RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366472.5

SH3BP5L-201, Transcript of SH3 binding domain protein 5 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP5L, Length 3,861 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5L-201ENST00000366472 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5L-201ENST00000366472 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SH3BP5L-201ENST00000366472 CFTRP13569 1480 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP5L-201ENST00000366472 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP5L-201ENST00000366472 CUX2O14529 1486 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP5L-201ENST00000366472 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
SH3BP5L-201ENST00000366472 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SH3BP5L-201ENST00000366472 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP5L-201ENST00000366472 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP5L-201ENST00000366472 NBR1Q14596 966 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP5L-201ENST00000366472 KIF27Q86VH2 1401 aa20.02■□□□□ 0.79
SH3BP5L-201ENST00000366472 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SH3BP5L-201ENST00000366472 EEA1Q15075 1411 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP5L-201ENST00000366472 VPS8Q8N3P4 1428 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP5L-201ENST00000366472 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP5L-201ENST00000366472 FAM9BQ8IZU0 186 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP5L-201ENST00000366472 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.92■□□□□ 0.786e-7■■■■■ 28
SH3BP5L-201ENST00000366472 SYNJ1O43426 1573 aa19.9■□□□□ 0.78
SH3BP5L-201ENST00000366472 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP5L-201ENST00000366472 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP5L-201ENST00000366472 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP5L-201ENST00000366472 CUX1P39880 1505 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP5L-201ENST00000366472 TOPBP1Q92547 1522 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP5L-201ENST00000366472 MRC2Q9UBG0 1479 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP5L-201ENST00000366472 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP5L-201ENST00000366472 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5L-201ENST00000366472 CCNB3Q8WWL7 1395 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5L-201ENST00000366472 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5L-201ENST00000366472 TONSLQ96HA7 1378 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5L-201ENST00000366472 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP5L-201ENST00000366472 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
SH3BP5L-201ENST00000366472 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
SH3BP5L-201ENST00000366472 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
SH3BP5L-201ENST00000366472 CHIC2Q9UKJ5 165 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP5L-201ENST00000366472 MSH5O43196 834 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP5L-201ENST00000366472 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP5L-201ENST00000366472 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
SH3BP5L-201ENST00000366472 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP5L-201ENST00000366472 DEKP35659 375 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
SH3BP5L-201ENST00000366472 IGF1RP08069 1367 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP5L-201ENST00000366472 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
SH3BP5L-201ENST00000366472 MRS2Q9HD23 443 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP5L-201ENST00000366472 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
SH3BP5L-201ENST00000366472 DNMBPQ6XZF7 1577 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP5L-201ENST00000366472 MYT1LQ9UL68 1186 aa19.65■□□□□ 0.74
SH3BP5L-201ENST00000366472 TOP2BQ02880 1626 aa19.64■□□□□ 0.74
SH3BP5L-201ENST00000366472 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP5L-201ENST00000366472 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
SH3BP5L-201ENST00000366472 KIF21BO75037 1637 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP5L-201ENST00000366472 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
SH3BP5L-201ENST00000366472 CCDC136Q96JN2 1154 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP5L-201ENST00000366472 CCER2I3L3R5 266 aa19.58■□□□□ 0.73
SH3BP5L-201ENST00000366472 SETD5Q9C0A6 1442 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP5L-201ENST00000366472 IFT140Q96RY7 1462 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP5L-201ENST00000366472 JPH4Q96JJ6 628 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP5L-201ENST00000366472 PPP4R2Q9NY27 417 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP5L-201ENST00000366472 OSCARQ8IYS5 282 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP5L-201ENST00000366472 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
SH3BP5L-201ENST00000366472 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
SH3BP5L-201ENST00000366472 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP19.51■□□□□ 0.71
SH3BP5L-201ENST00000366472 FOXD1Q16676 465 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP5L-201ENST00000366472 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
SH3BP5L-201ENST00000366472 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.49■□□□□ 0.71
SH3BP5L-201ENST00000366472 GRIN2BQ13224 1484 aa19.49■□□□□ 0.71
SH3BP5L-201ENST00000366472 CYB5RLQ6IPT4 315 aa19.49■□□□□ 0.71
SH3BP5L-201ENST00000366472 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
SH3BP5L-201ENST00000366472 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
SH3BP5L-201ENST00000366472 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP19.47■□□□□ 0.71
SH3BP5L-201ENST00000366472 ARAP1Q96P48 1450 aa19.46■□□□□ 0.71
SH3BP5L-201ENST00000366472 CCDC184Q52MB2 194 aa19.46■□□□□ 0.71
SH3BP5L-201ENST00000366472 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
SH3BP5L-201ENST00000366472 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.43■□□□□ 0.7
SH3BP5L-201ENST00000366472 WDR97A6NE52 1622 aa19.43■□□□□ 0.7
SH3BP5L-201ENST00000366472 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
SH3BP5L-201ENST00000366472 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
SH3BP5L-201ENST00000366472 FHOD3Q2V2M9 1422 aa19.42■□□□□ 0.7
SH3BP5L-201ENST00000366472 FANCIQ9NVI1 1328 aa19.4■□□□□ 0.7
SH3BP5L-201ENST00000366472 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP5L-201ENST00000366472 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
SH3BP5L-201ENST00000366472 MTUS2Q5JR59 1369 aa19.37■□□□□ 0.69
SH3BP5L-201ENST00000366472 PHLDB1Q86UU1 1377 aa19.36■□□□□ 0.69
SH3BP5L-201ENST00000366472 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.36■□□□□ 0.69
SH3BP5L-201ENST00000366472 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.69
SH3BP5L-201ENST00000366472 TMC1Q8TDI8 760 aa19.33■□□□□ 0.69
SH3BP5L-201ENST00000366472 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
SH3BP5L-201ENST00000366472 WDR62O43379 1518 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP5L-201ENST00000366472 PLEKHD1A6NEE1 506 aa19.3■□□□□ 0.68
SH3BP5L-201ENST00000366472 TRHP20396 242 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
SH3BP5L-201ENST00000366472 NEFMP07197 916 aa19.29■□□□□ 0.68
SH3BP5L-201ENST00000366472 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP5L-201ENST00000366472 PRXQ9BXM0 1461 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP5L-201ENST00000366472 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP5L-201ENST00000366472 PRDM2Q13029 1718 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP5L-201ENST00000366472 WASHC2AQ641Q2 1341 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP5L-201ENST00000366472 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP5L-201ENST00000366472 L3MBTL2Q969R5 705 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP5L-201ENST00000366472 ARXQ96QS3 562 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BP5L-201ENST00000366472 IL27Q8NEV9 243 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP5L-201ENST00000366472 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
SH3BP5L-201ENST00000366472 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa19.21■□□□□ 0.67
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