RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361201.8

CSAG4-201, Transcript of CSAG family member 4 (pseudogene), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CSAG4, Length 755 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG4-201ENST00000361201 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.58■□□□□ 0.56
CSAG4-201ENST00000361201 TSPOAP1O95153 1857 aa18.56■□□□□ 0.56
CSAG4-201ENST00000361201 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
CSAG4-201ENST00000361201 ADAMTS12P58397 1594 aa18.55■□□□□ 0.56
CSAG4-201ENST00000361201 ADCY10Q96PN6 1610 aa18.52■□□□□ 0.55
CSAG4-201ENST00000361201 JPH4Q96JJ6 628 aa18.49■□□□□ 0.55
CSAG4-201ENST00000361201 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.55
CSAG4-201ENST00000361201 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.54
CSAG4-201ENST00000361201 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.44■□□□□ 0.54
CSAG4-201ENST00000361201 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CSAG4-201ENST00000361201 LMTK3Q96Q04 1460 aa18.39■□□□□ 0.54
CSAG4-201ENST00000361201 ILDR2Q71H61 639 aa18.35■□□□□ 0.53
CSAG4-201ENST00000361201 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa18.32■□□□□ 0.52
CSAG4-201ENST00000361201 SOCS7O14512 581 aa18.3■□□□□ 0.52
CSAG4-201ENST00000361201 GLI2P10070 1586 aa18.3■□□□□ 0.52
CSAG4-201ENST00000361201 ERICH3Q5RHP9 1530 aa18.28■□□□□ 0.52
CSAG4-201ENST00000361201 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP18.25■□□□□ 0.51
CSAG4-201ENST00000361201 ASXL2Q76L83 1435 aa18.22■□□□□ 0.51
CSAG4-201ENST00000361201 TOP2BQ02880 1626 aa18.2■□□□□ 0.5
CSAG4-201ENST00000361201 PLB1Q6P1J6 1458 aa18.17■□□□□ 0.5
CSAG4-201ENST00000361201 ABCC2Q92887 1545 aa18.17■□□□□ 0.5
CSAG4-201ENST00000361201 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa18.16■□□□□ 0.5
CSAG4-201ENST00000361201 PTPRGP23470 1445 aa18.12■□□□□ 0.49
CSAG4-201ENST00000361201 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
CSAG4-201ENST00000361201 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa18.12■□□□□ 0.49
CSAG4-201ENST00000361201 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa18.11■□□□□ 0.49
CSAG4-201ENST00000361201 DISP3Q9P2K9 1392 aa18.08■□□□□ 0.49
CSAG4-201ENST00000361201 CUL7Q14999 1698 aa18.08■□□□□ 0.48
CSAG4-201ENST00000361201 TEX14Q8IWB6 1497 aa18.07■□□□□ 0.48
CSAG4-201ENST00000361201 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa18.04■□□□□ 0.48
CSAG4-201ENST00000361201 PTPRMP28827 1452 aa18.03■□□□□ 0.48
CSAG4-201ENST00000361201 KIF21BO75037 1637 aa18.02■□□□□ 0.48
CSAG4-201ENST00000361201 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
CSAG4-201ENST00000361201 TNIKQ9UKE5 1360 aa18■□□□□ 0.47
CSAG4-201ENST00000361201 KDM5BQ9UGL1 1544 aa17.99■□□□□ 0.47
CSAG4-201ENST00000361201 CHIC1Q5VXU3 224 aa17.99■□□□□ 0.47
CSAG4-201ENST00000361201 CERKQ8TCT0 537 aa17.99■□□□□ 0.47
CSAG4-201ENST00000361201 ADAMTSL3P82987 1691 aa17.99■□□□□ 0.47
CSAG4-201ENST00000361201 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
CSAG4-201ENST00000361201 UACAQ9BZF9 1416 aa17.97■□□□□ 0.47
CSAG4-201ENST00000361201 IGF1RP08069 1367 aa17.91■□□□□ 0.46
CSAG4-201ENST00000361201 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa17.91■□□□□ 0.46
CSAG4-201ENST00000361201 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
CSAG4-201ENST00000361201 HSPA2P54652 639 aa17.87■□□□□ 0.45
CSAG4-201ENST00000361201 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa17.87■□□□□ 0.45
CSAG4-201ENST00000361201 DISP1Q96F81 1524 aa17.86■□□□□ 0.45
CSAG4-201ENST00000361201 CD109Q6YHK3 1445 aa17.85■□□□□ 0.45
CSAG4-201ENST00000361201 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa17.85■□□□□ 0.45
CSAG4-201ENST00000361201 WDR7Q9Y4E6 1490 aa17.84■□□□□ 0.45
CSAG4-201ENST00000361201 ARAP3Q8WWN8 1544 aa17.82■□□□□ 0.44
CSAG4-201ENST00000361201 MADDQ8WXG6 1647 aa17.81■□□□□ 0.44
CSAG4-201ENST00000361201 BCORL1Q5H9F3 1711 aa17.81■□□□□ 0.44
CSAG4-201ENST00000361201 CFAP43Q8NDM7 1665 aa17.8■□□□□ 0.44
CSAG4-201ENST00000361201 IQGAP2Q13576 1575 aa17.75■□□□□ 0.43
CSAG4-201ENST00000361201 KCNH8Q96L42 1107 aa17.73■□□□□ 0.43
CSAG4-201ENST00000361201 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa17.69■□□□□ 0.42
CSAG4-201ENST00000361201 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
CSAG4-201ENST00000361201 RAPGEF3O95398 923 aa17.69■□□□□ 0.42
CSAG4-201ENST00000361201 KIF27Q86VH2 1401 aa17.66■□□□□ 0.42
CSAG4-201ENST00000361201 UGGT2Q9NYU1 1516 aa17.66■□□□□ 0.42
CSAG4-201ENST00000361201 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa17.64■□□□□ 0.41
CSAG4-201ENST00000361201 KIAA0556O60303 1618 aa17.64■□□□□ 0.41
CSAG4-201ENST00000361201 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
CSAG4-201ENST00000361201 STRCQ7RTU9 1775 aa17.59■□□□□ 0.41
CSAG4-201ENST00000361201 ABCA8O94911 1581 aa17.59■□□□□ 0.41
CSAG4-201ENST00000361201 PHLDB1Q86UU1 1377 aa17.59■□□□□ 0.41
CSAG4-201ENST00000361201 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa17.58■□□□□ 0.4
CSAG4-201ENST00000361201 PLPPR3Q6T4P5 718 aa17.57■□□□□ 0.4
CSAG4-201ENST00000361201 YEATS2Q9ULM3 1422 aa17.55■□□□□ 0.4
CSAG4-201ENST00000361201 ABCA9Q8IUA7 1624 aa17.53■□□□□ 0.4
CSAG4-201ENST00000361201 NEO1Q92859 1461 aa17.51■□□□□ 0.39
CSAG4-201ENST00000361201 LTBP4Q8N2S1 1624 aa17.51■□□□□ 0.39
CSAG4-201ENST00000361201 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa17.51■□□□□ 0.39
CSAG4-201ENST00000361201 TTC37Q6PGP7 1564 aa17.48■□□□□ 0.39
CSAG4-201ENST00000361201 DMRT2Q9Y5R5 561 aa17.47■□□□□ 0.39
CSAG4-201ENST00000361201 ATP10BO94823 1461 aa17.46■□□□□ 0.39
CSAG4-201ENST00000361201 PREX1Q8TCU6 1659 aa17.45■□□□□ 0.38
CSAG4-201ENST00000361201 RICTORQ6R327 1708 aa17.44■□□□□ 0.38
CSAG4-201ENST00000361201 IQSEC2Q5JU85 1478 aa17.44■□□□□ 0.38
CSAG4-201ENST00000361201 PTPRTO14522 1441 aa17.42■□□□□ 0.38
CSAG4-201ENST00000361201 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
CSAG4-201ENST00000361201 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
CSAG4-201ENST00000361201 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa17.4■□□□□ 0.38
CSAG4-201ENST00000361201 FHOD3Q2V2M9 1422 aa17.4■□□□□ 0.38
CSAG4-201ENST00000361201 POGZQ7Z3K3 1410 aa17.4■□□□□ 0.38
CSAG4-201ENST00000361201 FANCAO15360 1455 aa17.4■□□□□ 0.38
CSAG4-201ENST00000361201 ARID3CA6NKF2 412 aa17.4■□□□□ 0.38
CSAG4-201ENST00000361201 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa17.39■□□□□ 0.37
CSAG4-201ENST00000361201 MLECQ14165 292 aa17.38■□□□□ 0.37
CSAG4-201ENST00000361201 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
CSAG4-201ENST00000361201 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa17.37■□□□□ 0.37
CSAG4-201ENST00000361201 AKNAQ7Z591 1439 aa17.36■□□□□ 0.37
CSAG4-201ENST00000361201 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa17.35■□□□□ 0.37
CSAG4-201ENST00000361201 GOLGA3Q08378 1498 aa17.32■□□□□ 0.36
CSAG4-201ENST00000361201 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa17.31■□□□□ 0.36
CSAG4-201ENST00000361201 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
CSAG4-201ENST00000361201 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
CSAG4-201ENST00000361201 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa17.29■□□□□ 0.36
CSAG4-201ENST00000361201 EFCAB5A4FU69 1503 aa17.28■□□□□ 0.36
CSAG4-201ENST00000361201 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.4 ms