RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366472.5

SH3BP5L-201, Transcript of SH3 binding domain protein 5 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP5L, Length 3,861 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5L-201ENST00000366472 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.36■■□□□ 1.97
SH3BP5L-201ENST00000366472 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP5L-201ENST00000366472 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
SH3BP5L-201ENST00000366472 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP5L-201ENST00000366472 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.87■■□□□ 1.41
SH3BP5L-201ENST00000366472 ABCC9O60706 1549 aa23.8■■□□□ 1.4
SH3BP5L-201ENST00000366472 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SH3BP5L-201ENST00000366472 HRCP23327 699 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP5L-201ENST00000366472 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP5L-201ENST00000366472 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP5L-201ENST00000366472 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP5L-201ENST00000366472 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP5L-201ENST00000366472 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
SH3BP5L-201ENST00000366472 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SH3BP5L-201ENST00000366472 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP5L-201ENST00000366472 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SH3BP5L-201ENST00000366472 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SH3BP5L-201ENST00000366472 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SH3BP5L-201ENST00000366472 SCRIBQ14160 1630 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP5L-201ENST00000366472 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5L-201ENST00000366472 TRIM41Q8WV44 630 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP5L-201ENST00000366472 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP5L-201ENST00000366472 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP5L-201ENST00000366472 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BP5L-201ENST00000366472 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP5L-201ENST00000366472 NACADO15069 1562 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP5L-201ENST00000366472 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SH3BP5L-201ENST00000366472 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SH3BP5L-201ENST00000366472 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5L-201ENST00000366472 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5L-201ENST00000366472 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP5L-201ENST00000366472 NEUROD1Q13562 356 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP5L-201ENST00000366472 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SH3BP5L-201ENST00000366472 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5L-201ENST00000366472 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SH3BP5L-201ENST00000366472 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP5L-201ENST00000366472 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SH3BP5L-201ENST00000366472 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
SH3BP5L-201ENST00000366472 MYT1Q01538 1121 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP5L-201ENST00000366472 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SH3BP5L-201ENST00000366472 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP5L-201ENST00000366472 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
SH3BP5L-201ENST00000366472 APLP2Q06481 763 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP5L-201ENST00000366472 MIER1Q8N108 512 aa21.24■□□□□ 0.99
SH3BP5L-201ENST00000366472 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP5L-201ENST00000366472 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP5L-201ENST00000366472 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
SH3BP5L-201ENST00000366472 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP5L-201ENST00000366472 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
SH3BP5L-201ENST00000366472 BCANQ96GW7 911 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BP5L-201ENST00000366472 WIZO95785 1651 aa21.08■□□□□ 0.97
SH3BP5L-201ENST00000366472 ITGAEP38570 1179 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP5L-201ENST00000366472 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
SH3BP5L-201ENST00000366472 SMARCA4P51532 1647 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP5L-201ENST00000366472 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.96■□□□□ 0.95
SH3BP5L-201ENST00000366472 SMARCA2P51531 1590 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP5L-201ENST00000366472 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP5L-201ENST00000366472 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BP5L-201ENST00000366472 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP5L-201ENST00000366472 CEP162Q5TB80 1403 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP5L-201ENST00000366472 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
SH3BP5L-201ENST00000366472 FBLN2P98095 1184 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP5L-201ENST00000366472 NEFLP07196 543 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP5L-201ENST00000366472 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
SH3BP5L-201ENST00000366472 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
SH3BP5L-201ENST00000366472 NCAPD3P42695 1498 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP5L-201ENST00000366472 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP5L-201ENST00000366472 ERCC6Q03468 1493 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP5L-201ENST00000366472 FKBP8Q14318 412 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP5L-201ENST00000366472 SOGA1O94964 1423 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP5L-201ENST00000366472 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SH3BP5L-201ENST00000366472 NESP48681 1621 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP5L-201ENST00000366472 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP5L-201ENST00000366472 TRIM52Q96A61 297 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP5L-201ENST00000366472 KCNH8Q96L42 1107 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP5L-201ENST00000366472 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SH3BP5L-201ENST00000366472 ABCC8Q09428 1581 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP5L-201ENST00000366472 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP5L-201ENST00000366472 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SH3BP5L-201ENST00000366472 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP5L-201ENST00000366472 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.86
SH3BP5L-201ENST00000366472 BCL11AQ9H165 835 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP5L-201ENST00000366472 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP5L-201ENST00000366472 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SH3BP5L-201ENST00000366472 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP5L-201ENST00000366472 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5L-201ENST00000366472 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5L-201ENST00000366472 CLIP1P30622 1438 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP5L-201ENST00000366472 HMGXB3Q12766 1538 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP5L-201ENST00000366472 P3H3Q8IVL6 736 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP5L-201ENST00000366472 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP5L-201ENST00000366472 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SH3BP5L-201ENST00000366472 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP5L-201ENST00000366472 ANP32CO43423 234 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP5L-201ENST00000366472 ARID3CA6NKF2 412 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP5L-201ENST00000366472 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP5L-201ENST00000366472 GOLGA3Q08378 1498 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5L-201ENST00000366472 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5L-201ENST00000366472 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5L-201ENST00000366472 CLSPNQ9HAW4 1339 aa20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.5 ms