RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366672.4

GALNT2-201, Transcript of polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GALNT2, Length 4,454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT2-201ENST00000366672 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.3■■□□□ 1.64
GALNT2-201ENST00000366672 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.3■■□□□ 1.64
GALNT2-201ENST00000366672 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.28■■□□□ 1.64
GALNT2-201ENST00000366672 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.28■■□□□ 1.642e-6■□□□□ 8.5
GALNT2-201ENST00000366672 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.28■■□□□ 1.64
GALNT2-201ENST00000366672 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.643e-9■■■■■ 28.4
GALNT2-201ENST00000366672 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.27■■□□□ 1.64
GALNT2-201ENST00000366672 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.25■■□□□ 1.63
GALNT2-201ENST00000366672 MIER1Q8N108 512 aa25.25■■□□□ 1.63
GALNT2-201ENST00000366672 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.23■■□□□ 1.63
GALNT2-201ENST00000366672 SMARCA4P51532 1647 aa25.23■■□□□ 1.63
GALNT2-201ENST00000366672 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.22■■□□□ 1.63
GALNT2-201ENST00000366672 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
GALNT2-201ENST00000366672 FKBP8Q14318 412 aa25.21■■□□□ 1.63
GALNT2-201ENST00000366672 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
GALNT2-201ENST00000366672 TMC1Q8TDI8 760 aa25.18■■□□□ 1.62
GALNT2-201ENST00000366672 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
GALNT2-201ENST00000366672 MRS2Q9HD23 443 aa25.12■■□□□ 1.61
GALNT2-201ENST00000366672 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
GALNT2-201ENST00000366672 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
GALNT2-201ENST00000366672 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
GALNT2-201ENST00000366672 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
GALNT2-201ENST00000366672 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.04■■□□□ 1.6
GALNT2-201ENST00000366672 RGL3Q3MIN7 710 aa25.02■■□□□ 1.6
GALNT2-201ENST00000366672 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
GALNT2-201ENST00000366672 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25■■□□□ 1.59
GALNT2-201ENST00000366672 SLC24A1O60721 1099 aa24.98■■□□□ 1.59
GALNT2-201ENST00000366672 FMN1Q68DA7 1419 aa24.98■■□□□ 1.59
GALNT2-201ENST00000366672 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
GALNT2-201ENST00000366672 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.95■■□□□ 1.58
GALNT2-201ENST00000366672 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.94■■□□□ 1.58
GALNT2-201ENST00000366672 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.58
GALNT2-201ENST00000366672 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.92■■□□□ 1.58
GALNT2-201ENST00000366672 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.92■■□□□ 1.58
GALNT2-201ENST00000366672 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.91■■□□□ 1.58
GALNT2-201ENST00000366672 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.88■■□□□ 1.57
GALNT2-201ENST00000366672 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.85■■□□□ 1.57
GALNT2-201ENST00000366672 CDCA8Q53HL2 280 aa24.84■■□□□ 1.57
GALNT2-201ENST00000366672 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.81■■□□□ 1.56
GALNT2-201ENST00000366672 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
GALNT2-201ENST00000366672 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.8■■□□□ 1.56
GALNT2-201ENST00000366672 BCL11AQ9H165 835 aa24.79■■□□□ 1.56
GALNT2-201ENST00000366672 NCAPD3P42695 1498 aa24.77■■□□□ 1.56
GALNT2-201ENST00000366672 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
GALNT2-201ENST00000366672 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.75■■□□□ 1.55
GALNT2-201ENST00000366672 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.74■■□□□ 1.55
GALNT2-201ENST00000366672 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
GALNT2-201ENST00000366672 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.71■■□□□ 1.55
GALNT2-201ENST00000366672 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.67■■□□□ 1.54
GALNT2-201ENST00000366672 JPH4Q96JJ6 628 aa24.65■■□□□ 1.54
GALNT2-201ENST00000366672 PKD2Q13563 968 aa24.64■■□□□ 1.54
GALNT2-201ENST00000366672 IGF1RP08069 1367 aa24.64■■□□□ 1.53
GALNT2-201ENST00000366672 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.62■■□□□ 1.53
GALNT2-201ENST00000366672 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
GALNT2-201ENST00000366672 KANK1Q14678 1352 aa24.62■■□□□ 1.53
GALNT2-201ENST00000366672 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.61■■□□□ 1.53
GALNT2-201ENST00000366672 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
GALNT2-201ENST00000366672 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
GALNT2-201ENST00000366672 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.58■■□□□ 1.53
GALNT2-201ENST00000366672 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
GALNT2-201ENST00000366672 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.58■■□□□ 1.53
GALNT2-201ENST00000366672 CFAP53Q96M91 514 aa24.58■■□□□ 1.52
GALNT2-201ENST00000366672 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.55■■□□□ 1.52
GALNT2-201ENST00000366672 FOXD1Q16676 465 aa24.54■■□□□ 1.52
GALNT2-201ENST00000366672 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.53■■□□□ 1.52
GALNT2-201ENST00000366672 NUP155O75694 1391 aa24.53■■□□□ 1.52
GALNT2-201ENST00000366672 TMF1P82094 1093 aa24.52■■□□□ 1.52
GALNT2-201ENST00000366672 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
GALNT2-201ENST00000366672 CCER2I3L3R5 266 aa24.49■■□□□ 1.51
GALNT2-201ENST00000366672 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.48■■□□□ 1.51
GALNT2-201ENST00000366672 POGKQ9P215 609 aa24.47■■□□□ 1.51
GALNT2-201ENST00000366672 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
GALNT2-201ENST00000366672 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.44■■□□□ 1.5
GALNT2-201ENST00000366672 GGT6Q6P531 493 aa24.43■■□□□ 1.5
GALNT2-201ENST00000366672 CFTRP13569 1480 aa24.42■■□□□ 1.5
GALNT2-201ENST00000366672 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.42■■□□□ 1.51e-6■■■■■ 27.8
GALNT2-201ENST00000366672 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.4■■□□□ 1.5
GALNT2-201ENST00000366672 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.39■■□□□ 1.49
GALNT2-201ENST00000366672 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
GALNT2-201ENST00000366672 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
GALNT2-201ENST00000366672 NUDCQ9Y266 331 aa24.37■■□□□ 1.49
GALNT2-201ENST00000366672 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
GALNT2-201ENST00000366672 C14orf37Q86TY3 774 aa24.37■■□□□ 1.49
GALNT2-201ENST00000366672 PTPRGP23470 1445 aa24.35■■□□□ 1.49
GALNT2-201ENST00000366672 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
GALNT2-201ENST00000366672 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.33■■□□□ 1.49
GALNT2-201ENST00000366672 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
GALNT2-201ENST00000366672 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
GALNT2-201ENST00000366672 KIF3BO15066 747 aa24.31■■□□□ 1.48
GALNT2-201ENST00000366672 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.31■■□□□ 1.48
GALNT2-201ENST00000366672 NEUROD2Q15784 382 aa24.29■■□□□ 1.48
GALNT2-201ENST00000366672 MLECQ14165 292 aa24.29■■□□□ 1.48
GALNT2-201ENST00000366672 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.29■■□□□ 1.48
GALNT2-201ENST00000366672 KIF21BO75037 1637 aa24.28■■□□□ 1.48
GALNT2-201ENST00000366672 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
GALNT2-201ENST00000366672 HMGXB3Q12766 1538 aa24.27■■□□□ 1.48
GALNT2-201ENST00000366672 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
GALNT2-201ENST00000366672 SYNJ1O43426 1573 aa24.25■■□□□ 1.47
GALNT2-201ENST00000366672 NBR1Q14596 966 aa24.25■■□□□ 1.47
GALNT2-201ENST00000366672 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.24■■□□□ 1.47
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