RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439880.6

CDC25B-205, Transcript of cell division cycle 25B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CDC25B, Length 3,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25B-205ENST00000439880 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.64■□□□□ 0.89
CDC25B-205ENST00000439880 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.62■□□□□ 0.89
CDC25B-205ENST00000439880 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CDC25B-205ENST00000439880 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.62■□□□□ 0.89
CDC25B-205ENST00000439880 MYT1Q01538 1121 aa20.6■□□□□ 0.89
CDC25B-205ENST00000439880 BCANQ96GW7 911 aa20.6■□□□□ 0.89
CDC25B-205ENST00000439880 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CDC25B-205ENST00000439880 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.55■□□□□ 0.88
CDC25B-205ENST00000439880 FBLN2P98095 1184 aa20.54■□□□□ 0.88
CDC25B-205ENST00000439880 IGF1RP08069 1367 aa20.53■□□□□ 0.88
CDC25B-205ENST00000439880 ERCC6Q03468 1493 aa20.53■□□□□ 0.88
CDC25B-205ENST00000439880 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.5■□□□□ 0.87
CDC25B-205ENST00000439880 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CDC25B-205ENST00000439880 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.49■□□□□ 0.87
CDC25B-205ENST00000439880 TOPBP1Q92547 1522 aa20.48■□□□□ 0.87
CDC25B-205ENST00000439880 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.46■□□□□ 0.87
CDC25B-205ENST00000439880 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CDC25B-205ENST00000439880 MAPKBP1O60336 1514 aa20.45■□□□□ 0.86
CDC25B-205ENST00000439880 ARID3CA6NKF2 412 aa20.44■□□□□ 0.86
CDC25B-205ENST00000439880 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.42■□□□□ 0.86
CDC25B-205ENST00000439880 TIAM1Q13009 1591 aa20.41■□□□□ 0.86
CDC25B-205ENST00000439880 FKBP8Q14318 412 aa20.41■□□□□ 0.86
CDC25B-205ENST00000439880 TRIM52Q96A61 297 aa20.4■□□□□ 0.86
CDC25B-205ENST00000439880 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.4■□□□□ 0.867e-7■■■■□ 23.7
CDC25B-205ENST00000439880 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.4■□□□□ 0.86
CDC25B-205ENST00000439880 WDR97A6NE52 1622 aa20.39■□□□□ 0.86
CDC25B-205ENST00000439880 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.38■□□□□ 0.85
CDC25B-205ENST00000439880 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.38■□□□□ 0.85
CDC25B-205ENST00000439880 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.36■□□□□ 0.85
CDC25B-205ENST00000439880 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.3■□□□□ 0.84
CDC25B-205ENST00000439880 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.3■□□□□ 0.84
CDC25B-205ENST00000439880 ANP32CO43423 234 aa20.28■□□□□ 0.84
CDC25B-205ENST00000439880 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CDC25B-205ENST00000439880 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
CDC25B-205ENST00000439880 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
CDC25B-205ENST00000439880 NEFLP07196 543 aa20.26■□□□□ 0.83
CDC25B-205ENST00000439880 TONSLQ96HA7 1378 aa20.23■□□□□ 0.83
CDC25B-205ENST00000439880 MAP3K1Q13233 1512 aa20.21■□□□□ 0.83
CDC25B-205ENST00000439880 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.2■□□□□ 0.82
CDC25B-205ENST00000439880 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.2■□□□□ 0.82
CDC25B-205ENST00000439880 PRDM2Q13029 1718 aa20.19■□□□□ 0.82
CDC25B-205ENST00000439880 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.18■□□□□ 0.82
CDC25B-205ENST00000439880 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CDC25B-205ENST00000439880 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.16■□□□□ 0.82
CDC25B-205ENST00000439880 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.15■□□□□ 0.82
CDC25B-205ENST00000439880 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.13■□□□□ 0.81
CDC25B-205ENST00000439880 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CDC25B-205ENST00000439880 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.12■□□□□ 0.81
CDC25B-205ENST00000439880 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.1■□□□□ 0.81
CDC25B-205ENST00000439880 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.1■□□□□ 0.81
CDC25B-205ENST00000439880 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.1■□□□□ 0.81
CDC25B-205ENST00000439880 CCER2I3L3R5 266 aa20.09■□□□□ 0.81
CDC25B-205ENST00000439880 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.09■□□□□ 0.81
CDC25B-205ENST00000439880 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.09■□□□□ 0.81
CDC25B-205ENST00000439880 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.09■□□□□ 0.81
CDC25B-205ENST00000439880 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.81
CDC25B-205ENST00000439880 PTPRKQ15262 1439 aa20.08■□□□□ 0.8
CDC25B-205ENST00000439880 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CDC25B-205ENST00000439880 FMN1Q68DA7 1419 aa20.03■□□□□ 0.8
CDC25B-205ENST00000439880 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CDC25B-205ENST00000439880 FOXD1Q16676 465 aa19.99■□□□□ 0.79
CDC25B-205ENST00000439880 UACAQ9BZF9 1416 aa19.99■□□□□ 0.79
CDC25B-205ENST00000439880 EFCAB5A4FU69 1503 aa19.97■□□□□ 0.79
CDC25B-205ENST00000439880 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
CDC25B-205ENST00000439880 HFM1A2PYH4 1435 aa19.96■□□□□ 0.79
CDC25B-205ENST00000439880 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP19.96■□□□□ 0.79
CDC25B-205ENST00000439880 NCOA2Q15596 1464 aa19.96■□□□□ 0.79
CDC25B-205ENST00000439880 NAIPQ13075 1403 aa19.96■□□□□ 0.79
CDC25B-205ENST00000439880 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.95■□□□□ 0.78
CDC25B-205ENST00000439880 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
CDC25B-205ENST00000439880 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19.92■□□□□ 0.78
CDC25B-205ENST00000439880 MYOM3Q5VTT5 1437 aa19.92■□□□□ 0.78
CDC25B-205ENST00000439880 WASHC2AQ641Q2 1341 aa19.92■□□□□ 0.78
CDC25B-205ENST00000439880 IFT140Q96RY7 1462 aa19.92■□□□□ 0.78
CDC25B-205ENST00000439880 CCDC184Q52MB2 194 aa19.9■□□□□ 0.78
CDC25B-205ENST00000439880 FAM9BQ8IZU0 186 aa19.9■□□□□ 0.78
CDC25B-205ENST00000439880 GRIN2BQ13224 1484 aa19.9■□□□□ 0.78
CDC25B-205ENST00000439880 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa19.89■□□□□ 0.78
CDC25B-205ENST00000439880 WDR62O43379 1518 aa19.89■□□□□ 0.77
CDC25B-205ENST00000439880 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP19.88■□□□□ 0.771e-7■■■■■ 27.9
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CDC25B-205ENST00000439880 L3MBTL2Q969R5 705 aa19.85■□□□□ 0.77
CDC25B-205ENST00000439880 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.85■□□□□ 0.77
CDC25B-205ENST00000439880 BCL11AQ9H165 835 aa19.84■□□□□ 0.77
CDC25B-205ENST00000439880 MPHOSPH9Q99550 1183 aa19.83■□□□□ 0.77
CDC25B-205ENST00000439880 POLR3GLQ9BT43 218 aa19.83■□□□□ 0.77
CDC25B-205ENST00000439880 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
CDC25B-205ENST00000439880 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
CDC25B-205ENST00000439880 JPH4Q96JJ6 628 aa19.82■□□□□ 0.76
CDC25B-205ENST00000439880 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa19.82■□□□□ 0.76
CDC25B-205ENST00000439880 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa19.81■□□□□ 0.76
CDC25B-205ENST00000439880 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
CDC25B-205ENST00000439880 MRS2Q9HD23 443 aa19.8■□□□□ 0.76
CDC25B-205ENST00000439880 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
CDC25B-205ENST00000439880 MSH5O43196 834 aa19.79■□□□□ 0.76
CDC25B-205ENST00000439880 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
CDC25B-205ENST00000439880 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa19.78■□□□□ 0.76
CDC25B-205ENST00000439880 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.75
CDC25B-205ENST00000439880 KDM5BQ9UGL1 1544 aa19.76■□□□□ 0.75
CDC25B-205ENST00000439880 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa19.75■□□□□ 0.75
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