUL7Q14999 1698 aa20.99■□□□□ 0.95
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GMDS-AS1-214ENST00000534468 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.94■□□□□ 0.94
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GMDS-AS1-214ENST00000534468 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.86■□□□□ 0.93
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GMDS-AS1-214ENST00000534468 HECW2Q9P2P5 1572 aa20.84■□□□□ 0.93
GMDS-AS1-214ENST00000534468 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.82■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-214ENST00000534468 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa20.82■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-214ENST00000534468 DISP1Q96F81 1524 aa20.79■□□□□ 0.92
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GMDS-AS1-214ENST00000534468 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.71■□□□□ 0.91
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GMDS-AS1-214ENST00000534468 CD109Q6YHK3 1445 aa20.67■□□□□ 0.9
GMDS-AS1-214ENST00000534468 KCNH8Q96L42 1107 aa20.66■□□□□ 0.9
GMDS-AS1-214ENST00000534468 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.66■□□□□ 0.9
GMDS-AS1-214ENST00000534468 FBXO41Q8TF61 875 aa20.65■□□□□ 0.9
GMDS-AS1-214ENST00000534468 KIAA0556O60303 1618 aa20.64■□□□□ 0.9
GMDS-AS1-214ENST00000534468 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.64■□□□□ 0.9
GMDS-AS1-214ENST00000534468 SLC4A2P04920 1241 aa20.63■□□□□ 0.89
GMDS-AS1-214ENST00000534468 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.59■□□□□ 0.89
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GMDS-AS1-214ENST00000534468 GOLGA3Q08378 1498 aa20.53■□□□□ 0.88
GMDS-AS1-214ENST00000534468 KIF21BO75037 1637 aa20.52■□□□□ 0.88
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ABCA8O94911 1581 aa20.51■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ARAP3Q8WWN8 1544 aa20.5■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-214ENST00000534468 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-214ENST00000534468 CAPN15O75808 1086 aa20.48■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-214ENST00000534468 PTPRMP28827 1452 aa20.46■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-214ENST00000534468 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.46■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-214ENST00000534468 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.45■□□□□ 0.86
GMDS-AS1-214ENST00000534468 DSG3P32926 999 aa20.43■□□□□ 0.86
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ARID3CA6NKF2 412 aa20.42■□□□□ 0.86
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ADAMTSL3P82987 1691 aa20.42■□□□□ 0.86
GMDS-AS1-214ENST00000534468 RAPGEF3O95398 923 aa20.41■□□□□ 0.86
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ATP10BO94823 1461 aa20.37■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-214ENST00000534468 P3H3Q8IVL6 736 aa20.34■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-214ENST00000534468 NEO1Q92859 1461 aa20.33■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-214ENST00000534468 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.33■□□□□ 0.84
GMDS-AS1-214ENST00000534468 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
GMDS-AS1-214ENST00000534468 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.31■□□□□ 0.84
GMDS-AS1-214ENST00000534468 LMTK3Q96Q04 1460 aa20.3■□□□□ 0.84
GMDS-AS1-214ENST00000534468 PRXQ9BXM0 1461 aa20.3■□□□□ 0.84
GMDS-AS1-214ENST00000534468 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
GMDS-AS1-214ENST00000534468 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
GMDS-AS1-214ENST00000534468 MADDQ8WXG6 1647 aa20.27■□□□□ 0.84
GMDS-AS1-214ENST00000534468 HSPA2P54652 639 aa20.23■□□□□ 0.83
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