RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397023.5

PPARG-208, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, human

TSL 5

Gene PPARG, Length 2,002 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPARG-208	ENST00000397023	NEFL	P07196	543 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PPARG-208	ENST00000397023	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PPARG-208	ENST00000397023	CCER2	I3L3R5	266 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PPARG-208	ENST00000397023	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
PPARG-208	ENST00000397023	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PPARG-208	ENST00000397023	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PPARG-208	ENST00000397023	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PPARG-208	ENST00000397023	WDR97	A6NE52	1622 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PPARG-208	ENST00000397023	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	13.62	□□□□□ -0.23
PPARG-208	ENST00000397023	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PPARG-208	ENST00000397023	FKBP8	Q14318	412 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PPARG-208	ENST00000397023	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PPARG-208	ENST00000397023	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PPARG-208	ENST00000397023	ANP32C	O43423	234 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PPARG-208	ENST00000397023	BCL11A	Q9H165	835 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PPARG-208	ENST00000397023	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PPARG-208	ENST00000397023	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PPARG-208	ENST00000397023	KCNH8	Q96L42	1107 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PPARG-208	ENST00000397023	ITGAE	P38570	1179 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PPARG-208	ENST00000397023	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PPARG-208	ENST00000397023	BCAN	Q96GW7	911 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PPARG-208	ENST00000397023	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PPARG-208	ENST00000397023	IGF1R	P08069	1367 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PPARG-208	ENST00000397023	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.25
PPARG-208	ENST00000397023	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PPARG-208	ENST00000397023	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PPARG-208	ENST00000397023	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PPARG-208	ENST00000397023	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PPARG-208	ENST00000397023	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PPARG-208	ENST00000397023	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PPARG-208	ENST00000397023	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PPARG-208	ENST00000397023	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PPARG-208	ENST00000397023	TONSL	Q96HA7	1378 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PPARG-208	ENST00000397023	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PPARG-208	ENST00000397023	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PPARG-208	ENST00000397023	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PPARG-208	ENST00000397023	UACA	Q9BZF9	1416 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PPARG-208	ENST00000397023	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PPARG-208	ENST00000397023	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PPARG-208	ENST00000397023	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PPARG-208	ENST00000397023	HFM1	A2PYH4	1435 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PPARG-208	ENST00000397023	TRIM52	Q96A61	297 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PPARG-208	ENST00000397023	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PPARG-208	ENST00000397023	CUL7	Q14999	1698 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PPARG-208	ENST00000397023	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PPARG-208	ENST00000397023	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PPARG-208	ENST00000397023	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		13.4	□□□□□ -0.27
PPARG-208	ENST00000397023	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PPARG-208	ENST00000397023	TOPBP1	Q92547	1522 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PPARG-208	ENST00000397023	FMN1	Q68DA7	1419 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PPARG-208	ENST00000397023	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
PPARG-208	ENST00000397023	FOXD1	Q16676	465 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PPARG-208	ENST00000397023	NES	P48681	1621 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PPARG-208	ENST00000397023	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PPARG-208	ENST00000397023	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PPARG-208	ENST00000397023	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PPARG-208	ENST00000397023	NCOA2	Q15596	1464 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PPARG-208	ENST00000397023	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PPARG-208	ENST00000397023	HECW1	Q76N89	1606 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PPARG-208	ENST00000397023	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PPARG-208	ENST00000397023	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	13.32	□□□□□ -0.28
PPARG-208	ENST00000397023	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
PPARG-208	ENST00000397023	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PPARG-208	ENST00000397023	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PPARG-208	ENST00000397023	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PPARG-208	ENST00000397023	MSH5	O43196	834 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PPARG-208	ENST00000397023	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PPARG-208	ENST00000397023	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PPARG-208	ENST00000397023	AKNA	Q7Z591	1439 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PPARG-208	ENST00000397023	NAIP	Q13075	1403 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PPARG-208	ENST00000397023	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
PPARG-208	ENST00000397023	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PPARG-208	ENST00000397023	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PPARG-208	ENST00000397023	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PPARG-208	ENST00000397023	SAMD9	Q5K651	1589 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PPARG-208	ENST00000397023	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
PPARG-208	ENST00000397023	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
PPARG-208	ENST00000397023	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PPARG-208	ENST00000397023	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PPARG-208	ENST00000397023	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
PPARG-208	ENST00000397023	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	13.23	□□□□□ -0.29
PPARG-208	ENST00000397023	ARHGEF11	O15085	1522 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PPARG-208	ENST00000397023	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PPARG-208	ENST00000397023	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
PPARG-208	ENST00000397023	PTPRK	Q15262	1439 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PPARG-208	ENST00000397023	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PPARG-208	ENST00000397023	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PPARG-208	ENST00000397023	GRIN2B	Q13224	1484 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PPARG-208	ENST00000397023	NCOA1	Q15788	1441 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PPARG-208	ENST00000397023	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PPARG-208	ENST00000397023	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
PPARG-208	ENST00000397023	P3H3	Q8IVL6	736 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PPARG-208	ENST00000397023	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PPARG-208	ENST00000397023	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PPARG-208	ENST00000397023	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PPARG-208	ENST00000397023	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
PPARG-208	ENST00000397023	CCDC7	Q96M83	1385 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PPARG-208	ENST00000397023	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
PPARG-208	ENST00000397023	MIA2	Q96PC5	1412 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PPARG-208	ENST00000397023	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3

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