RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-207ENST00000454947 TNIKQ9UKE5 1360 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4-207ENST00000454947 IQGAP2Q13576 1575 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4-207ENST00000454947 SHROOM2Q13796 1616 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4-207ENST00000454947 UGGT2Q9NYU1 1516 aa15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4-207ENST00000454947 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-207ENST00000454947 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-207ENST00000454947 SAMD9Q5K651 1589 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-207ENST00000454947 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4-207ENST00000454947 DISP1Q96F81 1524 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-207ENST00000454947 UBTFP17480 764 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-207ENST00000454947 CEP162Q5TB80 1403 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-207ENST00000454947 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-207ENST00000454947 KIAA0556O60303 1618 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-207ENST00000454947 CLIP1P30622 1438 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4-207ENST00000454947 JPH4Q96JJ6 628 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4-207ENST00000454947 EHMT2Q96KQ7 1210 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP4-207ENST00000454947 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP4-207ENST00000454947 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-207ENST00000454947 ARHGEF11O15085 1522 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-207ENST00000454947 ARAP1Q96P48 1450 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-207ENST00000454947 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-207ENST00000454947 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-207ENST00000454947 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-207ENST00000454947 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-207ENST00000454947 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-207ENST00000454947 FMN1Q68DA7 1419 aa15.05■□□□□ -0
SH3BP4-207ENST00000454947 VPS8Q8N3P4 1428 aa15.05■□□□□ -0
SH3BP4-207ENST00000454947 ABCA8O94911 1581 aa15.05■□□□□ -0
SH3BP4-207ENST00000454947 PTPRGP23470 1445 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP4-207ENST00000454947 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
SH3BP4-207ENST00000454947 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-207ENST00000454947 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-207ENST00000454947 CYB5RLQ6IPT4 315 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-207ENST00000454947 FYCO1Q9BQS8 1478 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4-207ENST00000454947 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
SH3BP4-207ENST00000454947 PLB1Q6P1J6 1458 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-207ENST00000454947 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-207ENST00000454947 ABCC2Q92887 1545 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-207ENST00000454947 P3H3Q8IVL6 736 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-207ENST00000454947 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-207ENST00000454947 UACAQ9BZF9 1416 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-207ENST00000454947 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-207ENST00000454947 HECW1Q76N89 1606 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-207ENST00000454947 ADCY10Q96PN6 1610 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-207ENST00000454947 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4-207ENST00000454947 MAP3K1Q13233 1512 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4-207ENST00000454947 KDM5BQ9UGL1 1544 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4-207ENST00000454947 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SH3BP4-207ENST00000454947 CFAP43Q8NDM7 1665 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-207ENST00000454947 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-207ENST00000454947 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-207ENST00000454947 TIAM1Q13009 1591 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-207ENST00000454947 ATP10BO94823 1461 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-207ENST00000454947 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4-207ENST00000454947 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4-207ENST00000454947 MAPKBP1O60336 1514 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-207ENST00000454947 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-207ENST00000454947 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-207ENST00000454947 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-207ENST00000454947 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-207ENST00000454947 WDR7Q9Y4E6 1490 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-207ENST00000454947 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-207ENST00000454947 ASXL2Q76L83 1435 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4-207ENST00000454947 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-207ENST00000454947 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4-207ENST00000454947 TRHP20396 242 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4-207ENST00000454947 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4-207ENST00000454947 KIF14Q15058 1648 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4-207ENST00000454947 ABCC10Q5T3U5 1492 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4-207ENST00000454947 ARID3CA6NKF2 412 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4-207ENST00000454947 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4-207ENST00000454947 MTUS2Q5JR59 1369 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4-207ENST00000454947 GLI2P10070 1586 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4-207ENST00000454947 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4-207ENST00000454947 NCOA2Q15596 1464 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4-207ENST00000454947 DIP2BQ9P265 1576 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4-207ENST00000454947 ABCA9Q8IUA7 1624 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4-207ENST00000454947 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4-207ENST00000454947 TTC37Q6PGP7 1564 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4-207ENST00000454947 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4-207ENST00000454947 APLP2Q06481 763 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4-207ENST00000454947 ARAP3Q8WWN8 1544 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM69CQ0P6D2 419 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-207ENST00000454947 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-207ENST00000454947 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-207ENST00000454947 PHLDB1Q86UU1 1377 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-207ENST00000454947 PREX2Q70Z35 1606 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-207ENST00000454947 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-207ENST00000454947 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-207ENST00000454947 KCNH8Q96L42 1107 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-207ENST00000454947 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.58□□□□□ -0.07
SH3BP4-207ENST00000454947 MYOM3Q5VTT5 1437 aa14.58□□□□□ -0.07
SH3BP4-207ENST00000454947 MYO5CQ9NQX4 1742 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-207ENST00000454947 PLCH2O75038 1416 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4-207ENST00000454947 MIA2Q96PC5 1412 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4-207ENST00000454947 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4-207ENST00000454947 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-207ENST00000454947 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-207ENST00000454947 FGD6Q6ZV73 1430 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms