RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519835.5

CPEB4-207, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CPEB4, Length 2,257 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CPEB4-207ENST00000519835 ARHGEF11O15085 1522 aa16.75■□□□□ 0.27
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CPEB4-207ENST00000519835 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.71■□□□□ 0.27
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CPEB4-207ENST00000519835 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.26
CPEB4-207ENST00000519835 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa16.64■□□□□ 0.25
CPEB4-207ENST00000519835 CNTLNQ9NXG0 1405 aa16.62■□□□□ 0.25
CPEB4-207ENST00000519835 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP16.61■□□□□ 0.25
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CPEB4-207ENST00000519835 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
CPEB4-207ENST00000519835 PBRM1Q86U86 1689 aa16.59■□□□□ 0.25
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CPEB4-207ENST00000519835 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
CPEB4-207ENST00000519835 KDM6BO15054 1643 aa16.57■□□□□ 0.24
CPEB4-207ENST00000519835 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP16.57■□□□□ 0.243e-7■■■□□ 17
CPEB4-207ENST00000519835 IQGAP2Q13576 1575 aa16.56■□□□□ 0.24
CPEB4-207ENST00000519835 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
CPEB4-207ENST00000519835 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
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CPEB4-207ENST00000519835 FANCIQ9NVI1 1328 aa16.55■□□□□ 0.24
CPEB4-207ENST00000519835 NCOA1Q15788 1441 aa16.55■□□□□ 0.24
CPEB4-207ENST00000519835 WDR62O43379 1518 aa16.55■□□□□ 0.24
CPEB4-207ENST00000519835 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
CPEB4-207ENST00000519835 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.52■□□□□ 0.24
CPEB4-207ENST00000519835 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa16.52■□□□□ 0.24
CPEB4-207ENST00000519835 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
CPEB4-207ENST00000519835 ADAMTS12P58397 1594 aa16.51■□□□□ 0.23
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CPEB4-207ENST00000519835 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
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