RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-203ENST00000439720 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-203ENST00000439720 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-203ENST00000439720 FGD5Q6ZNL6 1462 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-203ENST00000439720 ERICH3Q5RHP9 1530 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-203ENST00000439720 ANP32EQ9BTT0 268 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-203ENST00000439720 SYNJ1O43426 1573 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-203ENST00000439720 KIF21BO75037 1637 aa12.58□□□□□ -0.39
RABGEF1-203ENST00000439720 CUL7Q14999 1698 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-203ENST00000439720 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-203ENST00000439720 GRIN2BQ13224 1484 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM41Q8WV44 630 aa12.56□□□□□ -0.4
RABGEF1-203ENST00000439720 CHD1O14646 1710 aa12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-203ENST00000439720 ADAMTS12P58397 1594 aa12.55□□□□□ -0.4
RABGEF1-203ENST00000439720 SOGA1O94964 1423 aa12.54□□□□□ -0.4
RABGEF1-203ENST00000439720 CLASP1Q7Z460 1538 aa12.52□□□□□ -0.4
RABGEF1-203ENST00000439720 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-203ENST00000439720 CSRNP3Q8WYN3 585 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-203ENST00000439720 SYNJ2O15056 1496 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-203ENST00000439720 SHROOM2Q13796 1616 aa12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-203ENST00000439720 MIER1Q8N108 512 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-203ENST00000439720 GAPVD1Q14C86 1478 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-203ENST00000439720 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-203ENST00000439720 FHAD1B1AJZ9 1412 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-203ENST00000439720 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-203ENST00000439720 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-203ENST00000439720 TNIKQ9UKE5 1360 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-203ENST00000439720 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-203ENST00000439720 NUP160Q12769 1436 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-203ENST00000439720 PODXL2Q9NZ53 605 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-203ENST00000439720 TAOK2Q9UL54 1235 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-203ENST00000439720 GRIN2AQ12879 1464 aa12.37□□□□□ -0.43
RABGEF1-203ENST00000439720 GOLGA3Q08378 1498 aa12.37□□□□□ -0.43
RABGEF1-203ENST00000439720 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa12.36□□□□□ -0.43
RABGEF1-203ENST00000439720 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa12.36□□□□□ -0.43
RABGEF1-203ENST00000439720 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa12.36□□□□□ -0.43
RABGEF1-203ENST00000439720 KIF27Q86VH2 1401 aa12.36□□□□□ -0.43
RABGEF1-203ENST00000439720 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa12.36□□□□□ -0.43
RABGEF1-203ENST00000439720 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP12.35□□□□□ -0.432e-7■■■□□ 15.2
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RABGEF1-203ENST00000439720 CEP170Q5SW79 1584 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-203ENST00000439720 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-203ENST00000439720 PRXQ9BXM0 1461 aa12.29□□□□□ -0.44
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RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGEF11O15085 1522 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-203ENST00000439720 CEP162Q5TB80 1403 aa12.26□□□□□ -0.45
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RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa12.25□□□□□ -0.45
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RABGEF1-203ENST00000439720 IGF1RP08069 1367 aa12.22□□□□□ -0.45
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RABGEF1-203ENST00000439720 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-203ENST00000439720 ARAP1Q96P48 1450 aa12.15□□□□□ -0.46
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RABGEF1-203ENST00000439720 SAMD9Q5K651 1589 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-203ENST00000439720 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-203ENST00000439720 VPS8Q8N3P4 1428 aa12.12□□□□□ -0.47
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RABGEF1-203ENST00000439720 EFCAB5A4FU69 1503 aa12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-203ENST00000439720 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA0556O60303 1618 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-203ENST00000439720 MAPKBP1O60336 1514 aa12.1□□□□□ -0.47
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RABGEF1-203ENST00000439720 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-203ENST00000439720 FKBP8Q14318 412 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-203ENST00000439720 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-203ENST00000439720 CFAP43Q8NDM7 1665 aa12.04□□□□□ -0.48
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RABGEF1-203ENST00000439720 GLI2P10070 1586 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-203ENST00000439720 DISP1Q96F81 1524 aa12.03□□□□□ -0.48
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RABGEF1-203ENST00000439720 ABCC2Q92887 1545 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-203ENST00000439720 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
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RABGEF1-203ENST00000439720 ERCC6L2Q5T890 1561 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNH8Q96L42 1107 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-203ENST00000439720 KDM5BQ9UGL1 1544 aa11.96□□□□□ -0.49
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RABGEF1-203ENST00000439720 JPH4Q96JJ6 628 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGEF1-203ENST00000439720 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
RABGEF1-203ENST00000439720 NEFLP07196 543 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGEF1-203ENST00000439720 DIP2BQ9P265 1576 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGEF1-203ENST00000439720 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
RABGEF1-203ENST00000439720 TIAM1Q13009 1591 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGEF1-203ENST00000439720 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGEF1-203ENST00000439720 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-203ENST00000439720 PLB1Q6P1J6 1458 aa11.9□□□□□ -0.51
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