RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423971.2

ACTBP13-201, Transcript of actin, beta pseudogene 13, humanhuman

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Gene ACTBP13, Length 3,959 nt, Biotype unitary pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP13-201ENST00000423971 ARAP1Q96P48 1450 aa12.51□□□□□ -0.41
ACTBP13-201ENST00000423971 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
ACTBP13-201ENST00000423971 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
ACTBP13-201ENST00000423971 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
ACTBP13-201ENST00000423971 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
ACTBP13-201ENST00000423971 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
ACTBP13-201ENST00000423971 TOPBP1Q92547 1522 aa12.49□□□□□ -0.41
ACTBP13-201ENST00000423971 KIF21BO75037 1637 aa12.49□□□□□ -0.41
ACTBP13-201ENST00000423971 TRIM52Q96A61 297 aa12.47□□□□□ -0.41
ACTBP13-201ENST00000423971 PRXQ9BXM0 1461 aa12.47□□□□□ -0.41
ACTBP13-201ENST00000423971 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa12.46□□□□□ -0.42
ACTBP13-201ENST00000423971 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
ACTBP13-201ENST00000423971 MTUS2Q5JR59 1369 aa12.44□□□□□ -0.42
ACTBP13-201ENST00000423971 SIN3AQ96ST3 1273 aa12.43□□□□□ -0.42
ACTBP13-201ENST00000423971 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa12.42□□□□□ -0.42
ACTBP13-201ENST00000423971 GAPVD1Q14C86 1478 aa12.41□□□□□ -0.42
ACTBP13-201ENST00000423971 ANP32EQ9BTT0 268 aa12.4□□□□□ -0.42
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
ACTBP13-201ENST00000423971 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa12.37□□□□□ -0.43
ACTBP13-201ENST00000423971 MYT1LQ9UL68 1186 aa12.37□□□□□ -0.43
ACTBP13-201ENST00000423971 KCNH8Q96L42 1107 aa12.36□□□□□ -0.43
ACTBP13-201ENST00000423971 CCNB3Q8WWL7 1395 aa12.36□□□□□ -0.43
ACTBP13-201ENST00000423971 POLR3GLQ9BT43 218 aa12.35□□□□□ -0.43
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
ACTBP13-201ENST00000423971 FOXD1Q16676 465 aa12.34□□□□□ -0.43
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
ACTBP13-201ENST00000423971 DNMBPQ6XZF7 1577 aa12.33□□□□□ -0.44
ACTBP13-201ENST00000423971 PHLDB1Q86UU1 1377 aa12.31□□□□□ -0.44
ACTBP13-201ENST00000423971 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa12.29□□□□□ -0.44
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
ACTBP13-201ENST00000423971 JPH4Q96JJ6 628 aa12.28□□□□□ -0.44
ACTBP13-201ENST00000423971 MIER1Q8N108 512 aa12.27□□□□□ -0.44
ACTBP13-201ENST00000423971 ERICH3Q5RHP9 1530 aa12.27□□□□□ -0.44
ACTBP13-201ENST00000423971 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa12.27□□□□□ -0.45
ACTBP13-201ENST00000423971 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa12.26□□□□□ -0.45
ACTBP13-201ENST00000423971 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa12.26□□□□□ -0.45
ACTBP13-201ENST00000423971 FHAD1B1AJZ9 1412 aa12.25□□□□□ -0.45
ACTBP13-201ENST00000423971 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
ACTBP13-201ENST00000423971 MRC2Q9UBG0 1479 aa12.24□□□□□ -0.45
ACTBP13-201ENST00000423971 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP12.22□□□□□ -0.45
ACTBP13-201ENST00000423971 BCANQ96GW7 911 aa12.22□□□□□ -0.45
ACTBP13-201ENST00000423971 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
ACTBP13-201ENST00000423971 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa12.21□□□□□ -0.45
ACTBP13-201ENST00000423971 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
ACTBP13-201ENST00000423971 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
ACTBP13-201ENST00000423971 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
ACTBP13-201ENST00000423971 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa12.19□□□□□ -0.46
ACTBP13-201ENST00000423971 NEFLP07196 543 aa12.19□□□□□ -0.46
ACTBP13-201ENST00000423971 PLEKHD1A6NEE1 506 aa12.18□□□□□ -0.46
ACTBP13-201ENST00000423971 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa12.18□□□□□ -0.46
ACTBP13-201ENST00000423971 FMN1Q68DA7 1419 aa12.17□□□□□ -0.46
ACTBP13-201ENST00000423971 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
ACTBP13-201ENST00000423971 GRIN2BQ13224 1484 aa12.16□□□□□ -0.46
ACTBP13-201ENST00000423971 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
ACTBP13-201ENST00000423971 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa12.14□□□□□ -0.47
ACTBP13-201ENST00000423971 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP12.13□□□□□ -0.47
ACTBP13-201ENST00000423971 PRDM2Q13029 1718 aa12.13□□□□□ -0.47
ACTBP13-201ENST00000423971 SETD5Q9C0A6 1442 aa12.13□□□□□ -0.47
ACTBP13-201ENST00000423971 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
ACTBP13-201ENST00000423971 TONSLQ96HA7 1378 aa12.11□□□□□ -0.47
ACTBP13-201ENST00000423971 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
ACTBP13-201ENST00000423971 TIAM1Q13009 1591 aa12.1□□□□□ -0.47
ACTBP13-201ENST00000423971 IFT140Q96RY7 1462 aa12.09□□□□□ -0.47
ACTBP13-201ENST00000423971 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa12.09□□□□□ -0.47
ACTBP13-201ENST00000423971 RGL3Q3MIN7 710 aa12.08□□□□□ -0.48
ACTBP13-201ENST00000423971 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
ACTBP13-201ENST00000423971 PLB1Q6P1J6 1458 aa12.08□□□□□ -0.48
ACTBP13-201ENST00000423971 NCOA2Q15596 1464 aa12.07□□□□□ -0.48
ACTBP13-201ENST00000423971 TSPY4P0CV99 314 aa12.06□□□□□ -0.48
ACTBP13-201ENST00000423971 TSPY10P0CW01 314 aa12.06□□□□□ -0.48
ACTBP13-201ENST00000423971 FGD6Q6ZV73 1430 aa12.06□□□□□ -0.48
ACTBP13-201ENST00000423971 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
ACTBP13-201ENST00000423971 PTPRGP23470 1445 aa12.02□□□□□ -0.48
ACTBP13-201ENST00000423971 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa12.02□□□□□ -0.48
ACTBP13-201ENST00000423971 PTPRKQ15262 1439 aa12.02□□□□□ -0.49
ACTBP13-201ENST00000423971 PLPPR3Q6T4P5 718 aa12.02□□□□□ -0.49
ACTBP13-201ENST00000423971 GRIN2AQ12879 1464 aa12.02□□□□□ -0.49
ACTBP13-201ENST00000423971 MPHOSPH9Q99550 1183 aa12.02□□□□□ -0.49
ACTBP13-201ENST00000423971 FYCO1Q9BQS8 1478 aa12.01□□□□□ -0.49
ACTBP13-201ENST00000423971 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
ACTBP13-201ENST00000423971 CUL7Q14999 1698 aa12.01□□□□□ -0.49
ACTBP13-201ENST00000423971 IQGAP2Q13576 1575 aa12.01□□□□□ -0.49
ACTBP13-201ENST00000423971 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
ACTBP13-201ENST00000423971 MYOM3Q5VTT5 1437 aa11.99□□□□□ -0.49
ACTBP13-201ENST00000423971 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa11.99□□□□□ -0.49
ACTBP13-201ENST00000423971 PKD2Q13563 968 aa11.98□□□□□ -0.49
ACTBP13-201ENST00000423971 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
ACTBP13-201ENST00000423971 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
ACTBP13-201ENST00000423971 CHGAP10645 457 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
ACTBP13-201ENST00000423971 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
ACTBP13-201ENST00000423971 L3MBTL2Q969R5 705 aa11.96□□□□□ -0.49
ACTBP13-201ENST00000423971 CCDC18Q5T9S5 1454 aa11.96□□□□□ -0.49
ACTBP13-201ENST00000423971 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa11.96□□□□□ -0.49
ACTBP13-201ENST00000423971 EFCAB5A4FU69 1503 aa11.95□□□□□ -0.5
ACTBP13-201ENST00000423971 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP11.95□□□□□ -0.5
ACTBP13-201ENST00000423971 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
ACTBP13-201ENST00000423971 CYB5RLQ6IPT4 315 aa11.95□□□□□ -0.5
ACTBP13-201ENST00000423971 CCDC136Q96JN2 1154 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP13-201ENST00000423971 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP13-201ENST00000423971 SYNJ2O15056 1496 aa11.94□□□□□ -0.5
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