RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375370.9

TFDP1-201, Transcript of transcription factor Dp-1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TFDP1, Length 2,648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFDP1-201ENST00000375370 CUL7Q14999 1698 aa21.62■■□□□ 1.05
TFDP1-201ENST00000375370 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.61■■□□□ 1.05
TFDP1-201ENST00000375370 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.6■■□□□ 1.05
TFDP1-201ENST00000375370 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
TFDP1-201ENST00000375370 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.59■■□□□ 1.05
TFDP1-201ENST00000375370 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.58■■□□□ 1.05
TFDP1-201ENST00000375370 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.57■■□□□ 1.04
TFDP1-201ENST00000375370 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.56■■□□□ 1.04
TFDP1-201ENST00000375370 NEUROD1Q13562 356 aa21.55■■□□□ 1.04
TFDP1-201ENST00000375370 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
TFDP1-201ENST00000375370 P3H3Q8IVL6 736 aa21.54■■□□□ 1.04
TFDP1-201ENST00000375370 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
TFDP1-201ENST00000375370 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.54■■□□□ 1.04
TFDP1-201ENST00000375370 WDR62O43379 1518 aa21.53■■□□□ 1.04
TFDP1-201ENST00000375370 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.53■■□□□ 1.04
TFDP1-201ENST00000375370 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.53■■□□□ 1.04
TFDP1-201ENST00000375370 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.52■■□□□ 1.04
TFDP1-201ENST00000375370 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
TFDP1-201ENST00000375370 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.47■■□□□ 1.03
TFDP1-201ENST00000375370 ITGAEP38570 1179 aa21.47■■□□□ 1.03
TFDP1-201ENST00000375370 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.033e-9■■■■■ 31.5
TFDP1-201ENST00000375370 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.46■■□□□ 1.03
TFDP1-201ENST00000375370 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
TFDP1-201ENST00000375370 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.44■■□□□ 1.02
TFDP1-201ENST00000375370 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.44■■□□□ 1.02
TFDP1-201ENST00000375370 MIER1Q8N108 512 aa21.42■■□□□ 1.02
TFDP1-201ENST00000375370 SAMD9Q5K651 1589 aa21.41■■□□□ 1.02
TFDP1-201ENST00000375370 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.4■■□□□ 1.02
TFDP1-201ENST00000375370 MAPKBP1O60336 1514 aa21.4■■□□□ 1.02
TFDP1-201ENST00000375370 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.37■■□□□ 1.01
TFDP1-201ENST00000375370 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.36■■□□□ 1.01
TFDP1-201ENST00000375370 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
TFDP1-201ENST00000375370 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
TFDP1-201ENST00000375370 IFT140Q96RY7 1462 aa21.35■■□□□ 1.01
TFDP1-201ENST00000375370 FMN1Q68DA7 1419 aa21.35■■□□□ 1.01
TFDP1-201ENST00000375370 ERCC6Q03468 1493 aa21.35■■□□□ 1.01
TFDP1-201ENST00000375370 PBRM1Q86U86 1689 aa21.34■■□□□ 1.01
TFDP1-201ENST00000375370 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
TFDP1-201ENST00000375370 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.29■■□□□ 1
TFDP1-201ENST00000375370 GRIN2BQ13224 1484 aa21.28■■□□□ 1
TFDP1-201ENST00000375370 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.25■□□□□ 0.99
TFDP1-201ENST00000375370 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.23■□□□□ 0.99
TFDP1-201ENST00000375370 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
TFDP1-201ENST00000375370 ADAMTS12P58397 1594 aa21.22■□□□□ 0.99
TFDP1-201ENST00000375370 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
TFDP1-201ENST00000375370 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.18■□□□□ 0.98
TFDP1-201ENST00000375370 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
TFDP1-201ENST00000375370 PTPRKQ15262 1439 aa21.16■□□□□ 0.98
TFDP1-201ENST00000375370 NCOA2Q15596 1464 aa21.16■□□□□ 0.98
TFDP1-201ENST00000375370 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.16■□□□□ 0.98
TFDP1-201ENST00000375370 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.15■□□□□ 0.98
TFDP1-201ENST00000375370 IQGAP2Q13576 1575 aa21.13■□□□□ 0.97
TFDP1-201ENST00000375370 ARHGEF11O15085 1522 aa21.12■□□□□ 0.97
TFDP1-201ENST00000375370 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
TFDP1-201ENST00000375370 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.12■□□□□ 0.97
TFDP1-201ENST00000375370 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.12■□□□□ 0.97
TFDP1-201ENST00000375370 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.1■□□□□ 0.97
TFDP1-201ENST00000375370 HFM1A2PYH4 1435 aa21.07■□□□□ 0.96
TFDP1-201ENST00000375370 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.07■□□□□ 0.96
TFDP1-201ENST00000375370 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.06■□□□□ 0.96
TFDP1-201ENST00000375370 HECW1Q76N89 1606 aa21.05■□□□□ 0.96
TFDP1-201ENST00000375370 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
TFDP1-201ENST00000375370 NAIPQ13075 1403 aa21.03■□□□□ 0.96
TFDP1-201ENST00000375370 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
TFDP1-201ENST00000375370 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.01■□□□□ 0.95
TFDP1-201ENST00000375370 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
TFDP1-201ENST00000375370 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
TFDP1-201ENST00000375370 UACAQ9BZF9 1416 aa20.99■□□□□ 0.95
TFDP1-201ENST00000375370 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
TFDP1-201ENST00000375370 GRIN2AQ12879 1464 aa20.96■□□□□ 0.95
TFDP1-201ENST00000375370 SYNJ2O15056 1496 aa20.95■□□□□ 0.94
TFDP1-201ENST00000375370 DISP1Q96F81 1524 aa20.95■□□□□ 0.94
TFDP1-201ENST00000375370 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.93■□□□□ 0.94
TFDP1-201ENST00000375370 KIAA0556O60303 1618 aa20.93■□□□□ 0.94
TFDP1-201ENST00000375370 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.91■□□□□ 0.94
TFDP1-201ENST00000375370 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
TFDP1-201ENST00000375370 KDM6BO15054 1643 aa20.88■□□□□ 0.93
TFDP1-201ENST00000375370 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
TFDP1-201ENST00000375370 MIA2Q96PC5 1412 aa20.87■□□□□ 0.93
TFDP1-201ENST00000375370 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.86■□□□□ 0.93
TFDP1-201ENST00000375370 ARID3CA6NKF2 412 aa20.86■□□□□ 0.93
TFDP1-201ENST00000375370 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
TFDP1-201ENST00000375370 CEP170Q5SW79 1584 aa20.85■□□□□ 0.93
TFDP1-201ENST00000375370 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.85■□□□□ 0.93
TFDP1-201ENST00000375370 AKNAQ7Z591 1439 aa20.84■□□□□ 0.93
TFDP1-201ENST00000375370 NUP160Q12769 1436 aa20.83■□□□□ 0.93
TFDP1-201ENST00000375370 KCNH8Q96L42 1107 aa20.83■□□□□ 0.93
TFDP1-201ENST00000375370 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.83■□□□□ 0.93
TFDP1-201ENST00000375370 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.82■□□□□ 0.92
TFDP1-201ENST00000375370 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
TFDP1-201ENST00000375370 TONSLQ96HA7 1378 aa20.82■□□□□ 0.92
TFDP1-201ENST00000375370 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
TFDP1-201ENST00000375370 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
TFDP1-201ENST00000375370 DAPK1P53355 1430 aa20.73■□□□□ 0.91
TFDP1-201ENST00000375370 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
TFDP1-201ENST00000375370 ABCC5O15440 1437 aa20.72■□□□□ 0.91
TFDP1-201ENST00000375370 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
TFDP1-201ENST00000375370 CHD1O14646 1710 aa20.7■□□□□ 0.9
TFDP1-201ENST00000375370 ROCK1Q13464 1354 aa20.7■□□□□ 0.9
TFDP1-201ENST00000375370 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms