RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468045.5

PREB-208, Transcript of prolactin regulatory element binding, humanhuman

TSL 2

Gene PREB, Length 3,057 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREB-208ENST00000468045 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.12■■□□□ 1.61
PREB-208ENST00000468045 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.11■■□□□ 1.61
PREB-208ENST00000468045 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.1■■□□□ 1.61
PREB-208ENST00000468045 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.1■■□□□ 1.61
PREB-208ENST00000468045 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.09■■□□□ 1.61
PREB-208ENST00000468045 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.07■■□□□ 1.6
PREB-208ENST00000468045 CCER2I3L3R5 266 aa25.06■■□□□ 1.6
PREB-208ENST00000468045 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25■■□□□ 1.59
PREB-208ENST00000468045 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.99■■□□□ 1.59
PREB-208ENST00000468045 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.59
PREB-208ENST00000468045 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
PREB-208ENST00000468045 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
PREB-208ENST00000468045 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.96■■□□□ 1.59
PREB-208ENST00000468045 P3H3Q8IVL6 736 aa24.93■■□□□ 1.58
PREB-208ENST00000468045 KIF27Q86VH2 1401 aa24.93■■□□□ 1.58
PREB-208ENST00000468045 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.92■■□□□ 1.58
PREB-208ENST00000468045 CUX1P39880 1505 aa24.89■■□□□ 1.58
PREB-208ENST00000468045 TIAM1Q13009 1591 aa24.87■■□□□ 1.57
PREB-208ENST00000468045 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.84■■□□□ 1.57
PREB-208ENST00000468045 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.8■■□□□ 1.56
PREB-208ENST00000468045 TONSLQ96HA7 1378 aa24.8■■□□□ 1.56
PREB-208ENST00000468045 CCDC184Q52MB2 194 aa24.77■■□□□ 1.56
PREB-208ENST00000468045 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.76■■□□□ 1.55
PREB-208ENST00000468045 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PREB-208ENST00000468045 IGF1RP08069 1367 aa24.7■■□□□ 1.54
PREB-208ENST00000468045 NBR1Q14596 966 aa24.69■■□□□ 1.54
PREB-208ENST00000468045 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.68■■□□□ 1.54
PREB-208ENST00000468045 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.65■■□□□ 1.54
PREB-208ENST00000468045 MAP3K1Q13233 1512 aa24.64■■□□□ 1.54
PREB-208ENST00000468045 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.64■■□□□ 1.53
PREB-208ENST00000468045 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
PREB-208ENST00000468045 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.61■■□□□ 1.53
PREB-208ENST00000468045 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
PREB-208ENST00000468045 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
PREB-208ENST00000468045 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
PREB-208ENST00000468045 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.57■■□□□ 1.52
PREB-208ENST00000468045 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.55■■□□□ 1.52
PREB-208ENST00000468045 PTPRKQ15262 1439 aa24.54■■□□□ 1.52
PREB-208ENST00000468045 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
PREB-208ENST00000468045 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.52■■□□□ 1.526e-8■■■■■ 45.6
PREB-208ENST00000468045 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.52■■□□□ 1.52
PREB-208ENST00000468045 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.52■■□□□ 1.52
PREB-208ENST00000468045 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
PREB-208ENST00000468045 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
PREB-208ENST00000468045 MRS2Q9HD23 443 aa24.49■■□□□ 1.51
PREB-208ENST00000468045 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.49■■□□□ 1.51
PREB-208ENST00000468045 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.48■■□□□ 1.51
PREB-208ENST00000468045 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.46■■□□□ 1.51
PREB-208ENST00000468045 UACAQ9BZF9 1416 aa24.46■■□□□ 1.51
PREB-208ENST00000468045 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.45■■□□□ 1.5
PREB-208ENST00000468045 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.44■■□□□ 1.5
PREB-208ENST00000468045 CFTRP13569 1480 aa24.43■■□□□ 1.5
PREB-208ENST00000468045 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PREB-208ENST00000468045 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.43■■□□□ 1.5
PREB-208ENST00000468045 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.42■■□□□ 1.5
PREB-208ENST00000468045 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.41■■□□□ 1.5
PREB-208ENST00000468045 HFM1A2PYH4 1435 aa24.39■■□□□ 1.49
PREB-208ENST00000468045 FOXD1Q16676 465 aa24.38■■□□□ 1.49
PREB-208ENST00000468045 NAIPQ13075 1403 aa24.38■■□□□ 1.49
PREB-208ENST00000468045 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.37■■□□□ 1.49
PREB-208ENST00000468045 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.37■■□□□ 1.49
PREB-208ENST00000468045 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.37■■□□□ 1.49
PREB-208ENST00000468045 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.36■■□□□ 1.49
PREB-208ENST00000468045 AKNAQ7Z591 1439 aa24.35■■□□□ 1.49
PREB-208ENST00000468045 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.35■■□□□ 1.49
PREB-208ENST00000468045 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.34■■□□□ 1.49
PREB-208ENST00000468045 NCAPD3P42695 1498 aa24.33■■□□□ 1.48
PREB-208ENST00000468045 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.32■■□□□ 1.48
PREB-208ENST00000468045 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.32■■□□□ 1.48
PREB-208ENST00000468045 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.31■■□□□ 1.48
PREB-208ENST00000468045 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.31■■□□□ 1.48
PREB-208ENST00000468045 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
PREB-208ENST00000468045 CCDC7Q96M83 1385 aa24.28■■□□□ 1.48
PREB-208ENST00000468045 NCOA2Q15596 1464 aa24.28■■□□□ 1.48
PREB-208ENST00000468045 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
PREB-208ENST00000468045 HMGXB3Q12766 1538 aa24.26■■□□□ 1.47
PREB-208ENST00000468045 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
PREB-208ENST00000468045 FMN1Q68DA7 1419 aa24.25■■□□□ 1.47
PREB-208ENST00000468045 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
PREB-208ENST00000468045 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
PREB-208ENST00000468045 IL27Q8NEV9 243 aa24.23■■□□□ 1.47
PREB-208ENST00000468045 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
PREB-208ENST00000468045 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.23■■□□□ 1.47
PREB-208ENST00000468045 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.23■■□□□ 1.47
PREB-208ENST00000468045 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
PREB-208ENST00000468045 NCOA1Q15788 1441 aa24.2■■□□□ 1.46
PREB-208ENST00000468045 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
PREB-208ENST00000468045 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.19■■□□□ 1.46
PREB-208ENST00000468045 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.18■■□□□ 1.46
PREB-208ENST00000468045 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.17■■□□□ 1.46
PREB-208ENST00000468045 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.17■■□□□ 1.46
PREB-208ENST00000468045 KDM6BO15054 1643 aa24.14■■□□□ 1.46
PREB-208ENST00000468045 NUDCQ9Y266 331 aa24.14■■□□□ 1.45
PREB-208ENST00000468045 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.13■■□□□ 1.45
PREB-208ENST00000468045 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
PREB-208ENST00000468045 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
PREB-208ENST00000468045 ARID3CA6NKF2 412 aa24.1■■□□□ 1.45
PREB-208ENST00000468045 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PREB-208ENST00000468045 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.09■■□□□ 1.45
PREB-208ENST00000468045 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.08■■□□□ 1.45
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