RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393888.1

CNP-201, Transcript of 2',3'-cyclic nucleotide 3' phosphodiesterase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CNP, Length 2,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CNP-201ENST00000393888 CFTRP13569 1480 aa23.33■■□□□ 1.32
CNP-201ENST00000393888 NEFLP07196 543 aa23.33■■□□□ 1.32
CNP-201ENST00000393888 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.27■■□□□ 1.32
CNP-201ENST00000393888 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
CNP-201ENST00000393888 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.26■■□□□ 1.31
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CNP-201ENST00000393888 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.21■■□□□ 1.31
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CNP-201ENST00000393888 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.11■■□□□ 1.29
CNP-201ENST00000393888 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
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CNP-201ENST00000393888 P3H3Q8IVL6 736 aa23.05■■□□□ 1.28
CNP-201ENST00000393888 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.02■■□□□ 1.28
CNP-201ENST00000393888 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.02■■□□□ 1.27
CNP-201ENST00000393888 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.99■■□□□ 1.27
CNP-201ENST00000393888 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
CNP-201ENST00000393888 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.96■■□□□ 1.27
CNP-201ENST00000393888 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
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CNP-201ENST00000393888 IGF1RP08069 1367 aa22.92■■□□□ 1.26
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CNP-201ENST00000393888 ERCC6Q03468 1493 aa22.91■■□□□ 1.26
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CNP-201ENST00000393888 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.88■■□□□ 1.25
CNP-201ENST00000393888 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
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CNP-201ENST00000393888 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
CNP-201ENST00000393888 TOPBP1Q92547 1522 aa22.81■■□□□ 1.24
CNP-201ENST00000393888 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.78■■□□□ 1.24
CNP-201ENST00000393888 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.78■■□□□ 1.24
CNP-201ENST00000393888 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.77■■□□□ 1.24
CNP-201ENST00000393888 CCDC184Q52MB2 194 aa22.76■■□□□ 1.23
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CNP-201ENST00000393888 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.76■■□□□ 1.23
CNP-201ENST00000393888 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.75■■□□□ 1.23
CNP-201ENST00000393888 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.74■■□□□ 1.23
CNP-201ENST00000393888 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.72■■□□□ 1.23
CNP-201ENST00000393888 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.71■■□□□ 1.23
CNP-201ENST00000393888 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.71■■□□□ 1.23
CNP-201ENST00000393888 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.7■■□□□ 1.22
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CNP-201ENST00000393888 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CNP-201ENST00000393888 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
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CNP-201ENST00000393888 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.66■■□□□ 1.22
CNP-201ENST00000393888 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CNP-201ENST00000393888 UACAQ9BZF9 1416 aa22.65■■□□□ 1.22
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CNP-201ENST00000393888 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.21
CNP-201ENST00000393888 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.61■■□□□ 1.21
CNP-201ENST00000393888 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.6■■□□□ 1.21
CNP-201ENST00000393888 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.59■■□□□ 1.21
CNP-201ENST00000393888 HFM1A2PYH4 1435 aa22.59■■□□□ 1.21
CNP-201ENST00000393888 NBR1Q14596 966 aa22.59■■□□□ 1.21
CNP-201ENST00000393888 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.58■■□□□ 1.21
CNP-201ENST00000393888 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
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CNP-201ENST00000393888 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.57■■□□□ 1.2
CNP-201ENST00000393888 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.56■■□□□ 1.2
CNP-201ENST00000393888 NAIPQ13075 1403 aa22.56■■□□□ 1.2
CNP-201ENST00000393888 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.56■■□□□ 1.2
CNP-201ENST00000393888 MRS2Q9HD23 443 aa22.55■■□□□ 1.2
CNP-201ENST00000393888 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
CNP-201ENST00000393888 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CNP-201ENST00000393888 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CNP-201ENST00000393888 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
CNP-201ENST00000393888 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
CNP-201ENST00000393888 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.5■■□□□ 1.19
CNP-201ENST00000393888 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CNP-201ENST00000393888 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.48■■□□□ 1.19
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CNP-201ENST00000393888 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.47■■□□□ 1.19
CNP-201ENST00000393888 FMN1Q68DA7 1419 aa22.46■■□□□ 1.19
CNP-201ENST00000393888 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CNP-201ENST00000393888 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.46■■□□□ 1.19
CNP-201ENST00000393888 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.45■■□□□ 1.18
CNP-201ENST00000393888 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
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CNP-201ENST00000393888 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.45■■□□□ 1.18
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CNP-201ENST00000393888 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.41■■□□□ 1.18
CNP-201ENST00000393888 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
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CNP-201ENST00000393888 IFT140Q96RY7 1462 aa22.4■■□□□ 1.18
CNP-201ENST00000393888 AKNAQ7Z591 1439 aa22.39■■□□□ 1.18
CNP-201ENST00000393888 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.39■■□□□ 1.17
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