RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460567.5

SUCLG2-202, Transcript of succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SUCLG2, Length 1,596 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2-202ENST00000460567 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.32■■□□□ 1.32
SUCLG2-202ENST00000460567 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SUCLG2-202ENST00000460567 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SUCLG2-202ENST00000460567 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SUCLG2-202ENST00000460567 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.29■■□□□ 1.32
SUCLG2-202ENST00000460567 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SUCLG2-202ENST00000460567 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.28■■□□□ 1.32
SUCLG2-202ENST00000460567 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.26■■□□□ 1.31
SUCLG2-202ENST00000460567 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.25■■□□□ 1.31
SUCLG2-202ENST00000460567 FMN1Q68DA7 1419 aa23.21■■□□□ 1.31
SUCLG2-202ENST00000460567 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.21■■□□□ 1.31
SUCLG2-202ENST00000460567 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.18■■□□□ 1.3
SUCLG2-202ENST00000460567 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SUCLG2-202ENST00000460567 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SUCLG2-202ENST00000460567 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.16■■□□□ 1.3
SUCLG2-202ENST00000460567 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.14■■□□□ 1.29
SUCLG2-202ENST00000460567 SAMD9Q5K651 1589 aa23.12■■□□□ 1.29
SUCLG2-202ENST00000460567 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SUCLG2-202ENST00000460567 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
SUCLG2-202ENST00000460567 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.06■■□□□ 1.28
SUCLG2-202ENST00000460567 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SUCLG2-202ENST00000460567 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.03■■□□□ 1.28
SUCLG2-202ENST00000460567 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
SUCLG2-202ENST00000460567 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.01■■□□□ 1.27
SUCLG2-202ENST00000460567 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.01■■□□□ 1.27
SUCLG2-202ENST00000460567 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23■■□□□ 1.27
SUCLG2-202ENST00000460567 PBRM1Q86U86 1689 aa22.99■■□□□ 1.27
SUCLG2-202ENST00000460567 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.95■■□□□ 1.27
SUCLG2-202ENST00000460567 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SUCLG2-202ENST00000460567 P3H3Q8IVL6 736 aa22.93■■□□□ 1.26
SUCLG2-202ENST00000460567 GRIN2BQ13224 1484 aa22.92■■□□□ 1.26
SUCLG2-202ENST00000460567 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.92■■□□□ 1.26
SUCLG2-202ENST00000460567 IFT140Q96RY7 1462 aa22.92■■□□□ 1.26
SUCLG2-202ENST00000460567 ADAMTS12P58397 1594 aa22.92■■□□□ 1.26
SUCLG2-202ENST00000460567 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.9■■□□□ 1.26
SUCLG2-202ENST00000460567 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.9■■□□□ 1.26
SUCLG2-202ENST00000460567 WDR62O43379 1518 aa22.88■■□□□ 1.25
SUCLG2-202ENST00000460567 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.87■■□□□ 1.25
SUCLG2-202ENST00000460567 IQGAP2Q13576 1575 aa22.87■■□□□ 1.25
SUCLG2-202ENST00000460567 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.87■■□□□ 1.25
SUCLG2-202ENST00000460567 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SUCLG2-202ENST00000460567 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SUCLG2-202ENST00000460567 HECW1Q76N89 1606 aa22.85■■□□□ 1.25
SUCLG2-202ENST00000460567 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SUCLG2-202ENST00000460567 ITGAEP38570 1179 aa22.83■■□□□ 1.25
SUCLG2-202ENST00000460567 MAPKBP1O60336 1514 aa22.82■■□□□ 1.24
SUCLG2-202ENST00000460567 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.8■■□□□ 1.24
SUCLG2-202ENST00000460567 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SUCLG2-202ENST00000460567 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.79■■□□□ 1.24
SUCLG2-202ENST00000460567 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.78■■□□□ 1.24
SUCLG2-202ENST00000460567 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.77■■□□□ 1.24
SUCLG2-202ENST00000460567 NCOA2Q15596 1464 aa22.77■■□□□ 1.24
SUCLG2-202ENST00000460567 ARHGEF11O15085 1522 aa22.77■■□□□ 1.24
SUCLG2-202ENST00000460567 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.75■■□□□ 1.23
SUCLG2-202ENST00000460567 HFM1A2PYH4 1435 aa22.73■■□□□ 1.23
SUCLG2-202ENST00000460567 NEUROD1Q13562 356 aa22.72■■□□□ 1.23
SUCLG2-202ENST00000460567 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.71■■□□□ 1.23
SUCLG2-202ENST00000460567 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SUCLG2-202ENST00000460567 MIER1Q8N108 512 aa22.68■■□□□ 1.22
SUCLG2-202ENST00000460567 MIA2Q96PC5 1412 aa22.67■■□□□ 1.22
SUCLG2-202ENST00000460567 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.67■■□□□ 1.22
SUCLG2-202ENST00000460567 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SUCLG2-202ENST00000460567 AKNAQ7Z591 1439 aa22.66■■□□□ 1.22
SUCLG2-202ENST00000460567 UACAQ9BZF9 1416 aa22.65■■□□□ 1.22
SUCLG2-202ENST00000460567 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
SUCLG2-202ENST00000460567 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SUCLG2-202ENST00000460567 KIAA0556O60303 1618 aa22.61■■□□□ 1.21
SUCLG2-202ENST00000460567 GRIN2AQ12879 1464 aa22.61■■□□□ 1.21
SUCLG2-202ENST00000460567 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SUCLG2-202ENST00000460567 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SUCLG2-202ENST00000460567 ERCC6Q03468 1493 aa22.58■■□□□ 1.21
SUCLG2-202ENST00000460567 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.57■■□□□ 1.2
SUCLG2-202ENST00000460567 NAIPQ13075 1403 aa22.57■■□□□ 1.2
SUCLG2-202ENST00000460567 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.57■■□□□ 1.2
SUCLG2-202ENST00000460567 DISP1Q96F81 1524 aa22.54■■□□□ 1.2
SUCLG2-202ENST00000460567 FOXD1Q16676 465 aa22.54■■□□□ 1.2
SUCLG2-202ENST00000460567 PTPRKQ15262 1439 aa22.53■■□□□ 1.2
SUCLG2-202ENST00000460567 SYNJ2O15056 1496 aa22.53■■□□□ 1.2
SUCLG2-202ENST00000460567 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SUCLG2-202ENST00000460567 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.52■■□□□ 1.2
SUCLG2-202ENST00000460567 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.5■■□□□ 1.19
SUCLG2-202ENST00000460567 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SUCLG2-202ENST00000460567 TONSLQ96HA7 1378 aa22.46■■□□□ 1.19
SUCLG2-202ENST00000460567 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SUCLG2-202ENST00000460567 ROCK1Q13464 1354 aa22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2-202ENST00000460567 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.45■■□□□ 1.18
SUCLG2-202ENST00000460567 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.43■■□□□ 1.18
SUCLG2-202ENST00000460567 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SUCLG2-202ENST00000460567 NUP160Q12769 1436 aa22.42■■□□□ 1.18
SUCLG2-202ENST00000460567 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SUCLG2-202ENST00000460567 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
SUCLG2-202ENST00000460567 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.39■■□□□ 1.17
SUCLG2-202ENST00000460567 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SUCLG2-202ENST00000460567 CEP170Q5SW79 1584 aa22.38■■□□□ 1.17
SUCLG2-202ENST00000460567 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.37■■□□□ 1.17
SUCLG2-202ENST00000460567 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SUCLG2-202ENST00000460567 DAPK1P53355 1430 aa22.34■■□□□ 1.17
SUCLG2-202ENST00000460567 ABCC5O15440 1437 aa22.26■■□□□ 1.15
SUCLG2-202ENST00000460567 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.25■■□□□ 1.15
SUCLG2-202ENST00000460567 JPH4Q96JJ6 628 aa22.25■■□□□ 1.15
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