RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497115.5

ETV1-223, Transcript of ETS variant 1, human

TSL 4

Gene ETV1, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ETV1-223	ENST00000497115	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
ETV1-223	ENST00000497115	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ETV1-223	ENST00000497115	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ETV1-223	ENST00000497115	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ETV1-223	ENST00000497115	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
ETV1-223	ENST00000497115	RASEF	Q8IZ41	740 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ETV1-223	ENST00000497115	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ETV1-223	ENST00000497115	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ETV1-223	ENST00000497115	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
ETV1-223	ENST00000497115	CFAP44	Q96MT7	982 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ETV1-223	ENST00000497115	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
ETV1-223	ENST00000497115	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ETV1-223	ENST00000497115	CHADL	Q6NUI6	762 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ETV1-223	ENST00000497115	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ETV1-223	ENST00000497115	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ETV1-223	ENST00000497115	PYGB	P11216	843 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ETV1-223	ENST00000497115	STK25	O00506	426 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ETV1-223	ENST00000497115	BCAN	Q96GW7	911 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ETV1-223	ENST00000497115	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ETV1-223	ENST00000497115	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	13.65	□□□□□ -0.22
ETV1-223	ENST00000497115	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ETV1-223	ENST00000497115	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ETV1-223	ENST00000497115	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ETV1-223	ENST00000497115	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ETV1-223	ENST00000497115	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ETV1-223	ENST00000497115	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ETV1-223	ENST00000497115	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ETV1-223	ENST00000497115	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ETV1-223	ENST00000497115	STK24	Q9Y6E0	443 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ETV1-223	ENST00000497115	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ETV1-223	ENST00000497115	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ETV1-223	ENST00000497115	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ETV1-223	ENST00000497115	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
ETV1-223	ENST00000497115	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
ETV1-223	ENST00000497115	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ETV1-223	ENST00000497115	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
ETV1-223	ENST00000497115	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ETV1-223	ENST00000497115	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ETV1-223	ENST00000497115	PSEN1	P49768	467 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ETV1-223	ENST00000497115	KIF12	Q96FN5	646 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ETV1-223	ENST00000497115	IFNL1	Q8IU54	200 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ETV1-223	ENST00000497115	MAP3K13	O43283	966 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ETV1-223	ENST00000497115	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
ETV1-223	ENST00000497115	NBR1	Q14596	966 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ETV1-223	ENST00000497115	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ETV1-223	ENST00000497115	MFRP	Q9BY79	579 aa		13.27	□□□□□ -0.29
ETV1-223	ENST00000497115	SOX12	O15370	315 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ETV1-223	ENST00000497115	PHF12	Q96QT6	1004 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ETV1-223	ENST00000497115	CABP2	Q9NPB3	220 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ETV1-223	ENST00000497115	NLRP6	P59044	892 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ETV1-223	ENST00000497115	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ETV1-223	ENST00000497115	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
ETV1-223	ENST00000497115	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ETV1-223	ENST00000497115	P3H3	Q8IVL6	736 aa		13.17	□□□□□ -0.3
ETV1-223	ENST00000497115	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ETV1-223	ENST00000497115	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ETV1-223	ENST00000497115	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ETV1-223	ENST00000497115	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ETV1-223	ENST00000497115	WDR70	Q9NW82	654 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ETV1-223	ENST00000497115	PPP1R37	O75864	691 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ETV1-223	ENST00000497115	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ETV1-223	ENST00000497115	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		13.07	□□□□□ -0.32
ETV1-223	ENST00000497115	GOLGA2	Q08379	1002 aa		13.04	□□□□□ -0.32
ETV1-223	ENST00000497115	TIE1	P35590	1138 aa		13.03	□□□□□ -0.32
ETV1-223	ENST00000497115	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		13.03	□□□□□ -0.32
ETV1-223	ENST00000497115	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		13.02	□□□□□ -0.33
ETV1-223	ENST00000497115	TRPC6	Q9Y210	931 aa		13.01	□□□□□ -0.33
ETV1-223	ENST00000497115	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
ETV1-223	ENST00000497115	CLCN6	P51797	869 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ETV1-223	ENST00000497115	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		12.95	□□□□□ -0.34
ETV1-223	ENST00000497115	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
ETV1-223	ENST00000497115	E2F4	Q16254	413 aa		12.92	□□□□□ -0.34
ETV1-223	ENST00000497115	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
ETV1-223	ENST00000497115	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
ETV1-223	ENST00000497115	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		12.91	□□□□□ -0.34
ETV1-223	ENST00000497115	PDE4A	P27815	886 aa		12.9	□□□□□ -0.34
ETV1-223	ENST00000497115	MFSD10	Q14728	455 aa		12.9	□□□□□ -0.34
ETV1-223	ENST00000497115	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		12.9	□□□□□ -0.34
ETV1-223	ENST00000497115	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
ETV1-223	ENST00000497115	HAX1	O00165	279 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ETV1-223	ENST00000497115	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	12.86	□□□□□ -0.35
ETV1-223	ENST00000497115	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
ETV1-223	ENST00000497115	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ETV1-223	ENST00000497115	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
ETV1-223	ENST00000497115	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ETV1-223	ENST00000497115	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ETV1-223	ENST00000497115	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	12.79	□□□□□ -0.36
ETV1-223	ENST00000497115	EVX2	Q03828	476 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ETV1-223	ENST00000497115	CAMK2B	Q13554	666 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ETV1-223	ENST00000497115	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ETV1-223	ENST00000497115	IER5L	Q5T953	404 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ETV1-223	ENST00000497115	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
ETV1-223	ENST00000497115	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
ETV1-223	ENST00000497115	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
ETV1-223	ENST00000497115	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
ETV1-223	ENST00000497115	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
ETV1-223	ENST00000497115	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
ETV1-223	ENST00000497115	MICALL2	Q8IY33	904 aa		12.72	□□□□□ -0.37
ETV1-223	ENST00000497115	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	12.71	□□□□□ -0.37
ETV1-223	ENST00000497115	SEMA3E	O15041	775 aa		12.7	□□□□□ -0.38

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