RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436171.2

PANX1-202, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-202ENST00000436171 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
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PANX1-202ENST00000436171 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
PANX1-202ENST00000436171 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.6■■□□□ 1.85
PANX1-202ENST00000436171 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.57■■□□□ 1.84
PANX1-202ENST00000436171 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.56■■□□□ 1.84
PANX1-202ENST00000436171 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PANX1-202ENST00000436171 TIAM1Q13009 1591 aa26.52■■□□□ 1.84
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PANX1-202ENST00000436171 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.47■■□□□ 1.83
PANX1-202ENST00000436171 WDR97A6NE52 1622 aa26.46■■□□□ 1.83
PANX1-202ENST00000436171 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.45■■□□□ 1.83
PANX1-202ENST00000436171 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.45■■□□□ 1.82
PANX1-202ENST00000436171 CUL7Q14999 1698 aa26.44■■□□□ 1.82
PANX1-202ENST00000436171 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.43■■□□□ 1.82
PANX1-202ENST00000436171 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.4■■□□□ 1.82
PANX1-202ENST00000436171 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.4■■□□□ 1.82
PANX1-202ENST00000436171 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.39■■□□□ 1.82
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PANX1-202ENST00000436171 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.36■■□□□ 1.81
PANX1-202ENST00000436171 ARID3CA6NKF2 412 aa26.3■■□□□ 1.8
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PANX1-202ENST00000436171 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.29■■□□□ 1.8
PANX1-202ENST00000436171 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
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PANX1-202ENST00000436171 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.28■■□□□ 1.8
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PANX1-202ENST00000436171 FMN1Q68DA7 1419 aa26.2■■□□□ 1.79
PANX1-202ENST00000436171 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.2■■□□□ 1.78
PANX1-202ENST00000436171 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.19■■□□□ 1.78
PANX1-202ENST00000436171 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
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PANX1-202ENST00000436171 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.18■■□□□ 1.78
PANX1-202ENST00000436171 PBRM1Q86U86 1689 aa26.16■■□□□ 1.78
PANX1-202ENST00000436171 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.15■■□□□ 1.78
PANX1-202ENST00000436171 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.14■■□□□ 1.78
PANX1-202ENST00000436171 SAMD9Q5K651 1589 aa26.13■■□□□ 1.77
PANX1-202ENST00000436171 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.04■■□□□ 1.76
PANX1-202ENST00000436171 GRIN2BQ13224 1484 aa26.04■■□□□ 1.76
PANX1-202ENST00000436171 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
PANX1-202ENST00000436171 ADAMTS12P58397 1594 aa26.03■■□□□ 1.76
PANX1-202ENST00000436171 ERCC6Q03468 1493 aa26.03■■□□□ 1.76
PANX1-202ENST00000436171 FBLN2P98095 1184 aa26■■□□□ 1.75
PANX1-202ENST00000436171 NCOA2Q15596 1464 aa25.99■■□□□ 1.75
PANX1-202ENST00000436171 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PANX1-202ENST00000436171 IQGAP2Q13576 1575 aa25.99■■□□□ 1.75
PANX1-202ENST00000436171 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.98■■□□□ 1.75
PANX1-202ENST00000436171 PTPRKQ15262 1439 aa25.97■■□□□ 1.75
PANX1-202ENST00000436171 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.95■■□□□ 1.75
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PANX1-202ENST00000436171 WDR62O43379 1518 aa25.93■■□□□ 1.74
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PANX1-202ENST00000436171 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
PANX1-202ENST00000436171 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.82■■□□□ 1.72
PANX1-202ENST00000436171 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.81■■□□□ 1.72
PANX1-202ENST00000436171 HECW1Q76N89 1606 aa25.8■■□□□ 1.72
PANX1-202ENST00000436171 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
PANX1-202ENST00000436171 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.79■■□□□ 1.72
PANX1-202ENST00000436171 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.79■■□□□ 1.72
PANX1-202ENST00000436171 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
PANX1-202ENST00000436171 GRIN2AQ12879 1464 aa25.78■■□□□ 1.72
PANX1-202ENST00000436171 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
PANX1-202ENST00000436171 DISP1Q96F81 1524 aa25.76■■□□□ 1.71
PANX1-202ENST00000436171 FOXD1Q16676 465 aa25.75■■□□□ 1.71
PANX1-202ENST00000436171 NAIPQ13075 1403 aa25.74■■□□□ 1.71
PANX1-202ENST00000436171 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.74■■□□□ 1.71
PANX1-202ENST00000436171 HFM1A2PYH4 1435 aa25.73■■□□□ 1.71
PANX1-202ENST00000436171 BCANQ96GW7 911 aa25.73■■□□□ 1.71
PANX1-202ENST00000436171 KIAA0556O60303 1618 aa25.71■■□□□ 1.71
PANX1-202ENST00000436171 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.71
PANX1-202ENST00000436171 TRIM52Q96A61 297 aa25.7■■□□□ 1.71
PANX1-202ENST00000436171 ARHGEF11O15085 1522 aa25.69■■□□□ 1.7
PANX1-202ENST00000436171 TONSLQ96HA7 1378 aa25.69■■□□□ 1.7
PANX1-202ENST00000436171 CEP170Q5SW79 1584 aa25.66■■□□□ 1.7
PANX1-202ENST00000436171 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
PANX1-202ENST00000436171 UACAQ9BZF9 1416 aa25.64■■□□□ 1.7
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PANX1-202ENST00000436171 KDM6BO15054 1643 aa25.62■■□□□ 1.69
PANX1-202ENST00000436171 JPH4Q96JJ6 628 aa25.6■■□□□ 1.69
PANX1-202ENST00000436171 SYNJ2O15056 1496 aa25.59■■□□□ 1.69
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PANX1-202ENST00000436171 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
PANX1-202ENST00000436171 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
PANX1-202ENST00000436171 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.58■■□□□ 1.69
PANX1-202ENST00000436171 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
PANX1-202ENST00000436171 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
PANX1-202ENST00000436171 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
PANX1-202ENST00000436171 MIA2Q96PC5 1412 aa25.49■■□□□ 1.67
PANX1-202ENST00000436171 ANP32CO43423 234 aa25.47■■□□□ 1.67
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