RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485206.1

COL18A1-AS1-202, COL18A1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene COL18A1-AS1, Length 2,341 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.9■■□□□ 1.9
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 FKBP8Q14318 412 aa26.87■■□□□ 1.89
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.83■■□□□ 1.89
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 IGF1RP08069 1367 aa26.82■■□□□ 1.88
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.81■■□□□ 1.88
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 WDR97A6NE52 1622 aa26.73■■□□□ 1.87
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 ARAP1Q96P48 1450 aa26.73■■□□□ 1.87
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.69■■□□□ 1.86
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 ITGAEP38570 1179 aa26.64■■□□□ 1.86
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 NEFLP07196 543 aa26.62■■□□□ 1.85
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.61■■□□□ 1.85
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 MAPKBP1O60336 1514 aa26.59■■□□□ 1.85
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.59■■□□□ 1.85
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.58■■□□□ 1.85
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 CUL7Q14999 1698 aa26.57■■□□□ 1.84
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.55■■□□□ 1.84
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 MSH5O43196 834 aa26.53■■□□□ 1.84
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 TRIM52Q96A61 297 aa26.53■■□□□ 1.84
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.5■■□□□ 1.83
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.49■■□□□ 1.83
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 WDR62O43379 1518 aa26.44■■□□□ 1.82
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.43■■□□□ 1.82
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 CCER2I3L3R5 266 aa26.39■■□□□ 1.82
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.38■■□□□ 1.81
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 ERCC6Q03468 1493 aa26.36■■□□□ 1.81
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 PBRM1Q86U86 1689 aa26.36■■□□□ 1.81
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 ANP32CO43423 234 aa26.35■■□□□ 1.81
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.35■■□□□ 1.81
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.3■■□□□ 1.8
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 IFT140Q96RY7 1462 aa26.3■■□□□ 1.8
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.3■■□□□ 1.8
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.22■■□□□ 1.79
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.22■■□□□ 1.79
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 ADAMTS12P58397 1594 aa26.21■■□□□ 1.79
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 GRIN2BQ13224 1484 aa26.2■■□□□ 1.79
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.79
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.19■■□□□ 1.78
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.18■■□□□ 1.78
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 TIAM1Q13009 1591 aa26.18■■□□□ 1.78
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.16■■□□□ 1.78
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.14■■□□□ 1.78
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 P3H3Q8IVL6 736 aa26.14■■□□□ 1.78
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.11■■□□□ 1.77
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 SAMD9Q5K651 1589 aa26.1■■□□□ 1.77
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.1■■□□□ 1.77
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 MAP3K1Q13233 1512 aa26.09■■□□□ 1.77
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.03■■□□□ 1.76
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.02■■□□□ 1.76
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.01■■□□□ 1.75
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 IQGAP2Q13576 1575 aa26■■□□□ 1.75
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.99■■□□□ 1.75
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 FMN1Q68DA7 1419 aa25.99■■□□□ 1.75
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 TONSLQ96HA7 1378 aa25.98■■□□□ 1.75
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 DEKP35659 375 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.94■■□□□ 1.74
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.93■■□□□ 1.74
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 GRIN2AQ12879 1464 aa25.92■■□□□ 1.74
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.9■■□□□ 1.74
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.86■■□□□ 1.73
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.85■■□□□ 1.73
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.85■■□□□ 1.73
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 SYNJ2O15056 1496 aa25.85■■□□□ 1.73
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.85■■□□□ 1.73
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 CCDC184Q52MB2 194 aa25.8■■□□□ 1.72
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.78■■□□□ 1.72
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.78■■□□□ 1.72
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 CEP170Q5SW79 1584 aa25.78■■□□□ 1.72
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 NBR1Q14596 966 aa25.76■■□□□ 1.71
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.76■■□□□ 1.71
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.74■■□□□ 1.71
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 KIAA0556O60303 1618 aa25.74■■□□□ 1.71
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 UACAQ9BZF9 1416 aa25.74■■□□□ 1.71
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 DISP1Q96F81 1524 aa25.73■■□□□ 1.71
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 FBLN2P98095 1184 aa25.7■■□□□ 1.7
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 NUP160Q12769 1436 aa25.7■■□□□ 1.7
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 HECW1Q76N89 1606 aa25.7■■□□□ 1.7
COL18A1-AS1-202ENST00000485206 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 190.6 ms